| 摘要 | 第8-11页 |
| Abstract | 第11-15页 |
| 缩略词表 | 第16-17页 |
| 第一章 绪论 | 第17-35页 |
| 1.1 植物细胞壁多糖组分及其合成酶系 | 第17-23页 |
| 1.1.1 植物细胞壁结构组成 | 第18-19页 |
| 1.1.2 植物细胞壁多糖合成酶系 | 第19-23页 |
| 1.2 植物生物质高效降解者:丝状真菌 | 第23-28页 |
| 1.2.1 丝状真菌营养方式类型 | 第23-24页 |
| 1.2.2 丝状真菌基因组中木质纤维素降解酶基因 | 第24-28页 |
| 1.3 丝状真菌木质纤维素降解酶基因转录表达 | 第28-31页 |
| 1.3.1 转录组学研究 | 第28-29页 |
| 1.3.2 蛋白质组学研究 | 第29-30页 |
| 1.3.3 代谢组学研究 | 第30-31页 |
| 1.4 丝状真菌糖转运蛋白研究 | 第31-32页 |
| 1.5 丝状真菌胞内代谢途径研究 | 第32页 |
| 1.6 丝状真菌生物质多糖降解酶基因表达调控 | 第32-34页 |
| 1.6.1 木质纤维素降解酶基因的直接转录调控 | 第32-33页 |
| 1.6.2 上游营养感知途径调控木质纤维素酶基因转录 | 第33-34页 |
| 1.7 立题依据 | 第34-35页 |
| 第二章 比较基因组学探究子囊真菌生物质多糖降解酶系差异 | 第35-51页 |
| 2.1 材料与方法 | 第35-37页 |
| 2.1.1 基因组数据获取 | 第35页 |
| 2.1.2 重要菌株系统发育进化树构建 | 第35-36页 |
| 2.1.3 黑曲霉An-76基因组扫描测序 | 第36-37页 |
| 2.2 结果与分析 | 第37-47页 |
| 2.2.1 重要菌株系统发育进化树分析及生物质多糖降解酶统计比较 | 第37-39页 |
| 2.2.2 生物质多糖降解酶家族分布分析 | 第39-46页 |
| 2.2.3 黑曲霉An-76基因组中木质纤维素降解酶种类及数量 | 第46-47页 |
| 2.3 小结与讨论 | 第47-51页 |
| 第三章 限制性条件下黑曲霉、里氏木霉及草酸青霉分泌组比较分析 | 第51-71页 |
| 3.1 材料与方法 | 第51-55页 |
| 3.1.1 菌株和培养基 | 第51-52页 |
| 3.1.2 主要仪器设备 | 第52页 |
| 3.1.3 固体培养和样品制备方法 | 第52页 |
| 3.1.4 胞外蛋白、还原糖及酶活测定 | 第52-53页 |
| 3.1.5 荧光辅助糖电泳测定胞外还原糖种类及浓度变化 | 第53页 |
| 3.1.6 SDS-PAGE分析蛋白种类 | 第53页 |
| 3.1.7 活性电泳检测同工酶酶谱变化 | 第53-54页 |
| 3.1.8 高压液相色谱-二级串联质谱(LC-MS/MS)检测分泌组 | 第54页 |
| 3.1.9 数据库搜索与生物信息学分析 | 第54-55页 |
| 3.2 结果与分析 | 第55-69页 |
| 3.2.1 定量测定胞外还原糖、蛋白浓度以及糖苷水解酶酶活变化 | 第55-57页 |
| 3.2.2 内切纤维素酶、木聚糖酶和β-葡萄糖苷酶动态酶谱展示 | 第57-59页 |
| 3.2.3 三株菌分泌组中木质纤维素降解酶分析 | 第59-69页 |
| 3.3 小结与讨论 | 第69-71页 |
| 第四章 胞外糖代谢组学定量分析方法的建立 | 第71-91页 |
| 4.1 材料与方法 | 第71-75页 |
| 4.1.1 菌株与质粒 | 第71页 |
| 4.1.2 试剂及培养基 | 第71-72页 |
| 4.1.3 主要仪器设备 | 第72页 |
| 4.1.4 木聚糖酶分离纯化方法 | 第72-73页 |
| 4.1.5 木聚糖酶最适温度和最适pH测定 | 第73页 |
| 4.1.6 木聚糖酶酶解底物 | 第73-74页 |
| 4.1.7 荧光辅助糖电泳检测酶解产物谱 | 第74页 |
| 4.1.8 电喷雾质谱分析寡糖水解产物谱 | 第74-75页 |
| 4.2 结果与分析 | 第75-86页 |
| 4.2.1 木聚糖酶异源表达、分离和生化性质测定 | 第75-78页 |
| 4.2.2 FACE定量测定木寡糖浓度及酶解组分变化 | 第78-79页 |
| 4.2.3 FACE定量分析GH10和GH11家族木聚糖酶酶解寡糖谱变化 | 第79-81页 |
| 4.2.4 FACE分析木聚糖酶时间序列作用模式 | 第81-84页 |
| 4.2.5 不同木聚糖酶组分在木聚糖降解中的协同作用 | 第84-86页 |
| 4.3 小结与讨论 | 第86-91页 |
| 第五章 整合功能组学研究黑曲霉高效木聚糖利用机制 | 第91-115页 |
| 5.1 材料与方法 | 第91-97页 |
| 5.1.1 菌株和培养基 | 第91-92页 |
| 5.1.2 主要仪器设备 | 第92页 |
| 5.1.3 菌丝获取方法 | 第92页 |
| 5.1.4 不同培养参数和酶活性测定 | 第92页 |
| 5.1.5 FACE测定胞外还原糖种类 | 第92-93页 |
| 5.1.6 活性电泳测定木聚糖酶同工酶酶谱 | 第93页 |
| 5.1.7 胞外、胞内及膜蛋白提取方法 | 第93页 |
| 5.1.8 LC-MS/MS检测胞外、胞内及膜蛋白 | 第93-94页 |
| 5.1.9 数据库搜索 | 第94页 |
| 5.1.10 RNA提取和cDNA合成 | 第94-95页 |
| 5.1.11 实时荧光定量PCR定量检测基因转录表达方法 | 第95-97页 |
| 5.2 结果与讨论 | 第97-111页 |
| 5.2.1 不同碳源条件下黑曲霉An-76培养参数优化 | 第97-99页 |
| 5.2.2 活性电泳展示不同碳源对黑曲霉An-76木聚糖酶同工酶表达影响 | 第99页 |
| 5.2.3 LC-MS/MS分析不同浓度木糖和木寡糖对胞外木聚糖降解酶表达影响 | 第99-104页 |
| 5.2.4 LC-MS/MS分析多种碳源诱导产生的胞外木聚糖降解酶系动态变化 | 第104-106页 |
| 5.2.5 糖转运蛋白表达量随时间和碳源种类变化 | 第106-107页 |
| 5.2.6 不同碳源诱导胞内糖代谢途径酶系表达差异 | 第107-111页 |
| 5.3 小结与讨论 | 第111-115页 |
| 第六章 黑曲霉An-76转录调控因子分析及XlnR异源表达 | 第115-125页 |
| 6.1 材料与方法 | 第115-117页 |
| 6.1.1 菌株、质粒和培养基 | 第115页 |
| 6.1.2 基因序列获取及进化树构建 | 第115-116页 |
| 6.1.3 表达质粒构建 | 第116页 |
| 6.1.4 质粒扩增 | 第116-117页 |
| 6.1.5 XlnR蛋白诱导表达 | 第117页 |
| 6.1.6 XlnR蛋白纯化 | 第117页 |
| 6.2 实验结果与分析 | 第117-123页 |
| 6.2.1 黑曲霉木聚糖降解酶基因转录调控区转录因子结合位点分析 | 第117-120页 |
| 6.2.2 黑曲霉An-76转录调控因子XlnR进化分析 | 第120-121页 |
| 6.2.3 黑曲霉An-76转录调控因子XlnR真菌特异性激活结构域异源表达 | 第121-123页 |
| 6.3 小结与讨论 | 第123-125页 |
| 全文总结与展望 | 第125-129页 |
| 参考文献 | 第129-143页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第143-145页 |
| 致谢 | 第145-147页 |
| 学位论文评阅及答辩情况表 | 第147页 |
