中文摘要 | 第3-5页 |
ABSTRACT | 第5-7页 |
缩略语表(Abbreviations) | 第8-11页 |
第一部分 文献综述 | 第11-19页 |
1 疱疹病毒miRNAs影响病毒的裂解/潜伏状态 | 第13-15页 |
2 疱疹病毒miRNAs影响细胞凋亡及细胞分化 | 第15页 |
3 疱疹病毒miRNAs影响肿瘤发生 | 第15-16页 |
4 疱疹病毒miRNAs影响免疫反应 | 第16-17页 |
5 疱疹病毒miRNAs的其他功能 | 第17页 |
6 展望 | 第17页 |
7 研究目的及意义 | 第17-19页 |
第二部分 试验研究 | 第19-58页 |
第一章 鸭肠炎病毒miRNAs靶基因的预测 | 第19-27页 |
1 数据来源及材料与方法 | 第19-20页 |
1.1 病毒microRNAs序列及病毒ORF和3’UTR序列 | 第19页 |
1.2 靶基因预测软件和功能分析软件 | 第19-20页 |
2 结果与分析 | 第20-25页 |
2.1 DEV miRNAs调节自身靶基因 | 第20-21页 |
2.2 DEV miRNAs调节宿主靶基因 | 第21-25页 |
2.2.1 DEV miRNAs调节超过900个宿主基因 | 第21-23页 |
2.2.2 功能分析DEV miRNAs的宿主靶基因 | 第23-25页 |
3 讨论 | 第25-26页 |
3.1 DEV miRNAs可能影响病毒的感染过程 | 第25-26页 |
3.2 DEV miRNAs可能参与多个细胞通路 | 第26页 |
4 结论 | 第26-27页 |
第二章 dev-miR-D13-5p靶基因的验证及其对靶基因转录水平和病毒增殖的影响 | 第27-58页 |
1 试验材料 | 第27-29页 |
1.1 病毒毒株及细菌菌株 | 第27页 |
1.2 鸭胚及细胞 | 第27页 |
1.3 质粒及mimic | 第27-28页 |
1.4 主要试剂、耗材及试剂配制 | 第28-29页 |
1.4.1 PCR扩增及克隆 | 第28页 |
1.4.2 细胞培养 | 第28-29页 |
1.5 RNA抽提及反转录、DEV DNA抽提 | 第29页 |
1.6 主要仪器 | 第29页 |
1.7 其他常用试验耗材 | 第29页 |
2 试验方法 | 第29-43页 |
2.1 初步验证dev-miR-D13-5p与靶基因的结合位点 | 第29-36页 |
2.1.1 dev-miR-D13-5p靶基因的预测 | 第29-30页 |
2.1.2 3’race扩增UL9 3’UTR | 第30-32页 |
2.1.3 靶基因双荧光报告载体野生型pmirGLO-UL8(wt)的构建 | 第32-33页 |
2.1.4 靶基因双荧光报告载体突变型pmirGLO-UL8(mut)的构建 | 第33-35页 |
2.1.5 双荧光素酶报告基因检测dev-miR-D13-5p是否与预测的靶点相互作用 | 第35-36页 |
2.2 初步探索dev-miR-D13-5p对靶基因mRNA水平的影响 | 第36-41页 |
2.2.1 真核表达载体pcDNA3.1(+)-UL8(ORD的构建 | 第36-38页 |
2.2.2 真核表达载体pcDNA3.1(+)-UL9(ORF+3’UTR)的构建 | 第38-39页 |
2.2.3 dev-miR-D13-5p对UL8和UL9 mRNA水平的影响 | 第39-41页 |
2.3 dev-miR-D13-5p对DEV感染DEF增殖的影响 | 第41-43页 |
2.3.1 绝对荧光定量PCR检测DEVDNA的拷贝数 | 第41-43页 |
2.3.2 dev-miR-D13-5p对DEV DNA增殖的影响 | 第43页 |
3 试验结果 | 第43-54页 |
3.1 初步验证dev-miR-D13-5p与靶基因的结合位点 | 第43-48页 |
3.1.1 dev-miR-D13-5p靶基因的预测 | 第43-44页 |
3.1.2 3’race扩增UL9 3’UTR | 第44页 |
3.1.3 靶基因双荧光报告载体野生型pmirGLO-UL8(wt)的构建 | 第44-46页 |
3.1.4 靶基因双荧光报告载体突变型pmirGLO-UL8(mut)的构建 | 第46-47页 |
3.1.5 双荧光素酶报告基因检测dev-miR-D13-5p是否与预测的靶点相互作用 | 第47-48页 |
3.2 初步探索dev-miR-D13-5p对靶基因mRNA水平的影响 | 第48-53页 |
3.2.1 真核表达载体pcDNA3.1(+)-UL8(ORF)的构建 | 第48-49页 |
3.2.2 真核表达载体pcDNA3.1(+)-UL9(ORF+3’UTR)的构建 | 第49-50页 |
3.2.3 dev-miR-D13-5p对UL8和UL9 mRNA水平的影响 | 第50-53页 |
3.3 初步研究dev-miR-D13-5p对DEV感染DEF增殖的影响 | 第53-54页 |
3.3.1 绝对荧光定量PCR检测DEV DNA的拷贝数 | 第53-54页 |
3.3.2 初步研究dev-miR-D13-5p对DEV DNA增殖的影响 | 第54页 |
4 讨论 | 第54-57页 |
5 结论 | 第57-58页 |
参考文献 | 第58-67页 |
致谢 | 第67-68页 |
攻读硕士学位期间完成的学术论文 | 第68页 |