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鸭肠炎病毒编码microRNAs靶基因的预测及dev-miR-D13-5p对病毒增殖影响的初步研究

中文摘要第3-5页
ABSTRACT第5-7页
缩略语表(Abbreviations)第8-11页
第一部分 文献综述第11-19页
    1 疱疹病毒miRNAs影响病毒的裂解/潜伏状态第13-15页
    2 疱疹病毒miRNAs影响细胞凋亡及细胞分化第15页
    3 疱疹病毒miRNAs影响肿瘤发生第15-16页
    4 疱疹病毒miRNAs影响免疫反应第16-17页
    5 疱疹病毒miRNAs的其他功能第17页
    6 展望第17页
    7 研究目的及意义第17-19页
第二部分 试验研究第19-58页
    第一章 鸭肠炎病毒miRNAs靶基因的预测第19-27页
        1 数据来源及材料与方法第19-20页
            1.1 病毒microRNAs序列及病毒ORF和3’UTR序列第19页
            1.2 靶基因预测软件和功能分析软件第19-20页
        2 结果与分析第20-25页
            2.1 DEV miRNAs调节自身靶基因第20-21页
            2.2 DEV miRNAs调节宿主靶基因第21-25页
                2.2.1 DEV miRNAs调节超过900个宿主基因第21-23页
                2.2.2 功能分析DEV miRNAs的宿主靶基因第23-25页
        3 讨论第25-26页
            3.1 DEV miRNAs可能影响病毒的感染过程第25-26页
            3.2 DEV miRNAs可能参与多个细胞通路第26页
        4 结论第26-27页
    第二章 dev-miR-D13-5p靶基因的验证及其对靶基因转录水平和病毒增殖的影响第27-58页
        1 试验材料第27-29页
            1.1 病毒毒株及细菌菌株第27页
            1.2 鸭胚及细胞第27页
            1.3 质粒及mimic第27-28页
            1.4 主要试剂、耗材及试剂配制第28-29页
                1.4.1 PCR扩增及克隆第28页
                1.4.2 细胞培养第28-29页
            1.5 RNA抽提及反转录、DEV DNA抽提第29页
            1.6 主要仪器第29页
            1.7 其他常用试验耗材第29页
        2 试验方法第29-43页
            2.1 初步验证dev-miR-D13-5p与靶基因的结合位点第29-36页
                2.1.1 dev-miR-D13-5p靶基因的预测第29-30页
                2.1.2 3’race扩增UL9 3’UTR第30-32页
                2.1.3 靶基因双荧光报告载体野生型pmirGLO-UL8(wt)的构建第32-33页
                2.1.4 靶基因双荧光报告载体突变型pmirGLO-UL8(mut)的构建第33-35页
                2.1.5 双荧光素酶报告基因检测dev-miR-D13-5p是否与预测的靶点相互作用第35-36页
            2.2 初步探索dev-miR-D13-5p对靶基因mRNA水平的影响第36-41页
                2.2.1 真核表达载体pcDNA3.1(+)-UL8(ORD的构建第36-38页
                2.2.2 真核表达载体pcDNA3.1(+)-UL9(ORF+3’UTR)的构建第38-39页
                2.2.3 dev-miR-D13-5p对UL8和UL9 mRNA水平的影响第39-41页
            2.3 dev-miR-D13-5p对DEV感染DEF增殖的影响第41-43页
                2.3.1 绝对荧光定量PCR检测DEVDNA的拷贝数第41-43页
                2.3.2 dev-miR-D13-5p对DEV DNA增殖的影响第43页
        3 试验结果第43-54页
            3.1 初步验证dev-miR-D13-5p与靶基因的结合位点第43-48页
                3.1.1 dev-miR-D13-5p靶基因的预测第43-44页
                3.1.2 3’race扩增UL9 3’UTR第44页
                3.1.3 靶基因双荧光报告载体野生型pmirGLO-UL8(wt)的构建第44-46页
                3.1.4 靶基因双荧光报告载体突变型pmirGLO-UL8(mut)的构建第46-47页
                3.1.5 双荧光素酶报告基因检测dev-miR-D13-5p是否与预测的靶点相互作用第47-48页
            3.2 初步探索dev-miR-D13-5p对靶基因mRNA水平的影响第48-53页
                3.2.1 真核表达载体pcDNA3.1(+)-UL8(ORF)的构建第48-49页
                3.2.2 真核表达载体pcDNA3.1(+)-UL9(ORF+3’UTR)的构建第49-50页
                3.2.3 dev-miR-D13-5p对UL8和UL9 mRNA水平的影响第50-53页
            3.3 初步研究dev-miR-D13-5p对DEV感染DEF增殖的影响第53-54页
                3.3.1 绝对荧光定量PCR检测DEV DNA的拷贝数第53-54页
                3.3.2 初步研究dev-miR-D13-5p对DEV DNA增殖的影响第54页
        4 讨论第54-57页
        5 结论第57-58页
参考文献第58-67页
致谢第67-68页
攻读硕士学位期间完成的学术论文第68页

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