| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 符号说明 | 第10-13页 |
| 1 文献综述 | 第13-31页 |
| 1.1 鸡肠道微生物研究进展 | 第13-18页 |
| 1.1.1 鸡肠道微生物组成结构 | 第13-14页 |
| 1.1.2 影响鸡肠道微生物菌落组成的因素 | 第14-15页 |
| 1.1.3 鸡肠道微生物区系的功能 | 第15-18页 |
| 1.2 肠道微生物功能益生菌的概念和发展 | 第18-22页 |
| 1.2.1 枯草芽孢杆菌 | 第19-20页 |
| 1.2.2 戊糖片球菌 | 第20页 |
| 1.2.3 植物乳杆菌 | 第20-21页 |
| 1.2.4 16S rDNA测序鉴定肠道微生物组成 | 第21-22页 |
| 1.3 鸡生长相关基因 | 第22-26页 |
| 1.3.1 生长激素基因 | 第23-24页 |
| 1.3.2 生长激素受体基因 | 第24-25页 |
| 1.3.3 胰岛素样生长因子1基因 | 第25-26页 |
| 1.4 鸡繁殖候选基因 | 第26-30页 |
| 1.4.1 极低密度脂蛋白受体 | 第26-28页 |
| 1.4.2 雌激素受体 | 第28-29页 |
| 1.4.3 催乳素受体基因 | 第29-30页 |
| 1.5 本试验的目的意义和主要研究内容 | 第30-31页 |
| 1.5.1 目的意义 | 第30页 |
| 1.5.2 主要研究内容 | 第30-31页 |
| 2 材料和方法 | 第31-44页 |
| 2.1 试验材料 | 第31-32页 |
| 2.1.1 试验群体 | 第31页 |
| 2.1.2 菌株 | 第31-32页 |
| 2.2 仪器和试剂 | 第32-34页 |
| 2.2.1 主要仪器设备 | 第32页 |
| 2.2.2 主要试剂及试剂盒 | 第32-33页 |
| 2.2.3 试剂的配制 | 第33-34页 |
| 2.3 试验方法 | 第34-44页 |
| 2.3.1 试验设计 | 第34页 |
| 2.3.2 菌株的液体培养 | 第34-35页 |
| 2.3.3 菌液添加量的优化 | 第35页 |
| 2.3.4 试验用鸡的饲喂 | 第35页 |
| 2.3.5 生长繁殖性能测定 | 第35页 |
| 2.3.6 蛋品质测定 | 第35-36页 |
| 2.3.7 肠道微生物DNA提取 | 第36-37页 |
| 2.3.8 样品16S rDNA的V4-V5区扩增 | 第37-38页 |
| 2.3.9 16S rDNA的V4-V5区测序 | 第38页 |
| 2.3.10 16S rDNA基因序列基础分析 | 第38-39页 |
| 2.3.11 基于16S rDNA基因的样品多样性分析 | 第39页 |
| 2.3.12 Total RNA提取 | 第39-40页 |
| 2.3.13 逆转录PCR | 第40-41页 |
| 2.3.14 荧光定量PCR条件优化 | 第41-43页 |
| 2.3.15 荧光定量PCR | 第43-44页 |
| 2.4 数据统计分析 | 第44页 |
| 3 结果与分析 | 第44-70页 |
| 3.1 菌液优化与生产性能测定结果 | 第44-49页 |
| 3.1.1 菌液添加量优化结果 | 第44-45页 |
| 3.1.2 生长性能 | 第45-47页 |
| 3.1.3 产蛋性能 | 第47-49页 |
| 3.1.4 蛋品质测定 | 第49页 |
| 3.2 肠道微生物DNA扩增与测序结果 | 第49-62页 |
| 3.2.1 肠道微生物DNA扩增结果 | 第49-52页 |
| 3.2.2 16S rDNA测序基础结果 | 第52-53页 |
| 3.2.3 16S rDNA测序多样性分析 | 第53-58页 |
| 3.2.4 16S rDNA测序聚类分析 | 第58-62页 |
| 3.3 基因表达差异 | 第62-67页 |
| 3.3.1 RNA质量检测 | 第62-63页 |
| 3.3.2 目的片段扩增 | 第63页 |
| 3.3.3 目的基因的熔解曲线 | 第63-65页 |
| 3.3.4 生长候选基因的表达差异 | 第65-66页 |
| 3.3.5 繁殖候选基因的表达差异 | 第66-67页 |
| 3.4 基因表达与性状相关分析 | 第67-70页 |
| 3.4.1 肠道微生物组成与体重及生长候选基因表达相关性分析 | 第67-68页 |
| 3.4.2 繁殖候选基因表达量与产蛋性能的相关性分析 | 第68-70页 |
| 4 讨论 | 第70-77页 |
| 4.1 益生菌对蛋鸡生长性能的影响 | 第70-71页 |
| 4.2 益生菌对蛋鸡产蛋性能的影响 | 第71页 |
| 4.3 16S rDNA测序揭示早期定植对后期微生物组成影响 | 第71-73页 |
| 4.4 生长繁殖相关基因表达差异 | 第73-75页 |
| 4.5 肠道微生物通过影响宿主基因表达来影响宿主表型性状 | 第75-77页 |
| 5 结论 | 第77页 |
| 参考文献 | 第77-93页 |
| 致谢 | 第93页 |
