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天山一号冰川底部沉积层介导硫代谢细菌的多样性研究

摘要第1-7页
Abstract第7-11页
缩略词表第11-12页
第一章 绪论第12-30页
   ·代谢硫古菌第14页
   ·硫氧化细菌(Sulfur-oxidizing bacteria, SOB)第14-19页
     ·无色硫细菌(Colorless Sulfur Bacteria)第16页
     ·绿色硫细菌(Green Sulfur Bacteria, GSB)第16-17页
     ·紫色硫细菌(Purple Sulfur Bacteria, PSB)第17-18页
     ·紫色非硫细菌(Purple Non-sulfur Bacteria, PNSB)第18-19页
   ·硫酸盐还原(Sulfate-reducing bacteria, SRB)第19页
   ·不同含硫无机物的代谢方式第19-26页
     ·硫代硫酸盐的代谢途径第19-24页
     ·元素硫的循环第24-25页
     ·硫化物的氧化第25-26页
     ·亚硫酸盐氧化成硫酸盐第26页
   ·硫的生物地球化学循环第26-28页
   ·细菌介导的硫循环第28页
   ·技术路线第28-29页
   ·研究意义第29-30页
第二章 冰川底部沉积层中介导硫循环的微生物的群落结构分析第30-44页
   ·材料和方法第30页
     ·样品的采集第30页
     ·样品富集第30页
   ·PMA处理富集样品第30-31页
   ·富集样品总基因组DNA提取第31-32页
     ·PCR扩增AprA功能基因第31页
     ·1.5%琼脂糖电泳检测PCR扩增产物第31-32页
   ·硫细菌功能基因克隆文库的构建第32-33页
   ·测序及数据处理第33页
   ·结果与讨论第33-35页
     ·富集样品基因组DNA提取结果第33-34页
     ·经PMA处理和未处理Apra功能基因扩增结果第34页
     ·aprA功能基因PCR扩增产物的纯化第34-35页
     ·阳性克隆PCR检测结果第35页
   ·测序处理结果第35-42页
     ·天山一号冰川底部沉积层中介导硫循环微生物多样性第35-38页
     ·沉积层aprA克隆文库聚类分析第38-42页
   ·讨论第42-43页
   ·本章小结第43-44页
第三章 硫细菌分离、纯化、生理生化鉴定及其生物学特性研究第44-55页
   ·硫细菌的富集、分离及纯化的培养基第44-45页
     ·培养基的制备第44-45页
     ·富集培养第45页
     ·菌株分离第45页
     ·菌株纯化第45页
   ·硫细菌生理生化鉴定及其生物学特性研究第45-46页
     ·形态鉴定第45页
     ·生理生化鉴定第45页
     ·生长曲线的测定第45页
     ·pH和温度生长的影响第45-46页
   ·细菌甘油管的保藏第46页
   ·分离菌株 16S rRNA基因的扩增和鉴定第46页
   ·序列进化树分析第46-47页
   ·结果分析第47-54页
     ·细菌菌落形态及比对结果第47-48页
     ·菌株的聚类分第48-50页
     ·代表菌株因缘关系分析第50-51页
     ·菌株生理生化鉴定第51页
     ·菌株HHBCD419 和ABCD5II110菌落结构第51-52页
     ·菌株的生长曲线测定第52-53页
     ·菌株最适生长pH第53页
     ·菌株最适生长温度第53-54页
   ·本章小结第54-55页
第四章 结论与展望第55-57页
   ·结论第55-56页
     ·aprA克隆文库结论第55页
     ·分离菌株及其理化特性第55-56页
   ·展望第56页
   ·本文的主要创新点和难点第56-57页
参考文献第57-63页
附录 主要实验仪器和试剂第63-65页
致谢第65-66页
作者简介第66-67页
附件第67页

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