秋眠及非秋眠紫花苜蓿转录组测序及秋眠相关差异基因的筛选
| 致谢 | 第1-7页 |
| 摘要 | 第7-8页 |
| 1 文献综述 | 第8-14页 |
| ·紫花苜蓿的营养价值 | 第8-9页 |
| ·粗蛋白质 | 第8页 |
| ·碳水化合物 | 第8-9页 |
| ·维生素 | 第9页 |
| ·紫花苜蓿中的功能成分 | 第9页 |
| ·紫花苜蓿的秋眠性 | 第9-10页 |
| ·紫花苜蓿秋眠性机理研究 | 第10页 |
| ·测序技术的发展 | 第10-14页 |
| ·第一代测序技术 | 第10-11页 |
| ·高通量测序技术 | 第11-12页 |
| ·Illumina测序平台 | 第11-12页 |
| ·Roche测序平台 | 第12页 |
| ·ABI测序平台 | 第12页 |
| ·几种测序技术的比较 | 第12-13页 |
| ·转录组测序 | 第13-14页 |
| 2 引言 | 第14-15页 |
| 3 材料与方法 | 第15-23页 |
| ·试验材料 | 第15页 |
| ·技术路线 | 第15页 |
| ·试验主要仪器设备与试剂 | 第15-16页 |
| ·仪器设备 | 第15-16页 |
| ·主要试剂 | 第16页 |
| ·测定指标与方法 | 第16-23页 |
| ·RNA提取 | 第16-17页 |
| ·RNA浓度及OD值的测定 | 第17页 |
| ·RNA凝胶电泳 | 第17页 |
| ·cDNA文库的构建及测序 | 第17-18页 |
| ·转录组的组装 | 第18页 |
| ·比对、定量和注释 | 第18页 |
| ·GC含量和SSR的发掘 | 第18页 |
| ·序列保守性分析 | 第18-19页 |
| ·转录因子编码基因的鉴定 | 第19页 |
| ·基因表达分析 | 第19页 |
| ·荧光定量PCR验证 | 第19-23页 |
| 4 结果 | 第23-36页 |
| ·测序原始数据 | 第23-24页 |
| ·测序数据及转录组的组装 | 第24页 |
| ·转录组的基本信息 | 第24-26页 |
| ·简单重复序列的鉴定 | 第26页 |
| ·序列保守性和功能注释 | 第26-30页 |
| ·序列保守性分析 | 第26-27页 |
| ·功能聚类 | 第27-29页 |
| ·KEGG代谢通路 | 第29-30页 |
| ·转录因子编码基因 | 第30-31页 |
| ·差异表达基因的筛选 | 第31-36页 |
| 5 讨论与结论 | 第36-38页 |
| 参考文献 | 第38-45页 |
| ABSTRACT | 第45-46页 |
| 附表 | 第46-56页 |
