秋眠及非秋眠紫花苜蓿转录组测序及秋眠相关差异基因的筛选
致谢 | 第1-7页 |
摘要 | 第7-8页 |
1 文献综述 | 第8-14页 |
·紫花苜蓿的营养价值 | 第8-9页 |
·粗蛋白质 | 第8页 |
·碳水化合物 | 第8-9页 |
·维生素 | 第9页 |
·紫花苜蓿中的功能成分 | 第9页 |
·紫花苜蓿的秋眠性 | 第9-10页 |
·紫花苜蓿秋眠性机理研究 | 第10页 |
·测序技术的发展 | 第10-14页 |
·第一代测序技术 | 第10-11页 |
·高通量测序技术 | 第11-12页 |
·Illumina测序平台 | 第11-12页 |
·Roche测序平台 | 第12页 |
·ABI测序平台 | 第12页 |
·几种测序技术的比较 | 第12-13页 |
·转录组测序 | 第13-14页 |
2 引言 | 第14-15页 |
3 材料与方法 | 第15-23页 |
·试验材料 | 第15页 |
·技术路线 | 第15页 |
·试验主要仪器设备与试剂 | 第15-16页 |
·仪器设备 | 第15-16页 |
·主要试剂 | 第16页 |
·测定指标与方法 | 第16-23页 |
·RNA提取 | 第16-17页 |
·RNA浓度及OD值的测定 | 第17页 |
·RNA凝胶电泳 | 第17页 |
·cDNA文库的构建及测序 | 第17-18页 |
·转录组的组装 | 第18页 |
·比对、定量和注释 | 第18页 |
·GC含量和SSR的发掘 | 第18页 |
·序列保守性分析 | 第18-19页 |
·转录因子编码基因的鉴定 | 第19页 |
·基因表达分析 | 第19页 |
·荧光定量PCR验证 | 第19-23页 |
4 结果 | 第23-36页 |
·测序原始数据 | 第23-24页 |
·测序数据及转录组的组装 | 第24页 |
·转录组的基本信息 | 第24-26页 |
·简单重复序列的鉴定 | 第26页 |
·序列保守性和功能注释 | 第26-30页 |
·序列保守性分析 | 第26-27页 |
·功能聚类 | 第27-29页 |
·KEGG代谢通路 | 第29-30页 |
·转录因子编码基因 | 第30-31页 |
·差异表达基因的筛选 | 第31-36页 |
5 讨论与结论 | 第36-38页 |
参考文献 | 第38-45页 |
ABSTRACT | 第45-46页 |
附表 | 第46-56页 |