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家蚕马氏管响应BmNPV感染相关miRNA的初步研究

摘要第1-8页
ABSTRACT第8-19页
第1章 绪论第19-27页
   ·研究背景和选题意义第19-25页
     ·昆虫免疫系统第19页
     ·昆虫免疫组织第19-20页
     ·昆虫的抗病毒免疫第20页
     ·miRNA 的起源及合成第20-22页
     ·miRNA 的生物学功能第22页
     ·国内外抗病毒免疫相关 miRNA 研究进展第22-24页
     ·miRNA 在昆虫宿主与病毒中的相互作用第24-25页
   ·本课题研究的主要内容和方法第25-27页
第2章 家蚕马氏管组织小 RNA 文库的构建与深度测序第27-45页
   ·实验材料与设备第27-28页
     ·实验材料准备第27页
     ·实验仪器与试剂第27-28页
     ·常用生物信息学分析软件第28页
   ·实验方法第28-32页
     ·重组病毒 BmNPV-EGFP 的构建第28页
     ·重组病毒 BmNPV-EGFP 侵染家蚕和侵染时相的观察第28-29页
     ·家蚕马氏管总 RNA 的提取第29页
     ·小 RNA 文库的构建第29页
     ·Solexa 测序第29-30页
     ·生物信息学分析第30-32页
   ·结果与分析第32-43页
     ·重组病毒 BmNPV-EGFP 对家蚕各组织侵染时相的结果第32-33页
     ·生物信息学分析结果第33-43页
   ·讨论第43-44页
   ·小结第44-45页
第3章 家蚕马氏管响应 BmNPV 感染候选 miRNA 的实验验证第45-63页
   ·实验材料与试剂第45-50页
     ·实验材料的准备第45页
     ·工具酶和其他试剂第45页
     ·常用试剂的配制第45-47页
     ·主要的实验仪器和设备第47-48页
     ·引物设计第48-50页
   ·实验方法第50-56页
     ·家蚕各时相马氏管总 RNA 的提取第50-51页
     ·反转录反应第51-52页
     ·PCR 验证第52-53页
     ·琼脂糖凝胶的制备与电泳第53-54页
     ·玻璃奶回收 DNA第54页
     ·目的片段与 pMD18-T 载体的连接第54页
     ·质粒 DNA 的转化第54-55页
     ·碱裂解法少量提取质粒 DNA第55页
     ·重组质粒 DNA 的酶切鉴定第55-56页
     ·甘油菌的制备及序列测定第56页
   ·结果与分析第56-59页
     ·RNA 质量的鉴定第56页
     ·候选 miRNA 的 RT-PCR 验证第56页
     ·候选 miRNA 的酶切鉴定第56-57页
     ·候选 miRNA 的测序结果第57-59页
     ·候选 miRNA 在感染和对照样品池中相对表达分析第59页
   ·讨论第59-61页
   ·小结第61-63页
第4章 家蚕编码的 bmo-miR_375 的表达分析与靶标预测第63-75页
   ·实验材料及试剂第63-64页
     ·实验材料的准备第63页
     ·工具酶和其它试剂第63-64页
     ·常用试剂和缓冲液的配制第64页
     ·常用生物信息学分析工具第64页
   ·试验方法第64-66页
     ·引物设计第64-65页
     ·家蚕各时相马氏管总和各组织 RNA 的提取第65页
     ·反转录反应第65页
     ·半定量 RT-PCR 检测第65页
     ·家蚕编码候选 miRNA 的靶标预测第65-66页
   ·结果与分析第66-71页
     ·bmo-miR_375 在 BmNPV 侵染马氏管后不同时相中相对表达分析第66-68页
     ·候选 bmo-miR_375 在家蚕幼虫不同组织中表达谱分析第68页
     ·候选 bmo-miR_375 靶标预测结果第68-71页
   ·讨论第71-73页
   ·小结第73-75页
全文总结第75-77页
参考文献第77-83页
攻读学位期间发表的学术论文第83-85页
致谢第85页

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