| 摘要 | 第1-13页 |
| ABSTRACT | 第13-16页 |
| 縮略词表 | 第16-17页 |
| 第一章 前言 | 第17-43页 |
| 1 研究问题的由来 | 第17-18页 |
| 2 宫内发育迟缓(IUGR)与胎儿小于妊娠年龄(SGA) | 第18-22页 |
| ·宫内发育迟缓概述 | 第18-19页 |
| ·宫内发育迟缓的高危因素 | 第19页 |
| ·宫内发育迟缓的预测 | 第19-22页 |
| ·妊娠早、中期的预测 | 第20-21页 |
| ·妊娠晚期的预测 | 第21-22页 |
| 3 先兆子痫(PE) | 第22-29页 |
| ·先兆子痫概述 | 第22-23页 |
| ·先兆子痫的病理生理学 | 第23-24页 |
| ·利用生物标记检测先兆子痫的必要性 | 第24页 |
| ·先兆子痫相关的生化标记 | 第24-28页 |
| ·鉴定新的生物标记 | 第28-29页 |
| 4 microRNA与怀孕过程 | 第29-33页 |
| ·microRNA概述 | 第29页 |
| ·microRNA的生物合成和RNA干扰途径 | 第29-30页 |
| ·胚胎着床期的microRNA | 第30页 |
| ·microRNA在胎盘中的表达 | 第30-32页 |
| ·microRNA在调节母体-胎儿免疫耐受中的作用 | 第32页 |
| ·母体外周循环血中与妊娠相关的microRNA | 第32-33页 |
| 5 微阵列基因芯片技术及其应用 | 第33-38页 |
| ·微阵列基因芯片概述 | 第33-34页 |
| ·基因芯片在繁殖医学上的应用 | 第34-37页 |
| ·基因芯片与先兆子痫 | 第34-35页 |
| ·基因芯片与早期胚胎发育 | 第35-36页 |
| ·基因芯片与子宫内膜感受性和胎盘发育 | 第36页 |
| ·基因芯片与子宫内膜异位 | 第36-37页 |
| ·微阵列基因芯片技术的未来 | 第37-38页 |
| 6 基因组印记 | 第38-42页 |
| ·基因组印记概况 | 第38-39页 |
| ·基因组印记的表达调控 | 第39-40页 |
| ·基因组印记与家畜数量性状 | 第40-41页 |
| ·候选基因MAGEL2概述 | 第41-42页 |
| 7 研究目的与意义 | 第42-43页 |
| 第二章 人先兆子痫和宫内发育迟缓胎盘转录组分析及差异表达microRNA研究 | 第43-88页 |
| 1 背景介绍 | 第43页 |
| 2 材料与方法 | 第43-61页 |
| ·实验材料 | 第43-46页 |
| ·生物样品 | 第43-44页 |
| ·主要仪器设备 | 第44-45页 |
| ·主要分析软件 | 第45页 |
| ·主要试剂及试剂盒 | 第45-46页 |
| ·实验方法 | 第46-61页 |
| ·生物样品采集 | 第46页 |
| ·RNA的提取及质量控制 | 第46-50页 |
| ·人胎盘全基因组表达芯片杂交及数据处理 | 第50-55页 |
| ·根据人胎盘差异表达基因预测候选miRNAs | 第55-57页 |
| ·Real-time qRT-PCR验证候选miRNAs在人胎盘中的差异表达 | 第57-59页 |
| ·根据候选microRNA在胎盘中的表达水平构建决定树 | 第59页 |
| ·microRNA在母本外周循环血液中的稳定性研究 | 第59-60页 |
| ·人胎盘差异表达基因的IPA通路分析 | 第60-61页 |
| 3 结果与分析 | 第61-80页 |
| ·研究群体人口普查信息统计 | 第61-63页 |
| ·方差主成分分析及线性混合模型的选择 | 第63-64页 |
| ·人胎盘转录组比较分析 | 第64-66页 |
| ·先兆子痫胎盘与正常胎盘间的差异表达基因 | 第64-65页 |
| ·宫内发育迟缓胎盘与正常胎盘间的差异表达基因 | 第65-66页 |
| ·根据胎盘转录组进行可调模块性聚类分析(MMC) | 第66-70页 |
| ·可调模块性聚类分析(MMC)结果 | 第66-67页 |
| ·按模块进行方差主成分分析 | 第67页 |
| ·不同模块间胎盘的差异表达基因 | 第67-70页 |
| ·根据基因集合富集分析(GSEA)预测候选microRNAs | 第70-71页 |
| ·Real-time qRT-PCR验证候选microRNAs在人胎盘中的差异表达 | 第71-74页 |
| ·候选microRNAs的引物设计 | 第71页 |
| ·标准曲线的建立及扩增效率的测定 | 第71-72页 |
| ·候选microRNAs在模块间的表达差异 | 第72-73页 |
| ·候选microRNAs在PE/IUGR/Control间的表达差异 | 第73-74页 |
| ·根据候选microRNAs在胎盘中的表达水平构建决定树 | 第74-76页 |
| ·microRNA在母本外周循环血液中的稳定性研究 | 第76-78页 |
| ·人胎盘差异表达基因相关的IPA通路 | 第78-80页 |
| 4 讨论 | 第80-86页 |
| ·群体的个体差异对基因表达情况的影响 | 第80页 |
| ·宫内发育迟缓(IUGR)样品的高异质性 | 第80-81页 |
| ·可调模块性聚类分析(MMC)的引入及聚类方法的选择 | 第81-84页 |
| ·可调模块性聚类分析(MMC)结果的有效性 | 第84页 |
| ·宫内发育迟缓(IUGR)相关的因子和通路 | 第84-85页 |
| ·差异表达microRNA的目标靶基因 | 第85-86页 |
| ·决定树的预测准确性 | 第86页 |
| 5 本章总结 | 第86-88页 |
| ·总结及意义 | 第86-87页 |
| ·创新点 | 第87页 |
| ·下一步工作计划 | 第87-88页 |
| 第三章 以猪为模式动物研究印记基因MAGEL2在两个胚胎时期的印记状态及与胴体性状的关联分析 | 第88-114页 |
| 1 背景介绍 | 第88页 |
| 2 材料与方法 | 第88-99页 |
| ·实验材料 | 第88-91页 |
| ·生物样品 | 第88-89页 |
| ·主要仪器设备 | 第89页 |
| ·主要分析软件 | 第89-90页 |
| ·主要试剂及试剂盒 | 第90页 |
| ·主要溶液配置 | 第90-91页 |
| ·实验方法 | 第91-99页 |
| ·基因组DNA的提取 | 第91-92页 |
| ·组织总RNA的提取及质量控制 | 第92-93页 |
| ·第一链cDNA的合成 | 第93-94页 |
| ·猪MAGEL2基因的克隆测序 | 第94-96页 |
| ·猪MAGEL2基因在猪胚胎中的组织表达谱研究 | 第96-97页 |
| ·猪MAGEL2基因的SNP鉴定 | 第97页 |
| ·猪MAGEL2基因的PCR-RFLP及RT-PCR-RFLP分析 | 第97-98页 |
| ·SNP在不同猪种的等位基因频率及基因型频率测定 | 第98页 |
| ·猪MAGEL2基因在猪30日龄和65日龄胚胎中的印记分析 | 第98-99页 |
| ·猪MAGEL2基因与胴体性状的关联分析 | 第99页 |
| 3 结果与分析 | 第99-109页 |
| ·猪MAGEL2基因的克隆测序结果 | 第99页 |
| ·猪MAGEL2基因在猪胚胎中的组织表达谱 | 第99-100页 |
| ·猪MAGEL2基因的SNP鉴定结果 | 第100-101页 |
| ·猪MAGEL2的等位基因频率及基因型频率 | 第101-102页 |
| ·猪MAGEL2基因在猪30日龄和65日龄胚胎中的印记状况 | 第102-106页 |
| ·杂合子筛选结果 | 第102-103页 |
| ·猪MAGEL2基因在30日龄胚胎中的印记状况 | 第103-104页 |
| ·猪MAGEL2基因在65日龄胚胎中的印记状况 | 第104-106页 |
| ·猪MAGEL2基因与胴体性状的关联分析 | 第106-109页 |
| ·多态位点g.2592A>C与猪胴体性状的关联分析 | 第106-107页 |
| ·多态位点g.3277T>C与猪胴体性状的关联分析 | 第107-109页 |
| 4 讨论 | 第109-112页 |
| ·模型的建立和发育时期的选择 | 第109页 |
| ·MAGEL2在人、小鼠、猪中的表达和印记情况 | 第109-110页 |
| ·猪MAGEL2基因的印记多态性 | 第110-111页 |
| ·印记基因对母体-胎儿互作的影响 | 第111页 |
| ·印记基因对胎儿出生后行为的影响 | 第111-112页 |
| ·关联分析的不足之处 | 第112页 |
| 5 本章总结 | 第112-114页 |
| ·总结及意义 | 第112-113页 |
| ·创新点 | 第113页 |
| ·下一步工作计划 | 第113-114页 |
| 参考文献 | 第114-137页 |
| 附录1：补充表格 | 第137-142页 |
| 附录2：芯片数据分析相关代码 | 第142-149页 |
| 博士在读期间研究成果 | 第149-150页 |
| 致谢 | 第150页 |
