雀形目13种鸟类线粒体全基因组序列的测定与分析
| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-11页 |
| 缩写表及中英文对照 | 第11-12页 |
| 第一章 综述 | 第12-25页 |
| 0 引言 | 第12页 |
| 1 雀形目简介 | 第12-14页 |
| 2 鸟类线粒体基因组的结构特点及研究进展 | 第14-17页 |
| ·鸟类线粒体基因组的结构及遗传特点 | 第14-15页 |
| ·鸟类线粒体基因组的结构特点 | 第14页 |
| ·线粒体基因组用于系统发育分析的优势 | 第14-15页 |
| ·雀形目鸟类线粒体基因组的研究进展 | 第15-17页 |
| 3 MtDNA 在鸟类系统发育研究中的应用 | 第17页 |
| 4 本研究的目的及其意义 | 第17-19页 |
| 参考文献 | 第19-25页 |
| 第二章 实验材料与方法 | 第25-41页 |
| 1 实验材料 | 第25-26页 |
| ·实验标本的收集及保存 | 第25页 |
| ·主要的实验仪器 | 第25-26页 |
| ·数据分析软件的使用 | 第26页 |
| 2 实验方法 | 第26-32页 |
| ·总基因组 DNA 的提取、检测及保存 | 第26-27页 |
| ·引物的设计 | 第27页 |
| ·PCR 的扩增及产物的检测 | 第27-29页 |
| ·LA-PCR 的扩增及目的片段的检测、纯化 | 第27-29页 |
| ·巢式 PCR 的扩增及目的片段的检测、纯化 | 第29页 |
| ·目的片段的克隆及测序 | 第29-32页 |
| ·感受态细胞的制备及保存 | 第29-30页 |
| ·目的片段的克隆 | 第30-31页 |
| ·阳性克隆的检测及测序 | 第31-32页 |
| 3 实验数据的处理 | 第32页 |
| ·测序结果的序列校正及序列的拼接 | 第32页 |
| ·线粒体全基因组的分区 | 第32页 |
| ·线粒体基因组的结构与特征分析 | 第32页 |
| 4 雀形目鸟类的系统发育分析 | 第32-37页 |
| ·序列的选择 | 第32-33页 |
| ·序列的比对与替代饱和分析 | 第33-36页 |
| ·系统发育树的构建 | 第36-37页 |
| 参考文献 | 第37-41页 |
| 第三章 实验结果和讨论 | 第41-78页 |
| 1 线粒体基因组的结构与特征 | 第41页 |
| ·线粒体基因组的结构 | 第41页 |
| ·线粒体基因组的特征 | 第41页 |
| 2 蛋白质编码基因 | 第41-50页 |
| 3 rRNA 基因 | 第50-58页 |
| 4 tRNA 基因 | 第58页 |
| 5 非编码控制区 | 第58-62页 |
| 6 系统发育分析 | 第62-70页 |
| 7 讨论 | 第70-73页 |
| ·基因组结构特征 | 第70-72页 |
| ·雀形目的系统发育 | 第72-73页 |
| 8 结论 | 第73-74页 |
| 9 展望 | 第74页 |
| 参考文献 | 第74-78页 |
| 附件 | 第78-97页 |
| 致谢 | 第97-98页 |
| 附 硕士期间发表论文及获奖情况 | 第98页 |
