| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 目录 | 第9-13页 |
| 第1章 绪论：组蛋白翻译后修饰识别 | 第13-33页 |
| ·引言 | 第13-14页 |
| ·组蛋白翻译后修饰 | 第14-16页 |
| ·组蛋白密码 | 第16页 |
| ·组蛋白密码的建立,作用与消除 | 第16-17页 |
| ·组蛋白翻译后修饰识别的结构域 | 第17-30页 |
| ·组蛋白甲基化识别 | 第18-23页 |
| ·赖氨酸甲基化识别 | 第18-21页 |
| ·精氨酸甲基化识别 | 第21-23页 |
| ·组蛋白乙酰化识别 | 第23-24页 |
| ·组蛋白修饰的组合识别 | 第24-30页 |
| ·相邻组蛋白翻译后修饰的识别 | 第24-26页 |
| ·中等距离翻译后修饰组合的识别 | 第26-27页 |
| ·远距离翻译后修饰组合的识别 | 第27-28页 |
| ·同一核小体不同组蛋白尾巴的识别 | 第28-30页 |
| 参考文献 | 第30-33页 |
| 第2章 组蛋白甲基转移酶NSD家族 | 第33-55页 |
| ·NSD家族简介 | 第33页 |
| ·NSD家族与人类疾病的关系 | 第33-34页 |
| ·NSD家族蛋白质的特性 | 第34-35页 |
| ·NSD家族蛋白质致病机理进展 | 第35-39页 |
| ·NSD1异常致病机理研究 | 第35-37页 |
| ·NSD2异常致病机理研究 | 第37-39页 |
| ·NSD3异常致病机理研究 | 第39页 |
| ·NSD家族蛋白质功能的非冗余性 | 第39-40页 |
| ·NSD家族蛋白质SET结构域酶活性质 | 第40-42页 |
| ·H3K36甲基化 | 第42-48页 |
| ·H3K36甲基化与转录延伸 | 第42-45页 |
| ·H3K36甲基化与mRNA剪接 | 第45-46页 |
| ·H3K36甲基化的其他功能 | 第46-48页 |
| ·H3K36甲基化的建立 | 第48页 |
| ·NSD家族蛋白质如何被募集到指定位置 | 第48-50页 |
| ·NSD家族蛋白质被募集到基因组的不同位置 | 第49-50页 |
| ·NSD家族的组蛋白识别结构域 | 第50页 |
| ·PHD5-C5HCH模块可能在NSD家族蛋白质多样性上起关键作用 | 第50页 |
| ·总结 | 第50-51页 |
| 参考文献 | 第51-55页 |
| 第3章 材料方法 | 第55-69页 |
| ·人源PHD5-C5HCH_(NSD1),PHD5-C5HCH_(NSD2)和PHD5-C5HCH_(NSD3)的克隆 | 第55-60页 |
| ·蛋白质边界选择和克隆策略 | 第55-56页 |
| ·PCR扩增片段 | 第56页 |
| ·片段回收 | 第56页 |
| ·双酶切实验 | 第56-57页 |
| ·载体准备 | 第57页 |
| ·双酶切片段连接至载体 | 第57页 |
| ·LIC片段dCTP处理 | 第57-58页 |
| ·LIC载体线性化和dGTP处理 | 第58页 |
| ·LIC连接 | 第58页 |
| ·连接产物转化至感受态细胞 | 第58页 |
| ·单克隆鉴定 | 第58-59页 |
| ·突变体构建 | 第59-60页 |
| ·蛋白质表达 | 第60-62页 |
| ·His_6标签融合蛋白质表达 | 第60-61页 |
| ·His_6标签融合蛋白质纯化 | 第61-62页 |
| ·GST标签融合蛋白质纯化 | 第62页 |
| ·同位素标记蛋白的表达 | 第62页 |
| ·晶体生长,数据收集和结构解析 | 第62-64页 |
| ·核磁实验 | 第64-65页 |
| ·主链认证 | 第64页 |
| ·核磁滴定 | 第64-65页 |
| ·组蛋白相互作用实验 | 第65-66页 |
| ·小牛胸腺组蛋白Pull-down实验 | 第65页 |
| ·生物素标记小肽Pull-down | 第65-66页 |
| ·Peptide arrays鉴定对组蛋白修饰的识别 | 第66页 |
| ·ITC实验 | 第66页 |
| 参考文献 | 第66-69页 |
| 第4章 NSD家族蛋白质PHD5-C5HCH模块的结构功能研究 | 第69-103页 |
| ·实验结果 | 第69-88页 |
| ·蛋白质边界选择 | 第69-70页 |
| ·NSD家族成员的PHD5-C5HCH模块显示出组蛋白结合能力的差异 | 第70-71页 |
| ·小肽阵列鉴定NSD3的PHD5-C5HCH模块对组蛋白修饰的选择性 | 第71页 |
| ·等温量热滴定定量PHD5-C5HCH_(NSD3)与H3 N端小肽的结合强度 | 第71-73页 |
| ·NMR化学位移扰动实验 | 第73-75页 |
| ·PHD5-C5HCH_(NSD3)自由状态,及其与组蛋白H3 N端小肽的复合物晶体生长,数据收集和结构解析 | 第75-78页 |
| ·PHD5-C5HCH_(NSD3)模块是一个整体,仅由PHD5负责组蛋白H3 N端尾巴的结合 | 第78-79页 |
| ·NSD家族三个成员的PHD5-C5HCH_(NSD3)模块结构上保守 | 第79-80页 |
| ·PHD5-C5HCH_(NSD3)模块识别组蛋白H3 N端尾巴的分子机制 | 第80-84页 |
| ·NTS motif定义了可以感知H3K9甲基化修饰状态的PHD锌指类型 | 第84-87页 |
| ·NSD家族PHD5-C5HCH模块结合组蛋白H3的差异 | 第87-88页 |
| ·结论 | 第88页 |
| ·讨论 | 第88-97页 |
| ·NSD家族PHD5-C5HCH结构域识别组蛋白能力差异在进化中是保守的 | 第88-90页 |
| ·NSD家族的C5HCH结构域是潜在的蛋白质-蛋白质相互作用模块,而且相互作用模式也可能存在差异 | 第90-93页 |
| ·NSD家族的PHD5-C5HCH串联锌指结构是一种新的串联PHD锌指结构类型 | 第93-94页 |
| ·Sotos综合症突变的影响 | 第94-96页 |
| ·NSD3的PHD5-C5HCH模块识别组蛋白的特性对NSD3 in vivo功能的提示 | 第96-97页 |
| ·总结 | 第97-98页 |
| ·进展 | 第97页 |
| ·缺点和展望 | 第97-98页 |
| 参考文献 | 第98-103页 |
| 附录1 晶体生长与优化 | 第103-107页 |
| 附录2 晶体数据收集与结构解析 | 第107-109页 |
| 参考文献 | 第109-111页 |
| 致谢 | 第111-112页 |
| 在读期间发表的学术论文与取得的研究成果 | 第112页 |
