| 摘要 | 第1-11页 |
| Abstract | 第11-14页 |
| 插图和附表清单 | 第14-17页 |
| 英文缩略词表 | 第17-19页 |
| 第一章 文献综述 | 第19-43页 |
| 1 隐孢子虫分子流行病学研究进展 | 第19-36页 |
| ·隐孢子虫种类/基因型概况 | 第19-22页 |
| ·隐孢子虫基因分型工具 | 第22-28页 |
| ·农场动物的C. parvum 感染 | 第28-29页 |
| ·牛体寄生的C. parvum | 第28-29页 |
| ·绵羊和山羊寄生的C. parvum | 第29页 |
| ·猪寄生的C. parvum | 第29页 |
| ·其它农场动物寄生的C. parvum | 第29页 |
| ·C. parvum 亚型和人兽共患传播 | 第29-33页 |
| ·动物源C. parvum 亚型 | 第29-32页 |
| ·人源C. parvum 亚型及人兽共患传播 | 第32-33页 |
| ·人体C. hominis 感染 | 第33-35页 |
| ·人体感染其它一些隐孢子虫种类/基因型 | 第35-36页 |
| ·结语 | 第36页 |
| 2 我国隐孢子虫病流行病学研究进展 | 第36-43页 |
| ·反刍动物隐孢子虫病 | 第36-38页 |
| ·猪隐孢子虫病 | 第38页 |
| ·禽类隐孢子虫病 | 第38-39页 |
| ·啮齿动物隐孢子虫病 | 第39页 |
| ·其它动物隐孢子虫病 | 第39-40页 |
| ·人体隐孢子虫病 | 第40页 |
| ·结语 | 第40-43页 |
| 第二章 奶牛隐孢子虫病流行病学调查 | 第43-51页 |
| 1 引言 | 第43页 |
| 2 材料与方法 | 第43-44页 |
| ·样品来源 | 第43页 |
| ·试剂配制 | 第43-44页 |
| ·显微镜检查方法 | 第44页 |
| 3 结果 | 第44-47页 |
| ·隐孢子虫感染率 | 第44-46页 |
| ·隐孢子虫感染率年龄分布 | 第46-47页 |
| ·隐孢子虫感染率季节变化 | 第47页 |
| ·隐孢子虫卵囊形态 | 第47页 |
| 4 讨论 | 第47-51页 |
| 第三章 主要畜禽和人体隐孢子虫种类 | 第51-79页 |
| 1 引言 | 第51页 |
| 2 材料与方法 | 第51-55页 |
| ·隐孢子虫阳性样品 | 第51-52页 |
| ·隐孢子虫卵囊处理 | 第52页 |
| ·隐孢子虫基因组DNA 提取 | 第52-53页 |
| ·DNA 提取试剂盒 | 第52页 |
| ·DNA 提取流程 | 第52-53页 |
| ·隐孢子虫SSU rRNA 基因PCR-RFLP 分型方法 | 第53-54页 |
| ·SSU rRNA 基因PCR 扩增 | 第53-54页 |
| ·基于SspI，VspI 和MboII 限制性内切酶的RFLP 鉴定 | 第54页 |
| ·SSU rRNA 基因PCR 产物和RFLP 产物凝胶电泳检测 | 第54页 |
| ·SSU rRNA 基因PCR 产物测序 | 第54-55页 |
| ·种系发育分析 | 第55页 |
| ·GenBank 登陆号 | 第55页 |
| 3 结果 | 第55-67页 |
| ·SSU rRNA 基因PCR 扩增结果 | 第55页 |
| ·PCR-RFLP 鉴定结果 | 第55-56页 |
| ·奶牛 | 第56-63页 |
| ·奶牛隐孢子虫种类分布 | 第56-62页 |
| ·奶牛隐孢子虫种类的年龄分布 | 第62-63页 |
| ·断奶前犊牛C. parvum和C. bovis感染季节性变化 | 第63页 |
| ·猪 | 第63-64页 |
| ·猪隐孢子虫种类/基因型分布 | 第63页 |
| ·猪隐孢子虫种类/基因型的年龄分布 | 第63-64页 |
| ·C. suis 和pig genotype II SSU rRNA 基因保守性分析 | 第64页 |
| ·禽类 | 第64-67页 |
| ·禽类隐孢子虫种类分布 | 第64页 |
| ·禽类隐孢子虫种类的年龄分布 | 第64-66页 |
| ·鸵鸟源C. baileyi 和C. muris 动物交叉感染实验 | 第66-67页 |
| ·人源隐孢子虫分离株鉴定结果 | 第67页 |
| ·种系发育关系 | 第67页 |
| 4 讨论 | 第67-79页 |
| ·关于奶牛隐孢子虫种类/基因型 | 第67-72页 |
| ·关于猪隐孢子虫种类/基因型 | 第72-73页 |
| ·关于禽类隐孢子虫种类/基因型 | 第73-74页 |
| ·关于人体隐孢子虫种类/基因型 | 第74-79页 |
| 第四章 C. parvum 和C. hominis 亚型遗传特征研究 | 第79-85页 |
| 1 引言 | 第79页 |
| 2 材料与方法 | 第79-80页 |
| ·隐孢子虫样品 | 第79页 |
| ·隐孢子虫基因组DNA 提取 | 第79页 |
| ·基于gp60 基因的C. parvum 和C. hominis 亚型分型方法 | 第79-80页 |
| ·gp60 基因PCR 产物凝胶电泳检测 | 第80页 |
| ·gp60 基因PCR 产物测序 | 第80页 |
| ·GenBank 登陆号 | 第80页 |
| 3 结果 | 第80-81页 |
| ·gp60 基因PCR 扩增结果 | 第80-81页 |
| ·奶牛源C. parvum gp60 基因遗传特征 | 第81页 |
| ·人源C. hominis gp60 基因遗传多态性 | 第81页 |
| 4 讨论 | 第81-85页 |
| 第五章 C. muris 和C. andersoni 群体遗传结构研究 | 第85-101页 |
| 1 引言 | 第85页 |
| 2 材料与方法 | 第85-87页 |
| ·隐孢子虫样品来源 | 第85-86页 |
| ·隐孢子虫基因组DNA 提取 | 第86页 |
| ·C. muris 和C. andersoni MLST 分型方法 | 第86页 |
| ·MS1，MS2，MS3，MS16 基因PCR 产物凝胶电泳检测 | 第86-87页 |
| ·MS1，MS2，MS3，MS16 基因PCR 产物测序 | 第87页 |
| ·种系发育分析 | 第87页 |
| ·C. muris 和C. andersoni 群体遗传结构分析 | 第87页 |
| ·GenBank 登陆号 | 第87页 |
| 3 结果 | 第87-98页 |
| ·MS1，MS2，MS3，MS16 基因PCR 扩增结果 | 第87-89页 |
| ·C. muris 和C. andersoni 亚型之间种系发育关系 | 第89-91页 |
| ·MS1，MS2，MS3，MS16 基因位点小卫星序列多态特征 | 第91页 |
| ·C. muris 和C. andersoni 多位点序列类型 | 第91页 |
| ·C. muris 和C. andersoni 群体遗传分析 | 第91-98页 |
| ·C. muris 和C. andersoni DNA 序列多态性分析 | 第91-93页 |
| ·C. muris 和C. andersoni MLST 类型频率分析 | 第93-95页 |
| ·C. muris 和C. andersoni 多位点连锁不平衡分析 | 第95-96页 |
| ·C. muris 和C. andersoni MLST 数据eBURST 网络分析 | 第96-98页 |
| 4 讨论 | 第98-101页 |
| 结论 | 第101-103页 |
| 参考文献 | 第103-125页 |
| 致谢 | 第125-127页 |
| 作者简介 | 第127-128页 |
