序列比对算法CLUSTAL解析及优化
| 摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-7页 |
| 第一章 绪论 | 第7-17页 |
| ·引言 | 第7-8页 |
| ·生物信息学中的多序列比对问题概述 | 第8-15页 |
| ·生物序列比对背景 | 第8-11页 |
| ·多序列比对问题研究及现状 | 第11-15页 |
| ·论文研究的方法和内容 | 第15-17页 |
| 第二章 双序列比对问题及算法研究 | 第17-27页 |
| ·序列数据库 | 第17-19页 |
| ·序列相似性与同源性 | 第19-20页 |
| ·最长公共子序列 | 第20-21页 |
| ·全局比对与局部比对 | 第21-22页 |
| ·权重矩阵与空位罚分 | 第22-24页 |
| ·双序列比对问题算法研究 | 第24-26页 |
| ·本章小结 | 第26-27页 |
| 第三章 CLUSTAL 算法解析 | 第27-45页 |
| ·CLUSTAL 背景及介绍 | 第27页 |
| ·CLUSTAL 算法描述 | 第27-40页 |
| ·两两比对 | 第28-31页 |
| ·构建向导树 | 第31-36页 |
| ·渐进比对 | 第36-40页 |
| ·CLUSTALW 对 CLUSTAL 的优化 | 第40-44页 |
| ·本章小结 | 第44-45页 |
| 第四章 CLUSTAL 算法优化 | 第45-51页 |
| ·E.UKK-FA 优化算法 | 第45-46页 |
| ·快速 NJ 法构建向导树 | 第46-49页 |
| ·本章小结 | 第49-51页 |
| 第五章 实验结果及分析 | 第51-55页 |
| 第六章 总结与展望 | 第55-57页 |
| 致谢 | 第57-59页 |
| 参考文献 | 第59-61页 |