序列比对算法CLUSTAL解析及优化
摘要 | 第1-4页 |
Abstract | 第4-7页 |
第一章 绪论 | 第7-17页 |
·引言 | 第7-8页 |
·生物信息学中的多序列比对问题概述 | 第8-15页 |
·生物序列比对背景 | 第8-11页 |
·多序列比对问题研究及现状 | 第11-15页 |
·论文研究的方法和内容 | 第15-17页 |
第二章 双序列比对问题及算法研究 | 第17-27页 |
·序列数据库 | 第17-19页 |
·序列相似性与同源性 | 第19-20页 |
·最长公共子序列 | 第20-21页 |
·全局比对与局部比对 | 第21-22页 |
·权重矩阵与空位罚分 | 第22-24页 |
·双序列比对问题算法研究 | 第24-26页 |
·本章小结 | 第26-27页 |
第三章 CLUSTAL 算法解析 | 第27-45页 |
·CLUSTAL 背景及介绍 | 第27页 |
·CLUSTAL 算法描述 | 第27-40页 |
·两两比对 | 第28-31页 |
·构建向导树 | 第31-36页 |
·渐进比对 | 第36-40页 |
·CLUSTALW 对 CLUSTAL 的优化 | 第40-44页 |
·本章小结 | 第44-45页 |
第四章 CLUSTAL 算法优化 | 第45-51页 |
·E.UKK-FA 优化算法 | 第45-46页 |
·快速 NJ 法构建向导树 | 第46-49页 |
·本章小结 | 第49-51页 |
第五章 实验结果及分析 | 第51-55页 |
第六章 总结与展望 | 第55-57页 |
致谢 | 第57-59页 |
参考文献 | 第59-61页 |