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榛子花芽转录组文库的Solexa测序及冷调节基因的表达谱分析

摘要第1-7页
Abstract第7-19页
第一章 绪论第19-36页
   ·引言第19-31页
     ·研究背景第19-22页
     ·国内外植物抗寒研究现状第22-29页
     ·第二代高通量测序技术第29-31页
   ·研究目的和意义第31-33页
   ·研究目标和主要研究内容第33-35页
     ·研究基础第33页
     ·研究目标第33-34页
     ·主要研究内容第34-35页
   ·研究技术路线第35-36页
第二章 平榛花芽转录组文库的构建及Solexa 测序第36-65页
   ·试验材料第37-38页
     ·植物材料第37-38页
     ·生化试剂第38页
   ·试验方法第38-44页
     ·平榛花芽的转录组样品测序第38-42页
     ·转录组冷调节基因的筛选第42-44页
   ·结果与分析第44-52页
     ·RNA 提取第44-45页
     ·原始测序数据产量第45-46页
     ·中级分析结果第46-47页
     ·高级分析结果第47页
     ·Scaffold-gene 的GO 分类第47页
     ·蛋白功能和分类预测第47-49页
     ·Scaffold-gene 代谢通路分析第49-51页
     ·Unigenes 注释第51-52页
   ·冷调节基因的筛选及表达分析第52-64页
     ·冷调节基因的筛选第52-61页
     ·荧光定量分析假定平榛冷调节基因在冷适应过程中的表达第61-62页
     ·假定冷调节基因在不同榛属植物间的表达差异第62-63页
     ·筛选的假定冷调节基因在低温胁迫不同时间的表达差异第63-64页
   ·小结第64-65页
第三章 平榛基因表达分析中稳定内参的选择第65-69页
   ·试验材料第65-66页
   ·试验方法第66页
     ·设计持家基因引物第66页
     ·半定量分析持家基因的表达谱第66页
   ·结果与分析第66-67页
   ·小结第67-69页
第四章 CBF 基因的克隆及功能鉴定第69-87页
   ·材料与方法第69-75页
     ·试验材料第69页
     ·主要试剂第69页
     ·主要仪器第69-70页
     ·实验流程第70-75页
   ·结果与分析第75-86页
     ·平榛ChCBF1 cDNA 全长的获得及序列分析第75-76页
     ·平榛ChCBF1 在不同冷适应时期花芽中的表达分析第76-77页
     ·平榛叶片CBF1 响应低温胁迫的的荧光定量PCR 分析第77页
     ·ChCBF1 在平榛不同组织的表达第77-78页
     ·平榛ChCBF2 cDNA 全长的获得及序列分析第78-80页
     ·ChCBF2 编码氨基酸区段的同源性分析及系统进化发育第80-82页
     ·平榛ChCBF2 在花芽不同冷适应时期的表达分析第82-83页
     ·平榛CBF2 在4℃低温处理不同时间叶片中的荧光定量PCR 分析第83页
     ·ChCBF2 在平榛不同组织的表达第83-84页
     ·半定量分析CBF2 在两种榛属植物中的差异表达第84页
     ·榛属植物间CBF2 基因的序列多态性第84-85页
     ·CBF2-GFP 融合蛋白在洋葱表皮中的表达第85-86页
   ·小结第86-87页
第五章 DHN 基因家族成员DHN1 和DHN2 的分子克隆及功能分析第87-119页
   ·试验材料第87页
   ·试验方法第87-97页
     ·ChDHN 基因的克隆第87-88页
     ·qRT-PCR 分析ChDHN 基因的时空表达第88页
     ·pET-30a(+)-DHN2 原核表达载体的构建第88-89页
     ·E.coli BL21 原核表达的诱导第89页
     ·聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)第89-90页
     ·Western blotting 鉴定融合质粒的表达第90-92页
     ·诱导表达pET-30a(+)-DHN2Y 的大肠杆菌耐低温鉴定第92页
     ·基因组DNA 的提取第92页
     ·启动子序列的分离第92-94页
     ·启动子序列分析第94页
     ·转录起始位点的确定第94页
     ·植物表达载体的构建第94-95页
     ·农杆菌介导的烟草的转化第95-96页
     ·转基因株系的PCR 鉴定第96页
     ·转基因烟草生理指标的测定第96-97页
   ·结果与分析第97-117页
     ·DHN1 的克隆及序列分析第97-99页
     ·DHN1 基因组DNA 的克隆第99-100页
     ·ChDHN1 基因的时空表达第100页
     ·平榛ChDHN2 cDNA 全长的获得及序列分析第100-102页
     ·ChDHN2 的时空表达分析第102-103页
     ·重组质粒pET-30a(+)-DHN2Y 的成功构建第103-104页
     ·SDS-PAGE 电泳和Western blot 分析第104-105页
     ·Western blot 检测重组融合蛋白反应原性第105-106页
     ·异源表达DHN2 基因提高大肠杆菌在低温下的生存能力第106页
     ·DHN1 启动子的克隆及分析第106-109页
     ·DHN2 基因组序列的克隆第109页
     ·ChDHN2 启动子的TAIL-PCR 扩增第109-111页
     ·榛属植物间DHN2 序列的差异第111-112页
     ·植物表达载体PBI121-DHN2Q 的构建第112页
     ·转基因植株的获得及RT-PCR 鉴定第112-113页
     ·转基因株系的表型观察第113-115页
     ·低温处理下野生型和转基因烟草的生理指标差异第115-117页
   ·小结第117-119页
第六章 讨论第119-123页
   ·木本植物抗寒研究的取材第119页
   ·转录组测序和RACE 的结合为挖掘有价值基因搭建了一个强有力的的技术平台第119-120页
   ·转录因子和下游功能基因的表达特点第120-122页
   ·榛属植物冷调节网络模型的构建第122-123页
第七章 结论及进一步研究的设想第123-124页
   ·结论第123页
   ·进一步研究的设想第123-124页
参考文献第124-136页
附录第136-149页
缩略词第149-150页
在读期间的学术研究第150-151页
致谢第151页

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