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分子模拟方法研究唾液酸酶与植物源抑制剂间的作用机制

摘要第1-5页
Abstract第5-9页
1 绪论第9-15页
   ·引言第9-10页
   ·黄芩植物化学成分和药理作用的研究概况第10-12页
   ·流感病毒及唾液酸酶介绍第12-14页
     ·流感病毒第12页
     ·唾液酸酶第12-13页
     ·唾液酸酶活性腔和现有唾液酸酶抑制剂的结构信息第13-14页
   ·本论文涉及到的研究内容、研究目的和研究意义第14-15页
     ·研究方法和内容第14页
     ·研究目的第14页
     ·研究意义第14-15页
2 理论计算方法简介第15-31页
   ·分子对接第15-21页
     ·分子对接定义及其热力学过程第15-16页
     ·分子对接的基本原理第16页
     ·配体与受体识别过程中的相互作用第16-18页
     ·分子对接的分类第18页
     ·分子对接的一般步骤第18-19页
     ·分子对接软件简介第19-21页
   ·蒙特卡罗基本思想第21-22页
   ·分子力学第22-27页
     ·分子力场第22-26页
     ·分子力学基本思想第26页
     ·分子力学优化算法第26-27页
   ·分子动力学第27-31页
     ·分子动力学基本原理第27-28页
     ·分子动力学几种常用积分算法第28-29页
     ·分子动力学统计系综第29-31页
3 唾液酸酶内Ca~(2+)和结合水对酶活性腔的影响第31-48页
   ·计算方法第31-36页
     ·体系准备第32-34页
     ·分子对接第34-35页
     ·结果分析第35-36页
   ·模拟结果和讨论第36-47页
     ·杂原子对唾液酸酶活性腔结构的影响第36-41页
     ·杂原子对唾液酸酶活性腔性质的影响第41-44页
     ·不同唾液酸酶结构与底物BA结合模式分析第44-46页
     ·唾液酸结构、性质变化对底物BA结合模式的影响第46-47页
   ·本章小结第47-48页
4 唾液酸酶抑制剂生物活性构象研究第48-59页
   ·计算方法第48-52页
     ·量子化学计算第48-49页
     ·唾液酸酶结构优化第49-50页
     ·分子对接第50页
     ·分子动力学模拟第50-51页
     ·结果分析第51-52页
   ·结果和讨论第52-58页
     ·BA构象转化第52-54页
     ·对接模型分析第54-58页
   ·本章小结第58-59页
5 唾液酸酶与5,7,4′-三羟基-8-甲氧基黄酮相互作用研究第59-68页
   ·分子对接方法第59-61页
     ·体系准备第59-60页
     ·分子对接第60-61页
     ·对接结果分析第61页
   ·分子模拟结果第61-66页
     ·MF与N9亚型唾液酸酶的分子对接第61-64页
     ·MF与N1亚型唾液酸酶的分子对接第64-66页
     ·MF应用前景分析第66页
   ·本章小结第66-68页
结论第68-70页
参考文献第70-78页
攻读学位期间发表的学术论文第78-79页
致谢第79-80页

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