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棉花分子生物学数据库构建及其应用

摘要第1-5页
Abstract第5-9页
1 引言第9-14页
   ·生物信息学简介第9页
   ·计算机在生物信息学中的应用第9-10页
   ·生物信息学常用软件第10页
   ·重要生物信息学数据库简介第10-12页
   ·ESTs简介第12页
   ·本研究的目的与意义第12-14页
2 数据库系统的设计及其应用第14-31页
   ·棉花 EST数据库的构建第14-16页
     ·棉花 ESTs的来源和处理第14页
     ·棉花 EST序列格式第14-15页
     ·挑选棉花 EST序列程序第15页
     ·棉花 EST数据库的数据录入第15-16页
   ·其它棉花序列数据库的建立第16页
   ·参照数据库的建立第16-17页
   ·构建棉花分子生物学数据库系统第17-20页
     ·数据库开发环境第17-19页
     ·棉花分子生物学数据库系统的构建第19-20页
   ·wwwBLAST程序本地化实现第20-24页
     ·本地化 wwwBLAST软件的安装第20-21页
     ·本地化 BLAST系统的使用第21-23页
     ·本地 wwwBLAST软件的配置第23-24页
     ·BLAST分析环境的使用第24页
   ·核酸序列电子自动延伸系统的建立第24-27页
     ·电子延伸的生物信息学策略第25页
     ·电子延伸程序设计第25-27页
   ·陆地棉、亚洲棉和雷蒙德氏棉的 ESTs同源性比较第27-31页
     ·三个棉种 ESTs的 GC含量分析第27-29页
     ·三个棉种 ESTs的功能分析第29-30页
     ·三个棉种 ESTs的保守性分析第30页
     ·三个棉种 ESTs中的唯一序列识别第30-31页
3 结果与分析第31-41页
   ·棉花分子生物学数据库系统第31-34页
   ·棉花遗传育种研究室网站构建第34-35页
   ·本地化 BLAST检索系统第35-37页
   ·核酸序列电子自动延伸系统第37-38页
   ·陆地棉、亚洲棉和雷蒙德氏棉的 ESTs同源性比较第38-41页
     ·三个棉种 ESTs的 GC含量分析第38-39页
     ·三个棉种 ESTs的功能分析第39-40页
     ·三个棉种 ESTs的保守性分析第40页
     ·三个棉种 ESTs中的唯一序列识别第40-41页
4 讨论第41-44页
   ·计算机硬件对本研究的影响第41-42页
   ·电子自动延伸系统的影响因素第42页
   ·问题与展望第42-44页
5 结论第44-45页
参考文献第45-49页
在读期间发表的学术论文第49-50页
作者简历第50-51页
致谢第51页

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