| 摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 第一章 引言 | 第10-26页 |
| 一 DNA条形码综述 | 第10-15页 |
| 1 DNA条形码研究的发展历史 | 第10-11页 |
| 2 DNA条形码的原理 | 第11页 |
| 3 DNA条形码研究的优势 | 第11-13页 |
| 4 DNA条形码的研究进展 | 第13-15页 |
| ·DNA条形码在不同类群中的研究 | 第13-14页 |
| ·DNA条形码数据库建设的进展 | 第14页 |
| ·DNA条形码进行物种鉴定的部分研究结论 | 第14-15页 |
| 二 东亚特有鲤科鱼类研究综述 | 第15-18页 |
| 1 东亚鲤科鱼类综述 | 第15-16页 |
| ·物种多样性 | 第15页 |
| ·区系组成 | 第15-16页 |
| 2 东亚特有鲤科类群的定义及范围 | 第16-18页 |
| 三 分子进化与分子系统学 | 第18-24页 |
| 1 分子进化模型与序列分歧度计算 | 第18-21页 |
| ·核苷酸序列进化模型 | 第18-19页 |
| ·Jukes-Cantor单参数模型 | 第18-19页 |
| ·Kimura二参数模型 | 第19页 |
| ·蛋白质编码序列进化 | 第19-20页 |
| ·核苷酸序列分歧度 | 第20-21页 |
| 2 分子系统学 | 第21-22页 |
| ·基本原理 | 第21页 |
| ·系统树 | 第21-22页 |
| 3 分子系统树的构建 | 第22-24页 |
| ·距离矩阵法 | 第22-23页 |
| ·算术平均的不加权对群法（UPGMA） | 第23页 |
| ·邻接法（NJ） | 第23页 |
| ·最大简约法 | 第23-24页 |
| ·最大似然法 | 第24页 |
| 四 本论文研究目的 | 第24-26页 |
| 第二章 材料与方法 | 第26-38页 |
| 一 实验所用标本 | 第26-30页 |
| 二 实验器材 | 第30页 |
| 三 实验方法 | 第30-35页 |
| 1 基因组DNA的提取 | 第30-33页 |
| 2 PCR扩增 | 第33-34页 |
| 3 PCR产物回收 | 第34-35页 |
| 4 基因测序 | 第35页 |
| 四 数据分析 | 第35-38页 |
| 1 序列的对位排列 | 第35页 |
| 2 序列的初步分析 | 第35-36页 |
| 3 系统发育分析 | 第36-38页 |
| ·邻接法（NJ） | 第36页 |
| ·最大简约法（MP） | 第36-37页 |
| ·最大似然法（ML） | 第37页 |
| ·贝叶斯法（BI） | 第37-38页 |
| 第三章 结果和讨论 | 第38-76页 |
| 一 基于CO1 基因的鲌属鱼类DNA条形码研究 | 第39-44页 |
| 1 研究结果 | 第39-42页 |
| ·CO1 基因序列特征及其变异 | 第39-40页 |
| ·分子系统树 | 第40-42页 |
| 2 讨论 | 第42-44页 |
| 二 鲌亚科鱼类DNA条形码研究 | 第44-62页 |
| 1 研究结果 | 第44-57页 |
| ·序列变异情况 | 第44-48页 |
| ·遗传距离分析 | 第48-52页 |
| ·系统发育关系 | 第52-57页 |
| 2 讨论 | 第57-62页 |
| ·CO1 基因序列进行物种鉴定的标准 | 第57-58页 |
| ·CO1 基因与1651RNA基因、rp57 基因和RAG2 基因变异度的比较 | 第58页 |
| ·鲌亚科物种DNA条形码可行性分析 | 第58-60页 |
| ·DNA条形码介导的新种发现 | 第60-61页 |
| ·DNA条形码数据库的建立 | 第61-62页 |
| 三 东亚特有鲤科类群的系统发育研究 | 第62-76页 |
| 1 研究结果 | 第63-72页 |
| ·序列变异情况 | 第63-67页 |
| ·系统发育结果 | 第67-72页 |
| 2 讨论 | 第72-76页 |
| ·DNA序列变异和遗传分析 | 第72页 |
| ·东亚特有鲤科鱼类的单系性研究 | 第72-73页 |
| ·东亚特有鲤科类群间的系统发育关系 | 第73-76页 |
| 第四章 结论 | 第76-77页 |
| 参考文献 | 第77-84页 |
| 已发表文章 | 第84-85页 |
| 致谢 | 第85页 |