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鸡MHC-B-F基因外显子2、3的群体遗传结构和系统发育关系分析

中文摘要第1-7页
英文摘要第7-12页
1. 文献综述第12-24页
   ·MHC的研究背景第12-13页
   ·鸡MHC基因的结构特征第13-19页
     ·鸡MHC I类抗原分子及基因(B-F)的结构第14-16页
     ·鸡MHC II类抗原分子及基因(B-L)的结构第16-17页
     ·鸡MHC IV类抗原分子及基因(B-G)的结构第17-19页
     ·鸡MHC基因的长度与数量及其多态性第19页
   ·鸡MHC基因的功能第19-20页
   ·鸡MHC基因与疾病抗性第20-22页
     ·鸡MHC与马立克氏病抗性的关系第20-21页
     ·鸡MHC与劳氏瘤病(RS)抗性的关系第21页
     ·鸡MHC与其他病毒病抗性的关系第21-22页
     ·鸡MHC与细菌性传染病抗性的关系第22页
   ·MHC基因的遗传特点第22-23页
     ·单倍型遗传第22-23页
     ·高度多态性第23页
     ·连锁不平衡第23页
   ·SNP研究综述第23-24页
   ·本试验研究的目的和意义第24页
2. 材料和方法第24-31页
   ·试验材料第24-27页
     ·试验样品第24页
     ·主要仪器设备第24-25页
     ·引物来源与合成第25页
     ·主要试剂及配制第25-27页
   ·试验方法第27-30页
     ·总DNA的提取第27页
     ·DNA浓度和纯度的检测第27页
     ·目的基因的扩增第27-29页
     ·PCR产物的检测第29-30页
     ·PCR产物的回收纯化第30页
     ·PCR产物序列测定第30页
   ·数据分析第30-31页
3. 试验结果第31-47页
   ·基因组DNA抽提结果第31页
   ·PCR扩增结果第31-32页
     ·引物1PCR产物的扩增结果第31-32页
     ·引物2PCR产物的扩增结果第32页
   ·扩增序列的测序结果第32页
   ·鸡MHC-B-F基因外显子2和3的遗传多态性第32-37页
     ·MHC-B-F基因外显子2和3的碱基组成第32-33页
     ·MHC-B-F基因外显子2和3的核苷酸多态位点变异第33-36页
     ·MHC-B-F基因外显子2和3的核苷酸多态位点变异类型第36-37页
   ·鸡MHC-B-F基因外显子2和3的遗传结构第37-40页
     ·品种内单倍型多样度第37页
     ·品种内MHC-B-F基因外显子2和3的核苷酸多样度第37-39页
     ·品种内和品种间的遗传距离第39-40页
   ·鸡MHC-B-F基因外显子2和3氨基酸序列变异的分析第40-44页
     ·氨基酸的组成含量分析第40-41页
     ·氨基酸位点的变异分析第41-44页
   ·鸡MHC-B-F基因外显子2和3的分子系统发育分析第44-47页
     ·MHC-B-F基因外显子的分子系统发育分析第44页
     ·MHC-B-F基因外显子3的分子系统发育分析第44-47页
4. 讨论与分析第47-50页
   ·鸡MHC-B-F基因的遗传结构和多态性分析第47-48页
   ·鸡MHC-B-F基因在品种间的遗传分化第48页
   ·鸡MHC-B-F基因的氨基酸序列分析第48-49页
   ·四个品种鸡MHC-B-F基因的分子系统发育分析第49-50页
5. 结论第50-51页
参考文献第51-57页
致谢第57-58页
附录1:MHC-B-F基因外显子2的测序图第58-59页
附录2:MHC-B-F基因外显子3的测序图第59-60页
附录3:攻读学位期间发表的论文第60页

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