| 中文摘要 | 第1-10页 |
| 英文摘要 | 第10-12页 |
| 第一章 前言 | 第12-36页 |
| ·好氧不产氧光合细菌的研究进展 | 第12-24页 |
| ·海洋环境微生物遗传多样性的研究方法 | 第24-34页 |
| ·本论文的研究思路、意义及内容 | 第34-36页 |
| 第二章 材料与方法 | 第36-48页 |
| ·材料 | 第36-41页 |
| ·基本方法 | 第41-48页 |
| 第三章 代表性海区 AAPB 光合基因多样性分析 | 第48-79页 |
| ·代表性海区表层海水 AAPB 光合基因多样性分 | 第48-59页 |
| ·台湾海峡厦门站位（XM）AAPB 光合基因多样性分析 | 第48-50页 |
| ·东海表层（ECS-P6-s 站位）AAPB 光合基因多样性分析 | 第50-53页 |
| ·北太平洋Gyre（NPG-w24 和NPG-w26 站位）AAPB 光合基因多样性分析 | 第53页 |
| ·东北太平洋（NPO-pf1 站位）AAPB 光合基因多样性分析 | 第53-56页 |
| ·白令海（BS-6102 站位）AAPB 光合基因多样性分析 | 第56-58页 |
| ·讨论 | 第58-59页 |
| ·东海垂直剖面（ECS-P6 站位）透光度对 AAPB 光合基因多样性的影响分析 | 第59-66页 |
| ·东海50%透光层（ECS-P6-8m）AAPB 光合基因多样性分析 | 第59-61页 |
| ·东海30%透光层（ECS-P6-14m）AAPB 光合基因多样性分析 | 第61页 |
| ·东海30%透光层（ECS-P6-35m）AAPB 光合基因多样性分析 | 第61-64页 |
| ·透光度对 AAPB 光合基因多样性的影响分析 | 第64-66页 |
| ·海区环境对 AAPB 光合基因各类群的分布及进化的影响 | 第66-77页 |
| ·不同海区环境中属于α-3 Protebacteria AAPB 的pufM 基因分布特征 | 第66-69页 |
| ·不同海区环境中属于α-4 Protebacteria AAPB 的pufM 基因分布特征 | 第69-71页 |
| ·在有氧海区大量类似属于γ-Proteobateria AAPB 的pufM 基因的发现 | 第71-77页 |
| ·小结与讨论 | 第77-79页 |
| 第四章 实时荧光定量 PCR 定量海洋中 AAPB 的丰度 | 第79-91页 |
| ·实时荧光定量 PCR 定量海洋环境中 AAPB 的丰度的意义 | 第79-80页 |
| ·实时荧光定量 PCR 结果分析 | 第80-87页 |
| ·环境样品DNA的得率 | 第80-81页 |
| ·实时定量PCR扩增的特异性 | 第81-82页 |
| ·标准曲线和qPCR的灵敏性 | 第82-83页 |
| ·熔链曲线的分析 | 第83-84页 |
| ·pufM基因克隆文库的多样性分析 | 第84-86页 |
| ·qPCR定量海洋环境中的AAPB丰度 | 第86-87页 |
| ·讨论 | 第87-91页 |
| 第五章 结论与展望 | 第91-93页 |
| ·结论 | 第91-92页 |
| ·展望 | 第92-93页 |
| 参考文献 | 第93-101页 |
| 硕士期间完成的论文 | 第101-102页 |
| 致谢 | 第102页 |
