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ADTZ密码子的优化以及重组表达质粒pNOA的构建

摘要第1-9页
Abstract第9-5页
目录第5-11页
一.前言第11-19页
   ·黄曲霉毒素简介第11-13页
     ·黄曲霉毒素的化学结构第11-12页
     ·黄曲霉毒素的生物合成第12-13页
     ·黄曲霉毒素的危害第13页
   ·黄曲霉毒素去毒化的研究进展第13-14页
   ·巴斯德毕赤酵母菌表达系统的简介第14-16页
     ·毕赤酵母菌第14-15页
     ·分泌型表达载体pPICzaA第15-16页
   ·密码子偏好性与外源蛋白表达第16-17页
   ·基因合成技术第17页
   ·实验思路和目的第17-19页
二.实验设备及材料第19-23页
   ·主要仪器设备第19页
   ·实验材料第19-23页
     ·菌种及载体第19页
     ·酶类第19-20页
     ·试剂盒第20页
     ·常用试剂第20页
     ·分子量参照物第20页
     ·培养基第20-21页
     ·试剂与母液配制第21-23页
三.实验方法第23-48页
   ·Armillariella tabescens与Pichia Pastoris密码子偏好性图示及ADTZ’5’末端部分序列Opt-A的密码子优化第23-24页
   ·优化后N-Opt-ADTZ序列获得设讨第24-27页
     ·Two-step DNA synthesis method原理图第25页
     ·Two-step DNA synthesis method引物的设计第25-27页
   ·Two-step DNA synthesis method合成优化片段Opt-A’实验步骤第27-39页
  Ⅰ.One-Step第27-36页
     ·1~(st) PCR扩增DNA片段第27-29页
     ·2~(rd) PCR扩增DNA片段第29-31页
     ·PCR产物切胶回收第31-32页
     ·TA克隆第32-34页
     ·测序第34-35页
     ·亚克隆DNA片段Opt-A1,Opt-A2,Opt-A3,Opt-A4以及P3。第35-36页
  Ⅱ.Two-step第36-39页
     ·PCR拼接DNA片段Opt-A’第36-38页
     ·切胶回收PCR产物第38页
     ·TA克隆第38页
     ·测序第38-39页
   ·回复突变实验第39-41页
     ·回复突变引物设计第39页
     ·实验流程第39-41页
     ·切胶回收PCR产物第41页
   ·PCR扩增密码子未优化DNA片段ADTZ-B第41-42页
     ·引物设计第41页
     ·PCR扩增第41-42页
     ·切胶回收PCR产物第42页
   ·Gene SOEing法拼接优化后的完整阅读框序列N-Opt-ADTZ第42-45页
     ·Gene SOEing图示第42页
     ·引物设计第42-43页
     ·The 1~(st) PCR扩增DNA片段N-Opt-ADTZ第43页
     ·The 2~(rd) PCR扩增DNA片段N-Opt-ADTZ第43-44页
     ·切胶回收2~(rd)PCR产物第44-45页
   ·重组质粒pPICzaA_N-Opt-ADTZ(以下简称pNOA)的构建第45-48页
     ·pPICzaA质粒图谱第45页
     ·EcoR I和Not I双酶切DNA片段N-Opt-ADTZ,载体pPICzaA第45-46页
     ·质粒pPICzaA和目的基因N-Opt-ADTZ的连接第46页
     ·CaCl_2法制备E.coli Top10F’感受态细胞,操作参照3.3.4.3第46页
     ·转化Top10F’感受态细胞第46页
     ·碱提质粒第46-47页
     ·酶切鉴定重组质粒pNOA第47页
     ·测序第47-48页
四.实验结果第48-68页
   ·优化后N-Opt-ADTZ理论序列第48-49页
     ·核酸序列第48-49页
     ·蛋白序列第49页
   ·Two-step DNA synthesis产物结果第49-60页
     ·one-step PCR产物电泳检测第49-51页
     ·DNA片段P3,Opt-A1,2,3,4与pMD_19T构建重组质粒酶切鉴定图第51-52页
     ·PCR扩增DNA片段P3,Opt-A1,2,3,4的测序结果第52-58页
     ·DNA片段P3,Opt-A1,2,3,4亚克隆PCR电泳检测第58-59页
     ·two-step PCR产物电泳检测第59-60页
   ·DNA片段Opt-A’与pMD_19T构建重组质粒酶切鉴定图第60-61页
   ·DNA片段Opt-A’序列结果第61-62页
     ·DNA片段Opt-A’测序结果第61页
     ·DNA片段Opt-A’测序结果去除载体序列第61-62页
   ·PCR扩增ADTZ-B结果电泳检测第62-63页
   ·回复突变PCR扩增DNA片段Opt-A’1和Opt-A’2结果电泳检测第63页
   ·Gene SOEing PCR扩增N-Opt-ADTZ结果电泳检测第63-64页
   ·重组质粒pNOA酶切鉴定图第64-65页
   ·DNA片段N-Opt-ADTZ测序结果第65-68页
     ·DNA片段N-Opt-ADTZ测序结果第65-66页
     ·DNA片段N-Opt-ADTZ测序结果去除载体序列第66-68页
五.讨论第68-72页
   ·ADTZ密码子优化中的问题第68页
   ·密码子改造方法的选择第68页
   ·Two-step DNA synthesis method引物设计第68-69页
   ·Two-step DNA synthesis过程中的问题第69-70页
   ·回复突变的使用第70-72页
六.结论与展望第72-73页
参考文献第73-77页
致谢第77-78页
附录Ⅰ第78-86页

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