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传染性法氏囊病病毒浙江分离株(TL2004)全基因组的克隆及生物信息学分析

摘要第1-9页
ABSTRACT第9-11页
第一部分 文献综述第11-36页
 第一章 传染性法氏囊病病毒研究进展第12-36页
  1 IBDV的一般生物学特征第12-13页
   ·IBDV的分类和地位第12页
   ·IBDV的理化特性第12页
   ·IBDV的细胞培养特征第12-13页
   ·IBDV的流行病学特征第13页
  2 IBDV的分子生物学特征第13-27页
   ·IBDV的形态与结构第13-15页
   ·IBDV的基因组结构及编码的蛋白第15-22页
     ·基因组非编码区第15-16页
     ·IBDV的基因组编码区第16-22页
   ·IBDV抗原与毒力变异的分子机制第22-24页
   ·IBDV的复制和繁殖第24-25页
   ·IBDV新型疫苗的研究第25-27页
     ·IBDV基因工程疫苗的研究第25-27页
     ·IBDVDNA疫苗的研究第27页
  3 IBDV的检测技术第27-29页
   ·ELISA检测技术第28页
   ·PCR检测技术第28-29页
  参考文献第29-36页
第二部分 研究内容第36-68页
 第一章 染性法氏囊病病毒野毒株的分离及鉴定第37-42页
  1 材料第37-38页
   ·病料及处理第37-38页
   ·标准IBD阳性抗原和血清第38页
  2 方法第38页
   ·琼脂免疫扩散试验第38页
   ·鸡胚接种及传代第38页
   ·电镜观察第38页
   ·组织病理学观察第38页
  3 结果第38-40页
   ·琼脂扩散试验第38-39页
   ·病毒对鸡胚的致病性第39页
   ·组织病理学观察结果第39-40页
   ·电镜观察结果第40页
  4 讨论第40-41页
  参考文献第41-42页
 第二章 传染性法氏囊病病毒(TL2004株)全基因组的克隆第42-52页
  1 材料第42-43页
   ·质粒与菌株第42-43页
   ·试验用毒株第43页
   ·主要试剂第43页
   ·主要仪器第43页
  2 方法第43-47页
   ·IBDV基因组的提取与纯化第43-44页
     ·蛋白酶K法提取TL2004株基因组RNA第43页
     ·病毒dsRNA的纯化第43-44页
   ·引物设计和合成第44页
   ·Long-accurate RT-PCR扩增基因组全长cDNA第44-45页
     ·Long-accurate RT-PCR扩增基因组A节段全长cDNA第44页
     ·Long-accurate RT-PCR扩增基因组A节段全长cDNA第44-45页
   ·IBDV基因组A节段全长cDNA的克隆策略第45-47页
     ·感受态细胞的制备第45页
     ·低熔点胶回收PCR产物第45页
     ·连接反应第45-46页
     ·转化第46页
     ·提取质粒DNA第46页
     ·基因组A和B节段全长cDNA限制性酶切第46-47页
     ·重组质粒的PCR鉴定第47页
   ·序列测定第47页
  3 结果第47-50页
   ·病毒基因组的提取第47页
   ·IBDV基因组A和B节段的克隆与鉴定第47-48页
     ·LA-PCR扩增基因组A节段全长cDNA第47-48页
     ·LA-PCR扩增基因组B节段全长cDNA第48页
   ·IBDV全基因组的克隆第48-50页
     ·IBDV全基因组A节段全长的克隆第48-49页
     ·IBDV全基因组B节段全长的克隆第49-50页
  4 讨论第50-51页
  参考文献第51-52页
 第三章 传染性法氏囊病病毒(TL2004株)基因组全长的生物信息学分析第52-68页
  1 材料和方法第53页
  2 结果第53-64页
   ·全基因组5’-NCR和3’-NCR第53-57页
   ·VP1蛋白毒力位点的分析第57-58页
   ·ORF2及编码的VP5蛋白第58-60页
   ·多聚蛋白VP2/VP4/VP3第60-61页
   ·进化树分析第61-64页
  3 讨论第64-66页
   ·IBDV A节段和B节段5’-NCR和3’-NCR的结构与功能第64页
   ·关于IBDV抗原变异和毒力变异的分子基础第64-66页
   ·关于TL2004株与其它毒株的亲缘关系分析第66页
  参考文献第66-68页
附录1 常用试剂及材料第68-71页
附录2 硕士期间发表或录用论文第71-72页
附 重组共表达载体PIL-18-IRES-IL-2的构建及在CEF细胞中的表达第72-78页
 1 材料第74页
   ·质粒和菌株第74页
   ·主要试剂第74页
 2 方法第74-75页
   ·引物设计第74页
   ·CEF制备第74页
   ·真核共表达质粒pIL-18-IRES-IL-2的构建第74-75页
   ·重组质粒的细胞转染及表达第75页
 3 结果第75-77页
   ·引物设计和PCR扩增目的基因第75-76页
   ·真核共表达质粒pIL-18-IRES-IL-2的构建第76页
   ·RT-PCR检测基因转录第76页
   ·真核共表达质粒在CEF细胞中的瞬时表达第76-77页
 4 讨论第77-78页
参考文献第78-79页
附录3 致谢第79页

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