摘要 | 第1-7页 |
Abstract | 第7-13页 |
第一章 顺磁弛豫综述 | 第13-43页 |
·简介 | 第13-16页 |
·生物大分子结构和动力学研究中常用的顺磁探针 | 第16-21页 |
·与蛋白质结合的顺磁探针 | 第17页 |
·与核酸结合的顺磁探针 | 第17-18页 |
·顺磁共溶质分子 | 第18-21页 |
·顺磁NMR参数 | 第21-25页 |
·各向同性和各向异性的未成对电子系统 | 第21页 |
·直接偶极-偶极相互作用导致的PRE | 第21-22页 |
·居里自旋弛豫导致的PRE | 第22-23页 |
·赝接触化学位移 | 第23页 |
·残留偶极耦合 | 第23页 |
·SB “model-free”扩展形式 | 第23-25页 |
·测定PRE 1HN-Γ2 的脉冲序列 | 第25-28页 |
·“峰强度变化”测定法 | 第25-26页 |
·“eight-time-point”测定法 | 第26页 |
·“two-time-point”测定法 | 第26-28页 |
·PRE应用实例 | 第28-34页 |
·Protein-DNA相互作用靶搜索过程 | 第28-32页 |
·Protein-Protein电子传递“Encounter Complexes” | 第32-34页 |
参考文献 | 第34-43页 |
第二章 ScPDCD5 溶液结构测定与主链动力学分析 | 第43-111页 |
·研究背景 | 第43-45页 |
·材料与方法 | 第45-59页 |
·实验材料 | 第45页 |
·重组质粒的构建与鉴定 | 第45-47页 |
·重组蛋白的表达与纯化 | 第47-49页 |
·沉降速率超速离心分析 | 第49页 |
·NMR实验与数据变换 | 第49-51页 |
·蛋白质主链顺序与侧链化学位移的证认 | 第51-53页 |
·蛋白质二级结构预测 | 第53-54页 |
·PRE距离约束的获得 | 第54-55页 |
·NMR结构计算 | 第55-56页 |
·Data Bank accession codes | 第56-57页 |
·NMR 滴定实验 | 第57页 |
·蛋白质主链15N弛豫实验及其实验数据的处理与分析 | 第57-59页 |
·结果与分析 | 第59-98页 |
·适合NMR结构分析的蛋白质样品 | 第59-64页 |
·N116 重组蛋白的NMR化学位移证认和蛋白质二级结构特征 | 第64-67页 |
·引入顺磁探针对蛋白质结构的扰动效应 | 第67-68页 |
·Mapping Long-range Interactions in N116 using PREs | 第68-73页 |
·N116 的NMR结构系综 | 第73-77页 |
·相似结构比较 | 第77-78页 |
·NMR化学位移干扰 | 第78-81页 |
·蛋白质主链动力学特征 | 第81-98页 |
·小结 | 第98-100页 |
参考文献 | 第100-111页 |
第三章 ScPDCD5 过表达促进H_2O_2诱发的酵母凋亡样死亡 | 第111-132页 |
·研究背景 | 第111-113页 |
·材料与方法 | 第113-116页 |
·过表达菌株的获得与培养 | 第113-114页 |
·Western Blotting | 第114-115页 |
·酵母凋亡样死亡的检测 | 第115-116页 |
·结果与分析 | 第116-121页 |
·在酵母细胞中过表达ScPDCD5 重组蛋白 | 第116页 |
·ScPDCD5 过表达不会引发酵母凋亡样死亡 | 第116-118页 |
·ScPDCD5 过表达促进H_2O_2 引发的酵母凋亡样死亡 | 第118-119页 |
·H_2O_2 引发非Yca1p依赖性的酵母凋亡样死亡 | 第119-120页 |
·Yca1p metacaspase介导ScPDCD5 过表达的部分促凋亡效应 | 第120-121页 |
·讨论 | 第121-124页 |
参考文献 | 第124-132页 |
附录 | 第132-154页 |
致谢 | 第154-155页 |
在读期间发表的学术论文与取得的研究成果 | 第155-156页 |