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ScPDCD5蛋白溶液结构、主链动力学及其功能研究

摘要第1-7页
Abstract第7-13页
第一章 顺磁弛豫综述第13-43页
   ·简介第13-16页
   ·生物大分子结构和动力学研究中常用的顺磁探针第16-21页
     ·与蛋白质结合的顺磁探针第17页
     ·与核酸结合的顺磁探针第17-18页
     ·顺磁共溶质分子第18-21页
   ·顺磁NMR参数第21-25页
     ·各向同性和各向异性的未成对电子系统第21页
     ·直接偶极-偶极相互作用导致的PRE第21-22页
     ·居里自旋弛豫导致的PRE第22-23页
     ·赝接触化学位移第23页
     ·残留偶极耦合第23页
     ·SB “model-free”扩展形式第23-25页
   ·测定PRE 1HN-Γ2 的脉冲序列第25-28页
     ·“峰强度变化”测定法第25-26页
     ·“eight-time-point”测定法第26页
     ·“two-time-point”测定法第26-28页
   ·PRE应用实例第28-34页
     ·Protein-DNA相互作用靶搜索过程第28-32页
     ·Protein-Protein电子传递“Encounter Complexes”第32-34页
 参考文献第34-43页
第二章 ScPDCD5 溶液结构测定与主链动力学分析第43-111页
   ·研究背景第43-45页
   ·材料与方法第45-59页
     ·实验材料第45页
     ·重组质粒的构建与鉴定第45-47页
     ·重组蛋白的表达与纯化第47-49页
     ·沉降速率超速离心分析第49页
     ·NMR实验与数据变换第49-51页
     ·蛋白质主链顺序与侧链化学位移的证认第51-53页
     ·蛋白质二级结构预测第53-54页
     ·PRE距离约束的获得第54-55页
     ·NMR结构计算第55-56页
     ·Data Bank accession codes第56-57页
     ·NMR 滴定实验第57页
     ·蛋白质主链15N弛豫实验及其实验数据的处理与分析第57-59页
   ·结果与分析第59-98页
     ·适合NMR结构分析的蛋白质样品第59-64页
     ·N116 重组蛋白的NMR化学位移证认和蛋白质二级结构特征第64-67页
     ·引入顺磁探针对蛋白质结构的扰动效应第67-68页
     ·Mapping Long-range Interactions in N116 using PREs第68-73页
     ·N116 的NMR结构系综第73-77页
     ·相似结构比较第77-78页
     ·NMR化学位移干扰第78-81页
     ·蛋白质主链动力学特征第81-98页
   ·小结第98-100页
 参考文献第100-111页
第三章 ScPDCD5 过表达促进H_2O_2诱发的酵母凋亡样死亡第111-132页
   ·研究背景第111-113页
   ·材料与方法第113-116页
     ·过表达菌株的获得与培养第113-114页
     ·Western Blotting第114-115页
     ·酵母凋亡样死亡的检测第115-116页
   ·结果与分析第116-121页
     ·在酵母细胞中过表达ScPDCD5 重组蛋白第116页
     ·ScPDCD5 过表达不会引发酵母凋亡样死亡第116-118页
     ·ScPDCD5 过表达促进H_2O_2 引发的酵母凋亡样死亡第118-119页
     ·H_2O_2 引发非Yca1p依赖性的酵母凋亡样死亡第119-120页
     ·Yca1p metacaspase介导ScPDCD5 过表达的部分促凋亡效应第120-121页
   ·讨论第121-124页
 参考文献第124-132页
附录第132-154页
致谢第154-155页
在读期间发表的学术论文与取得的研究成果第155-156页

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