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西萌芦ZYMV病毒抗性的转录调控研究

摘要第5-7页
Abstract第7-9页
英文缩略表第13-14页
第一章 前言第14-24页
    1.1 西葫芦病毒病的研究进展第14-15页
        1.1.1 西葫芦概述第14页
        1.1.2 西葫芦病毒病危害第14-15页
        1.1.3 危害葫芦科植物病毒第15页
        1.1.4 西葫芦病毒病的传播方式第15页
    1.2 小西葫芦黄化花叶病毒研究进展第15-18页
        1.2.1 小西葫芦黄化花叶病毒生物学特征第16页
        1.2.2 小西葫芦黄化花叶病毒的流行及危害第16-17页
        1.2.3 西葫芦ZYMV鉴定和检测技术第17-18页
        1.2.4 西葫芦ZYMV病害防治策略第18页
    1.3 病毒病的抗性机制研究进展第18-20页
    1.4 转录组深度测序技术以及优势第20-21页
    1.5 RNA干涉第21-22页
        1.5.1 RNAi概况第21页
        1.5.2 RNAi机制第21-22页
    1.6 本研究技术路线第22-23页
    1.7 研究的目的和意义第23-24页
第二章 西葫芦ZYMV抗性性状遗传规律分析第24-28页
    2.1 材料与方法第24-25页
        2.1.1 试验材料第24页
        2.1.2 试验方法第24-25页
            2.1.2.1 西葫芦ZYMV病毒病苗期接种鉴定第24-25页
            2.1.2.2 西葫芦ZYMV病毒病性状鉴定第25页
    2.2 结果与分析第25-27页
    2.3 结论与讨论第27-28页
第三章 基于RNA-Seq获得ZYMV抗病相关基因第28-51页
    3.1 材料与方法第28-35页
        3.1.1 试验材料第28页
        3.1.2 主要试剂及药品第28页
        3.1.3 主要仪器第28-29页
        3.1.4 试验方法第29-30页
            3.1.4.1 西葫芦RNA的提取第29页
            3.1.4.2 西葫芦RNA的质量检测和浓度测定第29-30页
            3.1.4.3 mRNA纯化第30页
            3.1.4.4 西葫芦RNA电泳检测第30页
        3.1.5 西葫芦转录组测序第30-33页
            3.1.5.1 反转录第30-31页
            3.1.5.2 cDNA文库构建第31页
            3.1.5.3 文库质控第31页
            3.1.5.4 上机测序第31-33页
        3.1.6 标准信息分析第33页
        3.1.7 西葫芦部分基因诱导差异表达量的qPCR分析第33-34页
        3.1.8 电泳检测分析第34-35页
    3.2 结果与分析第35-50页
        3.2.1 转录组测序样品RNA提取质量检测第35-36页
        3.2.2 转录组测序初步数据分析第36-39页
        3.2.3 Unigene的初步分析第39-41页
            3.2.3.1 Unigene编码区预测及蛋白序列第39页
            3.2.3.2 Unigene中SNP及SSR分析第39页
            3.2.3.3 Unigene中功能注释第39-41页
        3.2.4 基因表达丰度分析第41-43页
        3.2.5 ZYMV病毒诱导差异表达基因的分析第43-48页
        3.2.6 西葫芦ZYMV诱导差异表达基因的qPCR验证第48-50页
    3.3 结论与讨论第50-51页
第四章 抗病相关基因的RNAi及过表达载体的构建第51-59页
    4.1 材料与方法第51-56页
        4.1.1 实验材料第51页
        4.1.2 工具酶和主要试剂第51页
        4.1.3 生成RACE-Ready cDNA第51-53页
        4.1.4 cDNA末端快速克隆第53-54页
        4.1.5 RACE产物的确认和鉴定第54-55页
            4.1.5.1 胶纯化第54页
            4.1.5.2 RACE产物的In-Fusion克隆第54-55页
            4.1.5.3 RACE产物测序第55页
        4.1.6 表达载体的构建第55-56页
            4.1.6.1 载体构建及酶切鉴定第56页
    4.2 结果与分析第56-58页
        4.2.1 抗病相关基因CpPr1和CpGp1全长序列的克隆第56-58页
    4.3 讨论第58-59页
第五章 结论与讨论第59-62页
    5.1 结论第59-60页
    5.2 讨论第60-62页
        5.2.1 抗性性状遗传规律分析第60页
        5.2.2 转录组测序第60页
        5.2.3 抗病相关基因的功能分析第60-62页
参考文献第62-68页
致谢第68-69页
作者简介第69页

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