摘要 | 第5-7页 |
Abstract | 第7-9页 |
英文缩略表 | 第13-14页 |
第一章 前言 | 第14-24页 |
1.1 西葫芦病毒病的研究进展 | 第14-15页 |
1.1.1 西葫芦概述 | 第14页 |
1.1.2 西葫芦病毒病危害 | 第14-15页 |
1.1.3 危害葫芦科植物病毒 | 第15页 |
1.1.4 西葫芦病毒病的传播方式 | 第15页 |
1.2 小西葫芦黄化花叶病毒研究进展 | 第15-18页 |
1.2.1 小西葫芦黄化花叶病毒生物学特征 | 第16页 |
1.2.2 小西葫芦黄化花叶病毒的流行及危害 | 第16-17页 |
1.2.3 西葫芦ZYMV鉴定和检测技术 | 第17-18页 |
1.2.4 西葫芦ZYMV病害防治策略 | 第18页 |
1.3 病毒病的抗性机制研究进展 | 第18-20页 |
1.4 转录组深度测序技术以及优势 | 第20-21页 |
1.5 RNA干涉 | 第21-22页 |
1.5.1 RNAi概况 | 第21页 |
1.5.2 RNAi机制 | 第21-22页 |
1.6 本研究技术路线 | 第22-23页 |
1.7 研究的目的和意义 | 第23-24页 |
第二章 西葫芦ZYMV抗性性状遗传规律分析 | 第24-28页 |
2.1 材料与方法 | 第24-25页 |
2.1.1 试验材料 | 第24页 |
2.1.2 试验方法 | 第24-25页 |
2.1.2.1 西葫芦ZYMV病毒病苗期接种鉴定 | 第24-25页 |
2.1.2.2 西葫芦ZYMV病毒病性状鉴定 | 第25页 |
2.2 结果与分析 | 第25-27页 |
2.3 结论与讨论 | 第27-28页 |
第三章 基于RNA-Seq获得ZYMV抗病相关基因 | 第28-51页 |
3.1 材料与方法 | 第28-35页 |
3.1.1 试验材料 | 第28页 |
3.1.2 主要试剂及药品 | 第28页 |
3.1.3 主要仪器 | 第28-29页 |
3.1.4 试验方法 | 第29-30页 |
3.1.4.1 西葫芦RNA的提取 | 第29页 |
3.1.4.2 西葫芦RNA的质量检测和浓度测定 | 第29-30页 |
3.1.4.3 mRNA纯化 | 第30页 |
3.1.4.4 西葫芦RNA电泳检测 | 第30页 |
3.1.5 西葫芦转录组测序 | 第30-33页 |
3.1.5.1 反转录 | 第30-31页 |
3.1.5.2 cDNA文库构建 | 第31页 |
3.1.5.3 文库质控 | 第31页 |
3.1.5.4 上机测序 | 第31-33页 |
3.1.6 标准信息分析 | 第33页 |
3.1.7 西葫芦部分基因诱导差异表达量的qPCR分析 | 第33-34页 |
3.1.8 电泳检测分析 | 第34-35页 |
3.2 结果与分析 | 第35-50页 |
3.2.1 转录组测序样品RNA提取质量检测 | 第35-36页 |
3.2.2 转录组测序初步数据分析 | 第36-39页 |
3.2.3 Unigene的初步分析 | 第39-41页 |
3.2.3.1 Unigene编码区预测及蛋白序列 | 第39页 |
3.2.3.2 Unigene中SNP及SSR分析 | 第39页 |
3.2.3.3 Unigene中功能注释 | 第39-41页 |
3.2.4 基因表达丰度分析 | 第41-43页 |
3.2.5 ZYMV病毒诱导差异表达基因的分析 | 第43-48页 |
3.2.6 西葫芦ZYMV诱导差异表达基因的qPCR验证 | 第48-50页 |
3.3 结论与讨论 | 第50-51页 |
第四章 抗病相关基因的RNAi及过表达载体的构建 | 第51-59页 |
4.1 材料与方法 | 第51-56页 |
4.1.1 实验材料 | 第51页 |
4.1.2 工具酶和主要试剂 | 第51页 |
4.1.3 生成RACE-Ready cDNA | 第51-53页 |
4.1.4 cDNA末端快速克隆 | 第53-54页 |
4.1.5 RACE产物的确认和鉴定 | 第54-55页 |
4.1.5.1 胶纯化 | 第54页 |
4.1.5.2 RACE产物的In-Fusion克隆 | 第54-55页 |
4.1.5.3 RACE产物测序 | 第55页 |
4.1.6 表达载体的构建 | 第55-56页 |
4.1.6.1 载体构建及酶切鉴定 | 第56页 |
4.2 结果与分析 | 第56-58页 |
4.2.1 抗病相关基因CpPr1和CpGp1全长序列的克隆 | 第56-58页 |
4.3 讨论 | 第58-59页 |
第五章 结论与讨论 | 第59-62页 |
5.1 结论 | 第59-60页 |
5.2 讨论 | 第60-62页 |
5.2.1 抗性性状遗传规律分析 | 第60页 |
5.2.2 转录组测序 | 第60页 |
5.2.3 抗病相关基因的功能分析 | 第60-62页 |
参考文献 | 第62-68页 |
致谢 | 第68-69页 |
作者简介 | 第69页 |