| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-26页 |
| 1.1 植物花器官决定基因的研究进展 | 第12-19页 |
| 1.1.1 ABCDE模型的确立 | 第12-14页 |
| 1.1.2 与花器官发育有关的主要A类基因 | 第14-15页 |
| 1.1.3 与花器官发育有关的主要B类基因 | 第15-16页 |
| 1.1.4 与花器官发育有关的主要C类基因 | 第16-17页 |
| 1.1.5 与花器官发育有关的主要D类基因 | 第17页 |
| 1.1.6 与花器官发育有关的主要E类基因 | 第17-18页 |
| 1.1.7 与花器官发育有关的其它基因 | 第18-19页 |
| 1.2 miRNA在花器官发育调控中的研究进展 | 第19-21页 |
| 1.2.1 与花器官发育有关的miR156和miR172 | 第19页 |
| 1.2.2 与花器官发育有关的miR159和miR319 | 第19-20页 |
| 1.2.3 与花器官发育有关的miR160和miR167 | 第20页 |
| 1.2.4 与花器官发育有关的miR164和miR169 | 第20页 |
| 1.2.5 与花器官发育有关的miR165和miR166 | 第20-21页 |
| 1.2.6 与花器官发育有关的miR396 | 第21页 |
| 1.3 高通量测序技术在花器官发育中的研究概况 | 第21-23页 |
| 1.3.1 转录组测序与花器官发育 | 第21-22页 |
| 1.3.2 小RNA测序与花器官发育 | 第22-23页 |
| 1.4 紫花苜蓿花器官的研究概况 | 第23-24页 |
| 1.4.1 紫花苜蓿花器官的形态与发育 | 第23-24页 |
| 1.4.2 紫花苜蓿的花器官突变体 | 第24页 |
| 1.5 本研究课题的提出 | 第24-26页 |
| 第二章 紫花苜蓿多雌蕊突变体mp1的转录组分析 | 第26-46页 |
| 2.1 引言 | 第26-27页 |
| 2.2 材料与方法 | 第27-31页 |
| 2.2.1 试验地概况 | 第27页 |
| 2.2.2 试验材料 | 第27-28页 |
| 2.2.3 总RNA提取与检测 | 第28页 |
| 2.2.4 文库构建与测序 | 第28页 |
| 2.2.5 原始读长过滤 | 第28页 |
| 2.2.6 参考序列构建与unigenes挑选 | 第28-29页 |
| 2.2.7 Unigene功能注释 | 第29页 |
| 2.2.8 预测Unigene的编码序列 | 第29-30页 |
| 2.2.9 基因表达定量分析 | 第30页 |
| 2.2.10 差异基因筛选 | 第30页 |
| 2.2.11 差异基因富集分析 | 第30-31页 |
| 2.2.12 差异基因的转录因子鉴定 | 第31页 |
| 2.3 结果 | 第31-43页 |
| 2.3.1 测序质量概况 | 第31页 |
| 2.3.2 转录本与unigenes统计 | 第31-32页 |
| 2.3.3 基因功能注释 | 第32-36页 |
| 2.3.4 基因编码序列预测 | 第36-37页 |
| 2.3.5 基因表达水平分析 | 第37页 |
| 2.3.6 差异基因筛选 | 第37-38页 |
| 2.3.7 差异基因的GO和KEGG富集分析 | 第38-39页 |
| 2.3.8 差异基因的转录因子分析 | 第39-43页 |
| 2.4 讨论 | 第43-46页 |
| 2.4.1 紫花苜蓿小花的转录组质量与基因功能注释 | 第43页 |
| 2.4.2 与紫花苜蓿多雌蕊发育相关的差异基因 | 第43-44页 |
| 2.4.3 与紫花苜蓿多雌蕊发育相关的转录因子 | 第44-46页 |
| 第三章 紫花苜蓿多雌突变体mp1的小RNA分析 | 第46-61页 |
| 3.1 引言 | 第46页 |
| 3.2 材料与方法 | 第46-48页 |
| 3.2.1 试验材料 | 第46-47页 |
| 3.2.2 总RNA提取与检测 | 第47页 |
| 3.2.3 文库制备与测序 | 第47页 |
| 3.2.4 原始读长过滤与sRNA分析 | 第47页 |
| 3.2.5 miRNA挖掘 | 第47页 |
| 3.2.6 miRNA家族分析 | 第47-48页 |
| 3.2.7 miRNA靶基因预测 | 第48页 |
| 3.2.8 miRNA表达定量与差异miRNA筛选 | 第48页 |
| 3.2.9 差异miRNA靶基因富集分析 | 第48页 |
| 3.2.10 差异miRNA与差异基因关联分析 | 第48页 |
| 3.3 结果 | 第48-58页 |
| 3.3.1 原始数据概况与sRNA分析 | 第48-50页 |
| 3.3.2 miRNA挖掘 | 第50-51页 |
| 3.3.3 miRNA家族分析 | 第51-52页 |
| 3.3.5 miRNA靶基因预测 | 第52-53页 |
| 3.3.6 差异miRNA筛选 | 第53-54页 |
| 3.3.7 差异miRNA靶基因富集分析 | 第54-55页 |
| 3.3.8 差异miRNA与差异基因关联分析 | 第55-58页 |
| 3.4 讨论 | 第58-61页 |
| 3.4.1 紫花苜蓿小花中的sRNA | 第58-59页 |
| 3.4.2 紫花苜蓿小花中的miRNA家族 | 第59页 |
| 3.4.3 miRNA与靶基因共同调控雌蕊的发育 | 第59-61页 |
| 第四章 结论与展望 | 第61-63页 |
| 4.1 主要结论 | 第61页 |
| 4.2 展望 | 第61-63页 |
| 参考文献 | 第63-72页 |
| 硕士期间科研成果及项目资助 | 第72-73页 |
| 致谢 | 第73页 |
