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基于多层异构生物网络的药物—基因关系预测方法研究

摘要第4-6页
Abstract第6-7页
第一章 绪论第14-28页
    1.1 课题概述和意义第14-26页
        1.1.1 信息网络和异构信息网络第16-20页
        1.1.2 基于异构网络的数据挖掘任务第20-24页
        1.1.3 基于异构网络的链接预测第24-25页
        1.1.4 意义第25-26页
    1.2 本文的组织结构第26-28页
第二章 构建生物异构信息网络第28-36页
    2.1 概述第28-31页
        2.1.1 问题简介第28-29页
        2.1.2 数据介绍第29-31页
    2.2 基准模型第31-32页
    2.3 评价标准第32-36页
第三章 基于表示学习模型的链接预测第36-48页
    3.1 概述第36-38页
        3.1.1 研究背景第36页
        3.1.2 相关工作第36-38页
    3.2 metapath2vec模型第38-42页
        3.2.1 基于Meta-path的随机游走第38-40页
        3.2.2 异构化Skip-Gram模型第40-41页
        3.2.3 metapath2vec++模型第41-42页
    3.3 基于矩阵分解的关系预测第42-43页
    3.4 实验分析第43-47页
        3.4.1 综合实验结果比较第43-45页
        3.4.2 参数设定第45-46页
        3.4.3 两种表示学习预测模型比较第46-47页
    3.5 本章小结第47-48页
第四章 基于归纳矩阵补全算法的链接预测第48-58页
    4.1 概述第48-50页
        4.1.1 研究背景第48页
        4.1.2 相关工作第48-50页
    4.2 归纳矩阵补全第50-53页
        4.2.1 低秩线性模型第50-51页
        4.2.2 归纳矩阵补全第51-52页
        4.2.3 基于主成分的特征提取第52-53页
    4.3 实验分析第53-57页
        4.3.1 综合实验效果比较第53-55页
        4.3.2 参数设置第55-56页
        4.3.3 运用表示学习方法提取特征的结果比较第56-57页
    4.4 本章小结第57-58页
第五章 基于元图的链接预测第58-70页
    5.1 概述第58-60页
        5.1.1 研究背景第58页
        5.1.2 相关工作第58-60页
    5.2 基于元图的隐性特征提取模型第60-65页
        5.2.1 概念定义第60-62页
        5.2.2 基于Meta-graph的相似性计算第62-63页
        5.2.3 基于Meta-graph的隐性特征提取第63页
        5.2.4 基于分解机的权值计算第63-65页
    5.3 基于元图的链接预测第65页
    5.4 实验分析第65-68页
        5.4.1 多种预测模型比较第66-67页
        5.4.2 参数设定第67-68页
    5.5 本章小结第68-70页
第六章 总结和展望第70-74页
    6.1 总结第70-71页
    6.2 展望第71-74页
参考文献第74-80页
致谢第80-81页

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