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不结球白菜自交不亲和相关基因及转录组分析

摘要第8-10页
ABSTRACT第10-12页
缩略词表第13-15页
前言第15-17页
第一章 文献综述第17-29页
    1 十字花科植物自交不亲和性研究进展第17-22页
        1.1 参与SSI反应的主要信号分子第17-19页
            1.1.1 SRK第17-18页
            1.1.2 SCR/SP11第18页
            1.1.3 MLPK第18-19页
            1.1.4 ARC1第19页
            1.1.5 Exo70A1第19页
        1.2 亲和及不亲和反应信号转导机制第19-21页
        1.3 SCR-SRK下游可能存在多条信号途径第21页
        1.4 拟南芥在自交不亲和研究中的应用第21-22页
        1.5 自交不亲和研究展望第22页
    2 转录组学研究进展第22-25页
        2.1 转录组学的主要技术方法第22-24页
        2.2 转录组学在蔬菜学上的应用第24页
        2.3 转录组学研究展望第24-25页
    3 植物U-box蛋白研究进展第25-29页
第二章 不结球白菜SCP基因的功能分析第29-41页
    1 材料与方法第31-36页
        1.1 试验材料第31页
            1.1.1 植物材料第31页
            1.1.2 菌株和载体第31页
            1.1.3 主要试剂第31页
        1.2 试验方法第31-36页
            1.2.1 植物材料的准备第31页
            1.2.2 引物设计第31-32页
            1.2.3 基因扩增第32页
            1.2.4 SCP-GFP融合基因的构建第32-33页
            1.2.5 pOREO3-SLR1 prom-SCP-GFP载体的构建第33-34页
            1.2.6 电转化农杆菌第34-35页
            1.2.7 转化拟南芥植株第35页
            1.2.8 转基因拟南芥种子的筛选第35页
            1.2.9 转基因拟南芥柱头的荧光显微分析第35-36页
            1.2.10 转基因拟南芥柱头的激光共聚焦显微镜观察第36页
    2 结果与分析第36-39页
        2.1 pOREO3-SLR1 prom-SCP-GFP表达载体构建第36页
        2.2 转基因拟南芥阳性检测第36-37页
        2.3 授粉后自花花粉发育观察第37-38页
        2.4 转基因拟南芥的激光共聚焦显微镜观察第38-39页
    3 讨论第39-41页
第三章 不结球白菜亲和/不亲和授粉早期转录组分析第41-57页
    1 材料与方法第44-46页
        1.1 试验材料第44页
            1.1.1 植物材料第44页
            1.1.2 主要试剂第44页
        1.2 试验方法第44-46页
            1.2.1 植物材料的准备第44页
            1.2.2 样品采集第44页
            1.2.3 RNA提取、cDNA文库构建以及Illumina测序第44-45页
            1.2.4 原始数据的处理及比对第45页
            1.2.5 差异表达基因的鉴定第45页
            1.2.6 差异表达基因的功能与通路富集分析第45-46页
    2 结果与分析第46-54页
        2.1 转录组测序数据评估第46-48页
        2.2 差异表达基因鉴定第48-51页
        2.3 差异表达基因的功能注释和代谢途径分析第51-53页
        2.4 钙调蛋白和EREBP转录因子第53-54页
        2.5 E3泛素连接酶第54页
    3 讨论第54-57页
第四章 不结球白菜花内参基因的筛选和验证第57-75页
    1 材料与方法第59-62页
        1.1 试验材料第59页
            1.1.1 植物材料第59页
            1.1.2 主要试剂第59页
        1.2 试验方法第59-62页
            1.2.1 植物材料的准备第59页
            1.2.2 样品采集第59-60页
            1.2.3 RNA提取及cDNA合成第60页
            1.2.4 候选内参基因的选择及引物设计第60-61页
            1.2.5 荧光定量PCR第61页
            1.2.6 内参基因引物特异性鉴定第61页
            1.2.7 数据分析第61-62页
            1.2.8 内参基因的验证第62页
    2 结果与分析第62-73页
        2.1 内参基因引物扩增效率及特异性鉴定第62-64页
        2.2 内参基因表达谱分析第64-67页
        2.3 候选内参基因在两个自交系中的表达稳定性第67页
        2.4 候选内参基因在单个自交系中的表达稳定性第67-70页
        2.5 最适内参基因数目判定第70页
        2.6 内参基因稳定性验证第70-73页
    3 讨论第73-75页
第五章 基于全基因组的大白菜PUB基因家族鉴定与分析第75-91页
    1 方法第76-78页
        1.1 序列检索第76-77页
        1.2 系统发育分析第77页
        1.3 PUB蛋白物化性质和保守基序分析第77页
        1.4 BrPUB基因在染色体上的定位以及基因组内的复制基因分析第77-78页
        1.5 直系和旁系同源PUB基因的鉴定第78页
        1.6 表达谱分析第78页
    2 结果与分析第78-88页
        2.1 白菜PUB基因的鉴定、分类、系统发生学分析第78-80页
        2.2 比较基因组学分析第80-81页
        2.3 PUB蛋白特征及保守基序分析第81-84页
        2.4 白菜PUB基因的染色体定位和复制分析第84-85页
        2.5 直系同源和旁系同源基因第85-86页
        2.6 白菜中PUB基因在不同组织中的表达分析第86-88页
    3 讨论第88-91页
全文结论第91-93页
创新点第93-95页
参考文献第95-109页
附录第109-121页
论文发表情况第121-123页
致谢第123页

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