| 摘要 | 第3-4页 |
| Abstract | 第4页 |
| 第一章 文献综述 | 第6-13页 |
| 1.1 树莓概述 | 第6-7页 |
| 1.1.1 树莓的生物学特性 | 第6页 |
| 1.1.2 树莓的分布 | 第6页 |
| 1.1.3 树莓的营养价值、药用价值以及经济价值 | 第6-7页 |
| 1.2 树莓的国外发展现状 | 第7页 |
| 1.3 树莓的国内发展现状 | 第7-8页 |
| 1.4 RNA-seq技术的研究与应用 | 第8-10页 |
| 1.4.1 测序技术的发展历程 | 第8-9页 |
| 1.4.2 转录组测序的概念及应用研究 | 第9页 |
| 1.4.3 基因表达谱(DGE)测序的概念及应用研究 | 第9-10页 |
| 1.4.4 转录组测序与数字基因表达谱(DGE)测序关系 | 第10页 |
| 1.5 本研究的目的意义及研究思路 | 第10-12页 |
| 1.5.1 目的及意义 | 第10-12页 |
| 1.5.2 研究思路 | 第12页 |
| 1.6 本研究的创新性 | 第12-13页 |
| 第二章 实验材料和方法 | 第13-19页 |
| 2.1 实验材料及采集地点 | 第13-15页 |
| 2.2 实验方法 | 第15-19页 |
| 2.2.1 RNA的提取及质量检测 | 第15-16页 |
| 2.2.2 文库的构建及测序 | 第16页 |
| 2.2.3 Illumina Hi Seq 4000 转录组上机测序 | 第16页 |
| 2.2.4 数据的过滤以及序列组装 | 第16-17页 |
| 2.2.5 Unigene的功能注释 | 第17页 |
| 2.2.6 DGE数据分析与绘图 | 第17页 |
| 2.2.7 qRT-PCR分析（实时定量PCR分析） | 第17-19页 |
| 第三章 实验结果 | 第19-32页 |
| 3.1 Illumina测序以及短序列组装 | 第19-20页 |
| 3.2 在基生枝和花果枝茎尖的全局基因表达 | 第20-21页 |
| 3.3 基生枝和花果枝茎尖的差异表达基因 | 第21-23页 |
| 3.4 DEG聚类及Pathway富集分析 | 第23-29页 |
| 3.5 DGE的qRT-PCR验证 | 第29-32页 |
| 第四章 讨论 | 第32-37页 |
| 4.1 乙烯和生长素对树莓基生枝顶端生根起到重要的调控作用 | 第32-33页 |
| 4.2 昼夜节律对控制树莓茎尖不定根分化起重要作用 | 第33页 |
| 4.3 树莓基生枝顶端生根的直接调因子 | 第33-34页 |
| 4.4 树莓基生枝顶端生根的可能调控模式 | 第34-37页 |
| 参考文献 | 第37-44页 |
| 攻读硕士学位期间发表的主要科研成果 | 第44-45页 |
| 论文(SCI期刊收录论文4) | 第44页 |
| 本研究受以下项目的资助 | 第44-45页 |
| 后记 | 第45页 |
