致谢 | 第7-8页 |
摘要 | 第8-10页 |
ABSTRACT | 第10-12页 |
主要缩略词对照表 | 第17-18页 |
文献综述 | 第18-27页 |
引言 | 第27-28页 |
1 材料与方法 | 第28-38页 |
1.1 材料 | 第28-29页 |
1.1.1 实验动物及病毒液 | 第28页 |
1.1.2 主要试剂及配制 | 第28页 |
1.1.3 主要试剂盒 | 第28页 |
1.1.4 主要仪器与设备 | 第28-29页 |
1.2 方法 | 第29-38页 |
1.2.1 实验动物分组 | 第29页 |
1.2.2 PEDV感染动物实验 | 第29页 |
1.2.3 转录组测序样品采集与检测 | 第29-30页 |
1.2.4 RNA质量检测 | 第30页 |
1.2.5 转录组测序cDNA文库的构建 | 第30-31页 |
1.2.6 转录组测序数据分析 | 第31页 |
1.2.7 差异表达基因的qRT-PCR验证 | 第31-34页 |
1.2.8 各组织脏器的采集与检测 | 第34-36页 |
1.2.9 Toll-like受体4、6实时荧光定量RT-PCR方法测定 | 第36-38页 |
2 结果 | 第38-52页 |
2.1 PEDV感染动物实验的结果 | 第38页 |
2.2 转录组测序结果分析 | 第38-48页 |
2.2.1 RNA质量检测结果 | 第38-39页 |
2.2.2 RNA-Seq数据质量评估结果 | 第39-41页 |
2.2.3 基因表达量分析结果 | 第41-43页 |
2.2.4 差异表达分析结果 | 第43-44页 |
2.2.5 差异表达基因注释分析结果 | 第44-48页 |
2.3 差异表达基因的qRT-PCR验证结果 | 第48-49页 |
2.4 各组织脏器RT-PCR检测结果 | 第49-50页 |
2.5 Toll-like受体4、6qRT-PCR方法测定结果 | 第50-52页 |
3 讨论 | 第52-55页 |
3.1 PEDV RNA-seq分析 | 第52-53页 |
3.1.1 差异基因表达情况 | 第52页 |
3.1.2 差异基因GO注释分析 | 第52-53页 |
3.1.3 差异基因通路分析 | 第53页 |
3.2 各组织脏器RT-PCR结果分析 | 第53-54页 |
3.3 TLR4和TLR6受体qRT-PCR结果分析 | 第54-55页 |
4 结论 | 第55-56页 |
参考文献 | 第56-66页 |
作者简介 | 第66页 |