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磷酸盐对水稻土中异化铁还原菌丰度和群落结构的影响

摘要第6-8页
ABSTRACT第8-10页
第一章 绪论第13-19页
    1.1 微生物的异化铁还原第13-14页
        1.1.1 异化铁还原和异化铁还原微生物的概念第13页
        1.1.2 异化铁还原的环境生态意义第13-14页
    1.2 异化铁还原微生物的多样性第14页
    1.3 典型异化铁还原微生物第14-16页
        1.3.1 地杆菌第14-16页
        1.3.2 厌氧粘细菌第16页
        1.3.3 梭菌第16页
        1.3.4 芽孢杆菌第16页
    1.4 影响微生物进行异化铁还原的因素第16-17页
    1.5 磷酸盐与异化铁还原的关系第17-18页
    1.6 研究内容及技术路线第18-19页
        1.6.1 研究内容第18页
        1.6.2 技术路线第18-19页
第二章 研究内容与方法第19-24页
    2.1 研究内容第19页
        2.1.1 水稻土厌氧培养过程中 Fe(III)还原能力及磷浓度变化第19页
        2.1.2 水稻土厌氧培养过程中铁还原微生物丰度的变化第19页
        2.1.3 水稻土厌氧培养过程中典型铁还原菌群落结构的演替第19页
    2.2 研究方法第19-24页
        2.2.1 供试土壤及其理化性质第19页
        2.2.2 Real-Time PCR 的引物第19-20页
        2.2.3 PCR-DGGE 的引物第20页
        2.2.4 试验处理设置与培养方法第20-21页
        2.2.5 土壤中铁还原能力测定第21页
        2.2.6 泥浆 pH 的测定第21页
        2.2.7 土样中细菌总 DNA 提取第21页
        2.2.8 采用 Real-Time PCR 技术测定微生物的丰度第21-22页
        2.2.9 铁还原微生物群落结构分析方法第22-24页
第三章 研究结果与分析第24-50页
    3.1 添加磷酸盐与水稻土中 Fe(III)还原的关系第24-26页
    3.2 不同浓度磷酸盐对异化铁还原菌丰度的影响第26-32页
        3.2.1 细菌基因组总 DNA 的提取第26页
        3.2.2 水稻土厌氧培养过程中细菌丰度变化第26-27页
        3.2.3 水稻土厌氧培养过程中地杆菌丰度变化第27-28页
        3.2.4 水稻土厌氧培养过程中厌氧粘细菌丰度变化第28-29页
        3.2.5 水稻土厌氧培养过程中梭菌丰度变化第29-30页
        3.2.6 水稻土厌氧培养过程中芽孢杆菌丰度变化第30-32页
    3.3 磷酸盐浓度对水稻土中地杆菌群落结构的影响第32-40页
        3.3.1 地杆菌的巢式 PCR 扩增第32页
        3.3.2 地杆菌的 DGGE 电泳图谱及相似性聚类分析第32-35页
        3.3.3 地杆菌群落α多样性指数的变化第35-36页
        3.3.4 地杆菌的系统发育分析第36-38页
        3.3.5 地杆菌优势条带的 PCA 分析第38-40页
    3.4 磷酸盐浓度对水稻土中梭菌群落结构的影响第40-48页
        3.4.1 梭菌的巢式 PCR 扩增第40页
        3.4.2 梭菌的 DGGE 电泳图谱及相似性聚类分析第40-43页
        3.4.3 梭菌群落α多样性指数的变化第43-44页
        3.4.4 梭菌的系统发育分析第44-46页
        3.4.5 梭菌优势条带的 PCA 分析第46-48页
    3.5 环境因子对不同处理水稻土地杆菌和梭菌的影响第48-50页
第四章 讨论第50-55页
    4.1 不同处理水稻土中 Fe(II)变化与典型铁还原菌丰度变化的关系第50页
    4.2 磷酸盐对铁还原菌丰度的影响第50-51页
    4.3 r-K 策略解释典型异化铁还原菌丰度的变化第51-52页
    4.4 不同处理水稻土中 Fe(II)变化与典型铁还原菌群落结构演替的关系第52页
    4.5 磷酸盐对铁还原微生物群落结构的影响第52-54页
    4.6 环境因子对不同处理水稻土梭菌和地杆菌的影响第54-55页
第五章 结论与展望第55-57页
    5.1 结论第55-56页
    5.2 实验中存在的问题第56页
    5.3 展望第56-57页
参考文献第57-61页
致谢第61-62页
作者简介第62页

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