| 致谢 | 第5-6页 |
| 摘要 | 第6-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 1 引言 | 第12-21页 |
| 1.1 DNA甲基化研究进展 | 第12-15页 |
| 1.1.1 DNA甲基化 | 第12-13页 |
| 1.1.2 DNA去甲基化和重新甲基化 | 第13页 |
| 1.1.3 DNA甲基化与生物的生长发育 | 第13-14页 |
| 1.1.4 DNA甲基化与环境变化 | 第14-15页 |
| 1.1.5 DNA甲基化与疾病的发生 | 第15页 |
| 1.2 DNA甲基化研究方法 | 第15-19页 |
| 1.2.1 甲基化敏感扩增片段多态性方法(MSAP) | 第15-17页 |
| 1.2.2 第二代测序技术在甲基化检测上的应用 | 第17-18页 |
| 1.2.3 基于基因芯片技术的检测方法 | 第18-19页 |
| 1.2.4 基于纳米技术检测甲基化位点结构的差异 | 第19页 |
| 1.2.5 生物信息学在DNA甲基化研究中的应用 | 第19页 |
| 1.3 本研究目的意义 | 第19-21页 |
| 2 材料与方法 | 第21-30页 |
| 2.1 实验材料 | 第21-22页 |
| 2.1.1 实验动物 | 第21页 |
| 2.1.2 主要试剂 | 第21-22页 |
| 2.1.3 主要仪器 | 第22页 |
| 2.2 实验方法 | 第22-30页 |
| 2.2.1 酚仿法提取北京油鸡肌肉和卵巢组织基因组DNA | 第22-23页 |
| 2.2.2 DNA甲基化检测 | 第23-25页 |
| 2.2.3 PAGE电泳银染检测过程及毛细管电泳检测过程 | 第25-26页 |
| 2.2.4 甲基化差异片段的回收 | 第26-27页 |
| 2.2.5 差异片段克隆及测序 | 第27-30页 |
| 3 结果与分析 | 第30-58页 |
| 3.1 北京油鸡MSAP毛细管电泳荧光检测体系的优化 | 第30-38页 |
| 3.1.1 MSAP分析中基因组DNA用量对结果的影响 | 第31页 |
| 3.1.2 选择性扩增反应中预扩增产物稀释倍数的确定 | 第31-32页 |
| 3.1.3 选择性扩增反应中引物用量的确定 | 第32-33页 |
| 3.1.4 选择性扩增反应中Mg~(2+)浓度的确定 | 第33-34页 |
| 3.1.5 选择性扩增反应中dNTPs浓度的确定 | 第34-35页 |
| 3.1.6 电泳时DNA上样量对实验结果的影响 | 第35-36页 |
| 3.1.7 毛细管电泳中内标用量的确定 | 第36页 |
| 3.1.8 进样时间对电泳结果的影响 | 第36-38页 |
| 3.2 MSAP荧光检测数据的自动分析研究 | 第38-44页 |
| 3.2.1 MSAP扩增片段荧光信号的转换和初始数据的获得 | 第38页 |
| 3.2.2 MSAP荧光标记检测初始数据的转换 | 第38-40页 |
| 3.2.3 四种数据转换方法计算结果比较 | 第40-41页 |
| 3.2.4 用于MSAP荧光检测初始数据自动分析程序的编写 | 第41-44页 |
| 3.3 北京油鸡肌肉与卵巢组织基因DNA甲基化分析 | 第44-52页 |
| 3.3.1 北京油鸡肌肉和卵巢组织基因组DNA的提取 | 第44页 |
| 3.3.2 基因组DNA的酶切 | 第44-45页 |
| 3.3.3 预扩增反应结果 | 第45页 |
| 3.3.4 选择性扩增结果 | 第45-46页 |
| 3.3.5 PAGE电泳和毛细管电泳检测 | 第46-47页 |
| 3.3.6 DNA甲基化模式分析 | 第47-48页 |
| 3.3.7 北京油鸡肌肉和卵巢基因组DNA甲基化水平 | 第48-49页 |
| 3.3.8 组织特异性甲基化片段回收测序 | 第49-52页 |
| 3.4 不同体重组北京油鸡肌肉组织基因组DNA甲基化分析 | 第52-58页 |
| 3.4.1 北京油鸡肌肉组织基因组DNA的MSAP分析 | 第52-53页 |
| 3.4.2 PAGE电泳和毛细管电泳检测 | 第53页 |
| 3.4.3 DNA甲基化模式的分析 | 第53-54页 |
| 3.4.4 高低体重组北京油鸡肌肉组织基因组DNA甲基化水平分析 | 第54-55页 |
| 3.4.5 体重特异性甲基化片段回收测序 | 第55-58页 |
| 4 讨论 | 第58-63页 |
| 4.1 北京油鸡MSAP毛细管电泳荧光检测体系的优化 | 第58-59页 |
| 4.2 MSAP荧光检测数据的自动分析研究 | 第59-60页 |
| 4.3 北京油鸡肌肉和卵巢组织基因组DNA甲基化分析 | 第60-61页 |
| 4.4 不同体重组北京油鸡肌肉组织基因组DNA甲基化分析 | 第61-63页 |
| 5 结论 | 第63-64页 |
| 参考文献 | 第64-67页 |
| 附录A | 第67-68页 |
| 作者简历及攻读硕士学位期间取得的研究成果 | 第68-70页 |
| 学位论文数据集 | 第70页 |
