| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 第一章 文献综述 | 第14-27页 |
| 0 引言 | 第14页 |
| 1 类胡萝卜素结构、分布与功能 | 第14-19页 |
| 1.1 类胡萝卜素结构 | 第15-16页 |
| 1.2 类胡萝卜素的分布 | 第16-17页 |
| 1.3 海洋生物中的类胡萝卜素 | 第17页 |
| 1.4 类胡萝卜素功能 | 第17-19页 |
| 2 类胡萝卜素代谢及酶学研究 | 第19-22页 |
| 2.1 类胡萝卜素代谢通路 | 第19-20页 |
| 2.2 影响类胡萝卜素吸收效率的因素 | 第20-22页 |
| 3 疾病/性状相关候选基因筛查方法 | 第22-27页 |
| 3.1 候选基因法 | 第22-23页 |
| 3.2 遗传连锁分析 | 第23页 |
| 3.3 基因共表达网络分析 | 第23-24页 |
| 3.4 遗传连锁与表达的结合 | 第24-25页 |
| 3.5 表观遗传学方法 | 第25页 |
| 3.6 全基因组关联分析 | 第25-27页 |
| 第二章 虾夷扇贝 SCD 基因克隆及其在海大金贝和普通扇贝中的表达差异分析 | 第27-48页 |
| 0 引言 | 第27-28页 |
| 1 实验材料 | 第28-30页 |
| 1.1 材料 | 第28页 |
| 1.2 试剂 | 第28-30页 |
| 2 实验方法 | 第30-38页 |
| 2.1 虾夷扇贝总 RNA 的提取 | 第30-31页 |
| 2.2 反转录合成一链 cDNA | 第31-32页 |
| 2.3 虾夷扇贝转录组数据库中获得目的基因片段 | 第32页 |
| 2.4 目的基因片段的 PCR 扩增 | 第32-34页 |
| 2.5 基因全长 cDNA 序列的获得 | 第34-36页 |
| 2.6 序列及系统进化分析 | 第36-37页 |
| 2.8 基因表达分析 | 第37-38页 |
| 3 结果 | 第38-46页 |
| 3.1 虾夷扇贝 SCD 序列结构 | 第38-39页 |
| 3.3 虾夷扇贝 SCD 基因进化分析 | 第39-43页 |
| 3.4 虾夷扇贝 SCD 蛋白分析 | 第43页 |
| 3.5 SCD 启动子的 in silico 分析 | 第43-44页 |
| 3.6 SCD 表达分析 | 第44-46页 |
| 4 讨论 | 第46-48页 |
| 4.1 虾夷扇贝 SCD 结构特征 | 第46页 |
| 4.2 虾夷扇贝 SCD 表达模式 | 第46-47页 |
| 4.3 海大金贝与普通虾夷扇贝 SCD 基因表达差异分析 | 第47-48页 |
| 第三章 虾夷扇贝胡萝卜素积累的全基因组关联分析（GWAS） | 第48-67页 |
| 0 引言 | 第48页 |
| 1 实验材料 | 第48-51页 |
| 1.1 扇贝材料 | 第48-49页 |
| 1.2 试剂 | 第49-51页 |
| 2 实验方法 | 第51-59页 |
| 2.1 DNA 的提取 | 第51-52页 |
| 2.2 SOLiD 测序文库构建 | 第52-55页 |
| 2.3 虾夷扇贝类胡萝卜素积累相关 SNP 的筛选 | 第55-56页 |
| 2.4 类胡萝卜素积累相关 SNP 的验证 | 第56-58页 |
| 2.5 SNP 位点的基因组定位及序列的功能注释与分析 | 第58-59页 |
| 3 结果与分析 | 第59-64页 |
| 3.1 测序结果分析 | 第59页 |
| 3.2 标签序列的聚类和 SNP 位点筛选 | 第59-60页 |
| 3.3 群体验证结果 | 第60-63页 |
| 3.4 SNP 位点的基因组定位及功能注释 | 第63-64页 |
| 4 讨论 | 第64-67页 |
| 4.1 虾夷扇贝类胡萝卜素积累相关 SNP 位点 | 第64-65页 |
| 4.2 海大金贝类胡萝卜素积累相关候选基因 | 第65-67页 |
| 参考文献 | 第67-73页 |
| 附录 | 第73-81页 |
| 致谢 | 第81-82页 |
| 个人简历 | 第82页 |
| 学术成果 | 第82-83页 |
