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小尾寒羊无角基因的分子标记和δ差异显示分析研究

摘要第5-6页
Abstract第6-7页
1 引言第10-17页
    1.1 前言第10页
    1.2 牛羊无角基因的研究进展第10-12页
        1.2.1 羊无角的遗传分析第10-11页
        1.2.2 无角基因的分子标记研究第11-12页
    1.3 试验中所涉及到的分子标记第12页
        1.3.1 限制性片段长度多态性(Restriction Fragment Length Polymorphism, RFLP)第12页
        1.3.2 单核苷酸多态性(Single-Nucleotide Polymorphisms,SNPs)第12页
    1.4 差异表达基因的研究方法第12-16页
        1.4.1 mRNA 差异显示技术(mRNA Differential Display,DDRT-PCR)第13页
        1.4.2 抑制性消减杂交(suppression subtractive hybridization, SSH)第13页
        1.4.3 基因表达系列分析(Serial Analysis of Gene Expression,SAGE)第13-14页
        1.4.4 基因芯片(Gene Chip)第14页
        1.4.5 RNA-Seq 技术 (RNA-Seq Technology)第14页
        1.4.6 δ差异显示技术(Delta Differential DisPlay Reverse TranseriPtion PCR)第14-15页
        1.4.7 应用第15-16页
    1.5 本研究的意义及其主要内容第16-17页
        1.5.1 目的意义第16页
        1.5.2 研究的主要内容第16-17页
2 材料与方法第17-33页
    2.1 实验材料第17-20页
        2.1.1 分子标记的实验组织样第17页
        2.1.2 差异显示实验组织样品第17页
        2.1.3 主要的实验试剂第17-18页
        2.1.4 主要相关试剂的配制第18-19页
        2.1.5 主要分析工具软件第19页
        2.1.6 主要的实验仪器第19-20页
    2.2 羊无角基因的分子标记的实验方法第20-25页
        2.2.1 DNA 的提取及浓度和纯度的检测第20-22页
        2.2.2 SYNJ1 基因的单核苷酸多态性分析第22-25页
    2.3 羊角基因差异表达研究的实验方法第25-33页
        2.3.1 总 RNA 提取及浓度和纯度检测第25-26页
        2.3.2 RNA 池的组建第26页
        2.3.3 δ差异显示 PCR 及检测第26-28页
        2.3.4 回收差异条带及差异条带的再扩增第28-30页
        2.3.5 差异条带的克隆及测序第30-32页
        2.3.6 假阳性片段的筛选第32页
        2.3.7 生物信息学分析第32-33页
3 结果与分析第33-47页
    3.1 羊无角 DNA 标记研究的实验结果与分析第33-35页
        3.1.1 基因组 DNA 的提取结果第33页
        3.1.2 SYNJ1 基因的单核苷酸多态性结果分析第33-34页
        3.1.3 RFLPs 结果统计分析第34-35页
    3.2 羊角基因差异表达研究结果与分析第35-39页
        3.2.1 羔羊角生长点皮肤组织总 RNA 的检测第35页
        3.2.2 δ差异 PCR 研究结果第35-36页
        3.2.3 差异片段再扩增的结果分析第36页
        3.2.4 差异条带的克隆第36-37页
        3.2.5 提取质粒 DNA 及克隆片段的酶切鉴定第37页
        3.2.6 假阳性片段的筛选结果第37-38页
        3.2.7 差异条带的同源性分析比对结果第38-39页
    3.3 相关片段序列的生物信息学分析第39-47页
        3.3.1 UBXN1 生物信息分析第39-42页
        3.3.2 APOB 生物信息分析第42-43页
        3.3.3 SYN3 生物信息分析第43-45页
        3.3.4 延伸因子 1-α1-like 生物信息分析第45-47页
4 讨论第47-51页
    4.1 实验材料的采集及处理第47页
    4.2 关于 SYNJ1第47页
    4.3 SNPs 的实验结果第47-48页
    4.4 关于δ差异显示技术第48页
    4.5 假阳性的验证第48-49页
    4.6 UBXN1 的功能分析第49页
    4.7 突触蛋白的功能分析第49页
    4.8 有待进一步研究的问题第49-51页
5 结论第51-52页
参考文献第52-57页
在读期间发表的论文第57-58页
作者简历第58-59页
致谢第59-60页

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