| 中文摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-11页 |
| 1 前言 | 第12-27页 |
| 1.1 肠炎沙门氏菌 | 第12-15页 |
| 1.1.1 沙门氏菌形态特征、及培养条件 | 第13-14页 |
| 1.1.2 肠炎沙门氏菌的危害 | 第14-15页 |
| 1.1.3 肠炎沙门氏菌的预防 | 第15页 |
| 1.2 抗病遗传育种 | 第15-16页 |
| 1.3 标记辅助选择 | 第16-22页 |
| 1.3.1 QTL定位 | 第17-19页 |
| 1.3.2 全基因组关联分析 | 第19-22页 |
| 1.4 GWAS实验设计、样本选择与数据控制 | 第22-25页 |
| 1.4.1 实验设计及其统计分析方法 | 第22页 |
| 1.4.2 GWAS-样本选择及质量控制 | 第22-24页 |
| 1.4.3 GWAS实验流程 | 第24页 |
| 1.4.4 GWAS优势及存在问题 | 第24-25页 |
| 1.5 SNP芯片技术 | 第25-26页 |
| 1.5.1 SNP芯片及芯片原理 | 第25页 |
| 1.5.2 鸡-600K高密度芯片 | 第25-26页 |
| 1.6 本研究的目的和意义 | 第26-27页 |
| 2 材料与方法 | 第27-38页 |
| 2.1 实验材料与主要仪器 | 第27-31页 |
| 2.1.1 实验试剂 | 第27页 |
| 2.1.2 主要仪器 | 第27-28页 |
| 2.1.3 实验耗材及主要试剂配制方法 | 第28-29页 |
| 2.1.4 数据分析软件及常用数据库 | 第29页 |
| 2.1.5 试验动物和菌种 | 第29-30页 |
| 2.1.6 动物试验 | 第30-31页 |
| 2.2 试验方法 | 第31-37页 |
| 2.2.1 盲肠内肠炎沙门氏菌的含菌量统计 | 第31页 |
| 2.2.2 基因组DNA提取及质量检测 | 第31-32页 |
| 2.2.3 SNP分型和质量控制 | 第32-33页 |
| 2.2.4 多重假设检验校正 | 第33页 |
| 2.2.5 盲肠、肝脏组织总RNA提取及质量检测 | 第33-35页 |
| 2.2.6 反转录 | 第35页 |
| 2.2.7 WNT7B、LPP和LRP5 PCR引物设计及合成 | 第35-36页 |
| 2.2.8 荧光定量PCR反应体系及反应条件 | 第36页 |
| 2.2.9 候选基因标准曲线的制作 | 第36-37页 |
| 2.3 数据处理与统计分析 | 第37-38页 |
| 3 结果与分析 | 第38-49页 |
| 3.1 基因组DNA电泳结果 | 第38-39页 |
| 3.2 济宁百日鸡盲肠组织内容物内肠炎沙门氏菌含量的统计 | 第39页 |
| 3.3 SNP基因分型及质量控制 | 第39-41页 |
| 3.4 与肠炎沙门氏菌相关候选基因及SNPs | 第41-42页 |
| 3.5 SNPs位点不同基因型与肠炎沙门氏菌含菌量的相关性分析 | 第42-44页 |
| 3.6 候选基因在盲肠和脾脏中相对表达量 | 第44-49页 |
| 3.6.1 组织中总RNA提取 | 第44页 |
| 3.6.2 候选基因LRP5、LPP和WNT7B分别在脾脏和盲肠组织中相对表达量 | 第44-49页 |
| 4 讨论 | 第49-52页 |
| 4.1 济宁百日鸡感染肠炎沙门氏菌分析 | 第49页 |
| 4.2 候选基因在脾脏和盲肠组织中对肠炎沙门氏菌感染的调控 | 第49-52页 |
| 5 结论与展望 | 第52-53页 |
| 5.1 结论 | 第52页 |
| 5.2 创新与展望 | 第52-53页 |
| 5.2.1 创新之处 | 第52页 |
| 5.2.3 研究展望 | 第52-53页 |
| 参考文献 | 第53-68页 |
| 致谢 | 第68-69页 |
| 攻读学位期间发表论文情况 | 第69页 |
