| 摘要 | 第8-10页 |
| ABSTRACT | 第10-11页 |
| 缩略词(ABBREVIATIONS) | 第12-14页 |
| 引言 | 第14-15页 |
| 第一部分 文献综述 | 第15-35页 |
| 1 转录组测序 | 第15-18页 |
| 1.1 测序技术的发展 | 第15-16页 |
| 1.2 RNA-Seq测序技术 | 第16-17页 |
| 1.3 RNA-Seq技术的优势与应用 | 第17-18页 |
| 1.4 RNA-Seq技术在果树学中的应用 | 第18页 |
| 2 花色苷的生物合成 | 第18-23页 |
| 2.1 结构基因 | 第19-21页 |
| 2.1.1 PAL | 第19页 |
| 2.1.2 CHS和CHI | 第19-20页 |
| 2.1.3 F3H、F3'H和F3'5'H | 第20页 |
| 2.1.4 DFR | 第20页 |
| 2.1.5 UFGT和ANS | 第20-21页 |
| 2.2 调控基因 | 第21-23页 |
| 2.2.1 MYB转录因子 | 第21-22页 |
| 2.2.2 bHLH转录因子 | 第22页 |
| 2.2.3 WD40转录因子 | 第22-23页 |
| 3 环境对花青苷合成基因的影响 | 第23-25页 |
| 参考文献 | 第25-35页 |
| 第二部分 研究报告 | 第35-93页 |
| 第一章 基于RNA-Seq的红叶桃叶色变化的转录组分析 | 第35-67页 |
| 1 材料与方法 | 第36-41页 |
| 1.1 试验材料 | 第36页 |
| 1.1.1 植物材料 | 第36页 |
| 1.1.2 试验主要试剂 | 第36页 |
| 1.1.3 试验主要仪器 | 第36页 |
| 1.2 植物叶片花色苷含量的提取 | 第36-37页 |
| 1.3 总RNA的提取 | 第37-38页 |
| 1.4 总RNA质检及mRNA纯化 | 第38页 |
| 1.5 cDNA文库构建 | 第38页 |
| 1.6 上机测序 | 第38页 |
| 1.7 原始数据质控、分析及处理 | 第38页 |
| 1.8 生物学分析 | 第38-39页 |
| 1.9 cDNA合成及荧光定量PCR验证 | 第39-41页 |
| 2 结果与分析 | 第41-50页 |
| 2.1 RNA-Seq数据分析概述 | 第41-43页 |
| 2.2 三个文库中差异表达基因的对比分析 | 第43-47页 |
| 2.3 三个文库差异表达基因的GO分析 | 第47页 |
| 2.4 差异表达基因的KEGG分析 | 第47-50页 |
| 2.5 QRT-PCR表达分析 | 第50页 |
| 2.6 红叶桃不同月份花色及花色苷含量 | 第50页 |
| 3 讨论 | 第50-61页 |
| 3.1 红叶桃叶色变化过程中涉及的花色苷合成相关基因 | 第50-56页 |
| 3.2 红叶桃叶色变化过程中涉及的激素相关基因的差异表达分析 | 第56-61页 |
| 3.3 红叶桃叶色变化过程中涉及的温度与光照相关基因的差异表达分析 | 第61页 |
| 4 结论 | 第61-63页 |
| 参考文献 | 第63-67页 |
| 第二章 温度、光照及激素处理对离体红叶桃叶片CHI及UFGT基因表达的影响 | 第67-79页 |
| 1 材料与方法 | 第68-70页 |
| 1.1 仪器与试剂 | 第68页 |
| 1.2 试材及取样 | 第68页 |
| 1.3 处理方法 | 第68页 |
| 1.4 RNA提取、cDNA制备 | 第68-69页 |
| 1.5 cDNA反转录的检测 | 第69页 |
| 1.6 荧光定量PCR | 第69-70页 |
| 1.7 数据处理与分析 | 第70页 |
| 2 结果与分析 | 第70-74页 |
| 2.1 桃叶片RNA的提取结果 | 第70-71页 |
| 2.2 桃叶片cDNA检测 | 第71页 |
| 2.3 温度对桃叶片CHI及UFGT基因表达的影响 | 第71-72页 |
| 2.4 光照对桃叶片CHI及UFGT基因表达的影响 | 第72页 |
| 2.5 激素对桃叶片CHI及UFGT基因表达的影响 | 第72-74页 |
| 2.5.1 ABA处理 | 第72-73页 |
| 2.5.2 IAA处理 | 第73页 |
| 2.5.3 JA处理 | 第73-74页 |
| 2.5.4 SA处理 | 第74页 |
| 3 讨论 | 第74-77页 |
| 3.1 温度对CHI及UFGT基因的影响 | 第74-75页 |
| 3.2 光照对CHI及UFGT基因的影响 | 第75页 |
| 3.3 激素对CHI及UFGT基因的影响 | 第75-77页 |
| 参考文献 | 第77-79页 |
| 第三章 NaCl、蔗糖及KH_2PO_4处理对离体红叶桃叶片花色苷合成相关基因表达的影响 | 第79-93页 |
| 1 材料与方法 | 第80-81页 |
| 1.1 试材及取样 | 第80页 |
| 1.2 处理方法 | 第80页 |
| 1.3 RNA提取、cDNA制备 | 第80页 |
| 1.4 荧光定量PCR | 第80-81页 |
| 1.5 数据处理与分析 | 第81页 |
| 2 结果与分析 | 第81-86页 |
| 2.1 NaCl、蔗糖及KH_2PO_4处理对桃叶片CHI基因表达的影响 | 第81-82页 |
| 2.2 NaCl、蔗糖及KH_2PO_4处理对桃叶片UFGT基因表达的影响 | 第82-83页 |
| 2.3 NaCl、蔗糖及KH_2PO_4处理对桃叶片MYB10基因表达的影响 | 第83-84页 |
| 2.4 NaCl、蔗糖及KH_2PO_4处理对桃叶片MYB15基因表达的影响 | 第84-85页 |
| 2.5 NaCl、蔗糖及KH_2PO_4处理对桃叶片bHLH33基因表达的影响 | 第85页 |
| 2.6 NaCl、蔗糖及KH_2PO_4处理对桃叶片WD40基因表达的影响 | 第85-86页 |
| 3 讨论 | 第86-89页 |
| 参考文献 | 第89-93页 |
| 第三部分 全文结论与主要创新点 | 第93-97页 |
| (一) 主要结论 | 第93-95页 |
| (二) 主要创新点 | 第95-97页 |
| 硕士在读期间发表论文 | 第97-99页 |
| 致谢 | 第99页 |
