| 摘要 | 第7-9页 |
| ABSTRACT | 第9-10页 |
| 缩略词表 | 第11-12页 |
| 前言 | 第12-13页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-23页 |
| 1 基因组学和生物信息学 | 第13-18页 |
| 1.1 基因组测序 | 第13-15页 |
| 1.2 大型生物信息数据库的发展现状 | 第15-18页 |
| 2 转录因子基因家族 | 第18页 |
| 3 SBP转录因子基因家族 | 第18-19页 |
| 3.1 SBP转录因子的结构和功能 | 第18-19页 |
| 3.2 miRNA对SBP转录因子的调控 | 第19页 |
| 4 Whirly转录因子基因家族 | 第19-23页 |
| 4.1 Whirly基因和蛋白质的鉴定 | 第19-20页 |
| 4.2 Whirly蛋白质调控基因的表达 | 第20页 |
| 4.3 Whirly家族在高等植物中的保守性 | 第20页 |
| 4.4 Whirly蛋白质的靶标 | 第20-23页 |
| 第二章 不结球白菜核心种质资源基因组数据库的构建 | 第23-43页 |
| 1 材料和方法 | 第25-30页 |
| 1.1 硬件平台 | 第26-27页 |
| 1.2 操作系统层 | 第27-28页 |
| 1.3 不结球白菜基因组数据和农艺数据的挖掘和整理 | 第28-29页 |
| 1.4 数据库建模 | 第29-30页 |
| 2 结果与分析 | 第30-40页 |
| 2.1 NHCCBase网站 | 第30-31页 |
| 2.2 GBrowse图谱浏览工具 | 第31-32页 |
| 2.3 BLAST序列比对工具 | 第32-34页 |
| 2.4 农艺性状搜索功能 | 第34-36页 |
| 2.5 SSRFace分子标记发掘工具 | 第36-39页 |
| 2.6 GeMint生物信息虚拟机操作系统 | 第39-40页 |
| 3 讨论 | 第40-43页 |
| 第三章 大白菜SBP转录因子家族的鉴定和分析 | 第43-63页 |
| 1 材料与方法 | 第44-46页 |
| 1.1 大白菜中SBP转录因子的鉴定、位置和理化特性分析 | 第44-45页 |
| 1.2 系统进化树的构建 | 第45页 |
| 1.3 基因结构和基序分析 | 第45页 |
| 1.4 直系同源基因和旁系同源基因的鉴定 | 第45页 |
| 1.5 SBP基因相关miRNA的鉴定 | 第45页 |
| 1.6 SBP基因在各组织器官中的转录表达分析 | 第45-46页 |
| 1.7 植株材料和激素处理实验 | 第46页 |
| 1.8 qPCR实验研究SBP基因表达 | 第46页 |
| 2 结果与分析 | 第46-60页 |
| 2.1 大白菜中SBP转录因子的鉴定 | 第46-49页 |
| 2.2 SBP蛋白质的系统进化关系 | 第49-51页 |
| 2.3 基因结构和基序分析 | 第51-52页 |
| 2.4 植物中直系同源和旁系同源SBP基因的鉴定 | 第52-56页 |
| 2.5 SBP基因相关miRNA的鉴定 | 第56-57页 |
| 2.6 大白菜SBP基因在不同组织中的表达模式 | 第57-58页 |
| 2.7 施用外源激素后大白菜SBP基因的表达模式 | 第58-60页 |
| 3 讨论 | 第60-63页 |
| 第四章 植物中Whirly转录因子家族的鉴定和分析 | 第63-77页 |
| 1 材料与方法 | 第64-65页 |
| 1.1 植物基因组序列信息的收集 | 第64页 |
| 1.2 Whirly基因的鉴定、定位以及蛋白质理化性质的预测 | 第64-65页 |
| 1.3 系统进化树的构建 | 第65页 |
| 1.4 基因结构和基序分析 | 第65页 |
| 1.5 旁系同源基因和直系同源基因对的鉴定 | 第65页 |
| 2 结果和分析 | 第65-75页 |
| 2.1 植物中Whirly转录因子的鉴定 | 第65-66页 |
| 2.2 Whirly蛋白质的理化性质 | 第66-67页 |
| 2.3 Whirly蛋白质的系统进化关系 | 第67-68页 |
| 2.4 植物Whirly蛋白质中的motif | 第68-71页 |
| 2.6 十字花科植物Whirly蛋白质中的motif | 第71-75页 |
| 2.7 预测的Whirly蛋白质三维立体结构 | 第75页 |
| 3 讨论 | 第75-77页 |
| 全文结论 | 第77-79页 |
| 参考文献 | 第79-85页 |
| 附录 | 第85-113页 |
| 学术论文及著作权 | 第113-115页 |
| 致谢 | 第115页 |
