摘要 | 第5-6页 |
abstract | 第6-7页 |
英文缩略表 | 第11-14页 |
第一章 引言 | 第14-24页 |
1.1 脂肪组织概述 | 第14页 |
1.2 成脂分化过程 | 第14-15页 |
1.3 参与成脂分化的重要转录因子 | 第15-17页 |
1.3.1 PPARγ | 第15-16页 |
1.3.2 C/EBPs | 第16页 |
1.3.3 KLFs | 第16-17页 |
1.3.4 其他与成脂分化相关的转录因子 | 第17页 |
1.4 参与成脂分化的重要信号通路 | 第17-19页 |
1.4.1 PPAR信号通路 | 第17页 |
1.4.2 Wnt信号通路 | 第17-18页 |
1.4.3 TGFβ和BMPs信号通路 | 第18页 |
1.4.4 MAPK信号通路 | 第18-19页 |
1.5 miRNA概述 | 第19页 |
1.6 参与脂肪细胞分化的miRNAs | 第19-21页 |
1.6.1 促进脂肪细胞分化的miRNAs | 第19-20页 |
1.6.2 抑制脂肪细胞分化的miRNAs | 第20-21页 |
1.7 调节脂质代谢的miRNAs | 第21-22页 |
1.8 研究目的与意义 | 第22-24页 |
第二章 不同猪脂肪组织miRNAs及其靶基因的鉴定及生物信息学分析 | 第24-44页 |
2.1 材料与方法 | 第24-28页 |
2.1.1 实验动物 | 第24页 |
2.1.2 主要仪器和试剂 | 第24页 |
2.1.3 脂肪组织样品总RNA的提取 | 第24页 |
2.1.4 small RNA的cDNA文库构建 | 第24-25页 |
2.1.5 高通量测序(Illumina Sequencing) | 第25页 |
2.1.6 测序数据的生物信息学分析 | 第25-27页 |
2.1.7 qRT-PCR | 第27-28页 |
2.2 结果 | 第28-41页 |
2.2.1 总RNA的提取和质检 | 第28-29页 |
2.2.2 原始数据质控及Rfam数据库注释 | 第29-30页 |
2.2.3 已知miRNA和新miRNA的鉴定 | 第30页 |
2.2.4 miRNA长度分布 | 第30页 |
2.2.5 miRNA碱基偏好性分析 | 第30-31页 |
2.2.6 差异表达miRNAs的筛选 | 第31-33页 |
2.2.7 靶基因预测 | 第33页 |
2.2.8 GO分析 | 第33-34页 |
2.2.9 KEGG分析 | 第34-35页 |
2.2.10 差异表达miRNAs与其靶基因的互作关系网络图 | 第35-36页 |
2.2.11 差异表达miRNAs与PPAR信号通路中靶基因的作用关系 | 第36页 |
2.2.12 转录因子结合位点预测结果 | 第36-38页 |
2.2.13 qPCR结果 | 第38-41页 |
2.3 讨论 | 第41-42页 |
2.4 结论 | 第42-44页 |
第三章 ssc-miR-486的靶基因预测及生物信息学分析 | 第44-54页 |
3.1 材料与方法 | 第44-46页 |
3.1.1 实验材料 | 第44页 |
3.1.2 qRT-PCR检测ssc-miR-486的表达变化 | 第44-45页 |
3.1.3 ssc-miR-486生物信息学分析 | 第45-46页 |
3.2 结果 | 第46-51页 |
3.2.1 qRT-PCR结果 | 第46页 |
3.2.2 转录因子结合位点预测结果 | 第46-47页 |
3.2.3 保守性分析 | 第47页 |
3.2.4 靶基因预测结果 | 第47页 |
3.2.5 GO分析结果 | 第47-49页 |
3.2.6 KEGG富集结果 | 第49-51页 |
3.3 讨论 | 第51-53页 |
3.4 结论 | 第53-54页 |
第四章 全文结论与展望 | 第54-55页 |
参考文献 | 第55-66页 |
致谢 | 第66-67页 |
作者简历 | 第67页 |