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不同猪脂肪组织miRNAs及其靶基因的鉴定及ssc-miR-486的生物信息学分析

摘要第5-6页
abstract第6-7页
英文缩略表第11-14页
第一章 引言第14-24页
    1.1 脂肪组织概述第14页
    1.2 成脂分化过程第14-15页
    1.3 参与成脂分化的重要转录因子第15-17页
        1.3.1 PPARγ第15-16页
        1.3.2 C/EBPs第16页
        1.3.3 KLFs第16-17页
        1.3.4 其他与成脂分化相关的转录因子第17页
    1.4 参与成脂分化的重要信号通路第17-19页
        1.4.1 PPAR信号通路第17页
        1.4.2 Wnt信号通路第17-18页
        1.4.3 TGFβ和BMPs信号通路第18页
        1.4.4 MAPK信号通路第18-19页
    1.5 miRNA概述第19页
    1.6 参与脂肪细胞分化的miRNAs第19-21页
        1.6.1 促进脂肪细胞分化的miRNAs第19-20页
        1.6.2 抑制脂肪细胞分化的miRNAs第20-21页
    1.7 调节脂质代谢的miRNAs第21-22页
    1.8 研究目的与意义第22-24页
第二章 不同猪脂肪组织miRNAs及其靶基因的鉴定及生物信息学分析第24-44页
    2.1 材料与方法第24-28页
        2.1.1 实验动物第24页
        2.1.2 主要仪器和试剂第24页
        2.1.3 脂肪组织样品总RNA的提取第24页
        2.1.4 small RNA的cDNA文库构建第24-25页
        2.1.5 高通量测序(Illumina Sequencing)第25页
        2.1.6 测序数据的生物信息学分析第25-27页
        2.1.7 qRT-PCR第27-28页
    2.2 结果第28-41页
        2.2.1 总RNA的提取和质检第28-29页
        2.2.2 原始数据质控及Rfam数据库注释第29-30页
        2.2.3 已知miRNA和新miRNA的鉴定第30页
        2.2.4 miRNA长度分布第30页
        2.2.5 miRNA碱基偏好性分析第30-31页
        2.2.6 差异表达miRNAs的筛选第31-33页
        2.2.7 靶基因预测第33页
        2.2.8 GO分析第33-34页
        2.2.9 KEGG分析第34-35页
        2.2.10 差异表达miRNAs与其靶基因的互作关系网络图第35-36页
        2.2.11 差异表达miRNAs与PPAR信号通路中靶基因的作用关系第36页
        2.2.12 转录因子结合位点预测结果第36-38页
        2.2.13 qPCR结果第38-41页
    2.3 讨论第41-42页
    2.4 结论第42-44页
第三章 ssc-miR-486的靶基因预测及生物信息学分析第44-54页
    3.1 材料与方法第44-46页
        3.1.1 实验材料第44页
        3.1.2 qRT-PCR检测ssc-miR-486的表达变化第44-45页
        3.1.3 ssc-miR-486生物信息学分析第45-46页
    3.2 结果第46-51页
        3.2.1 qRT-PCR结果第46页
        3.2.2 转录因子结合位点预测结果第46-47页
        3.2.3 保守性分析第47页
        3.2.4 靶基因预测结果第47页
        3.2.5 GO分析结果第47-49页
        3.2.6 KEGG富集结果第49-51页
    3.3 讨论第51-53页
    3.4 结论第53-54页
第四章 全文结论与展望第54-55页
参考文献第55-66页
致谢第66-67页
作者简历第67页

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