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探究酿酒酵母组蛋白甲基转移酶Set2蛋白的调控机制

摘要第4-5页
ABSTRACT第5页
1. 绪论第8-16页
    1.1 表观遗传学与组蛋白修饰第8-9页
    1.2 组蛋白赖氨酸甲基化第9页
    1.3 Set2蛋白与H3K36甲基化第9-11页
    1.4 蛋白质泛素化与E3连接酶第11-12页
    1.5 蛋白质磷酸化与Bur1/Bur2蛋白激酶第12-13页
    1.6 系统遗传矩阵方法(SGA)第13-14页
    1.7 研究思路和意义第14-16页
2. 材料与方法第16-50页
    2.1 实验材料第16-24页
        2.1.1 菌株第16-17页
        2.1.2 质粒第17页
        2.1.3 引物第17-19页
        2.1.4 药品试剂第19-21页
        2.1.5 工具酶和试剂盒第21页
        2.1.6 抗体第21-22页
        2.1.7 实验仪器第22-23页
        2.1.8 实验耗材及常用物品第23-24页
    2.2 实验方法第24-48页
        2.2.1 配制酵母及大肠杆菌生长培养基第24-25页
        2.2.2 制备DH5α/TOP10/BL21菌株感受态细胞第25-26页
        2.2.3 构建重组载体第26-30页
        2.2.4 同源重组方法在酵母菌株中敲除基因第30-31页
        2.2.5 酵母菌株中转入质粒第31-32页
        2.2.6 CHX处理蛋白降解实验第32-33页
        2.2.7 SGA法筛选双突变菌株第33-34页
        2.2.8 Western Blot(蛋白质免疫印迹)第34-36页
        2.2.9 DOX处理tet启动子突变株实验第36页
        2.2.10 RT-qPCR(反转录定量PCR)第36-37页
        2.2.11 MB-PP1处理as突变株实验第37页
        2.2.12 Co-immunoprecipitation (免疫共沉淀,Co-IP)第37-38页
        2.2.13 体内IP泛素化反应第38-39页
        2.2.14 大肠杆菌纯化CBP标签蛋白第39-41页
        2.2.15 昆虫表达载体SF9细胞纯化His标签蛋白第41-45页
        2.2.16 体外磷酸化反应第45页
        2.2.17 质谱鉴定磷酸化蛋白位点第45-46页
        2.2.18 点突变第46-47页
        2.2.19 药物处理酵母细胞周期实验第47页
        2.2.20 酵母生长梯度稀释实验第47-48页
    2.3 实验过程第48-50页
        2.3.1 筛选Set2的E3连接酶第48页
        2.3.2 证明Bre1是Set2的E3连接酶第48页
        2.3.3 检测Bur1/Bur2调控Se2的机制是否与Ctk1不同第48-49页
        2.3.4 检测Bur1/Bur2是否直接磷酸化Se2第49页
        2.3.5 探究磷酸化的功能第49-50页
3. 结果与讨论第50-66页
    3.1 Bre1是Set2蛋白的E3连接酶第50-52页
        3.1.1 CHX实验证明Set2蛋白由蛋白酶体途径降解第50页
        3.1.2 SGA方法筛选E3连接酶可能为Bre1第50-52页
    3.2 进一步证明Bre1是Set2的E3连接酶第52-55页
        3.2.1 敲除BRE1可以恢复Set2蛋白水平第52-53页
        3.2.2 回转Bre1或过表达Bre1降低Set2蛋白水平第53页
        3.2.3 Co-IP实验证明Bre1与Set2有相互作用第53-54页
        3.2.4 酵母细胞中用Ni-NTA柱pull-down蛋白后检测到泛素化信号第54-55页
    3.3 Bur1/Bur2调控Se2的机制与Ctk1不同第55-58页
        3.3.1 ctk1△或bur2△都会降低Set2蛋白水平第55-57页
        3.3.2 Bur2调控Set2的机制与Ck1的调控机制不同第57页
        3.3.3 BUR1-as与bur2△菌株中影响Se2蛋白水平的表型一致第57-58页
    3.4 Bur1/Bur2可以在体外直接磷酸化Se2第58-59页
    3.5 Bur1/Bur2对Set2的磷酸化对于H3K36甲基化是必需的第59-62页
        3.5.1 三个较近的磷酸化位点一起负责Bur1/Bur2对Set2的磷酸化作用及下游的H3K36甲基化功能第59-60页
        3.5.2 Bur1/Bur2对Set2的磷酸化作用对于H3K36me2/me3是必需的第60-62页
    3.6 Bur1/Bur2对Set2的磷酸化对于Set2的蛋白稳定性是必需的第62-63页
    3.7 Bur1/Bur2对Set2的磷酸化与细胞周期和DNA损伤修复相关第63-66页
        3.7.1 Bur1/Bur2对Set2的磷酸化与细胞周期相关第63-64页
        3.7.2 Bur1/Bur2对Set2的磷酸化与DNA损伤修复相关第64-66页
4. 总结与展望第66-68页
    4.1 总结第66-67页
    4.2 展望第67-68页
参考文献第68-72页
英文缩略表第72-74页
己发表学术论文第74-75页
致谢第75-77页

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