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苦苣菜黄网病毒基因组末端顺式作用元件突变分析

致谢第6-8页
摘要第8-10页
Abstract第10-11页
1 综述第15-38页
    1.1 苦苣菜黄网病毒概述第15-20页
        1.1.1 苦苣菜黄网病毒分类、寄主及传播介体第15页
        1.1.2 苦苣菜黄网病毒粒子形态与理化性质第15-16页
        1.1.3 苦苣菜黄网病毒的基因组结构及功能第16-19页
        1.1.4 SYNV转录与复制第19-20页
    1.2 病毒反向遗传学第20-26页
        1.2.1 正链RNA病毒反向遗传学第21-22页
        1.2.2 负义RNA病毒反向遗传学第22-26页
            1.2.2.1 动物负链RNA病毒反向遗传学第22-25页
            1.2.2.2 植物负义RNA病毒反向遗传学第25-26页
    1.3 不分段的负义RNA病毒基因组末端顺式作用元件研究第26-37页
        1.3.1 弹状病毒科第27-32页
        1.3.2 副粘病毒科第32-35页
        1.3.3 其它病毒科第35-37页
    1.4 本论文的研究目的及意义第37-38页
2 实验方法第38-51页
    2.1. 常规分子克隆技术第38-44页
        2.1.1 PCR第38-40页
        2.1.2 凝胶回收第40页
        2.1.3 限制性内切酶酶切与连接酶连接第40-41页
        2.1.4 Infusion第41页
        2.1.5 转化第41-42页
        2.1.6 菌落PCR筛选第42-43页
        2.1.7 少量质粒的提取第43-44页
        2.1.8 重组质粒酶切及测序鉴定第44页
    2.2 农杆菌浸润接种第44-46页
        2.2.1 农杆菌感受态制备与电击转化第44-45页
        2.2.2 农杆菌浸润接种本氏烟第45-46页
    2.3 核酸相关技术第46-49页
        2.3.1 CTAB法提取植物DNA第46页
        2.3.2 植物总RNA提取方法第46-48页
        2.3.3 RT-PCR制备cDNA第48-49页
    2.4 Western blot第49-51页
        2.4.1 植物总蛋白的提取第49页
        2.4.2 SDS-PAGE电泳第49页
        2.4.3 半干法转膜第49-50页
        2.4.4 Western blot第50-51页
3 SYNV微型复制子末端序列突变分析第51-101页
    3.1 材料和方法第52-63页
        3.1.1 材料第52页
        3.1.2 SYNV原始毒源和侵染性克隆接种本氏烟第52-53页
        3.1.3 引物设计第53页
        3.1.4 RNA提取与RT-PCR第53-55页
        3.1.5 高保真PCR扩增目的片段第55页
        3.1.6 目的片段连pLB载体测序第55-56页
        3.1.7 SYNV-MR突变体构建第56页
        3.1.8 突变载体转化农杆菌并浸润本氏烟第56页
        3.1.9 荧光观察及样品采集第56-57页
        3.1.10 SDS-PAGE电泳及Western Blot检测第57-63页
    3.2 结果与分析第63-101页
        3.2.1 SYNV微型复制子末端序列确定第63-65页
        3.2.2 SYNV微型复制子末端序列突变分析第65-98页
            3.2.2.1 leader与trailer互补的茎(stem)突变分析第65-73页
            3.2.2.2 环状凸起bulge1突变分析第73-92页
            3.2.2.3 bulge2碱基U的突变分析第92-98页
        3.2.3 讨论第98-101页
4 全文总结第101-103页
参考文献第103-110页
附录A:本论文中所用病毒缩写及中英文对照第110-111页
附录B:本论文所用缩写词及中英文对照第111-113页
附录C:常用缓冲液和培养基配方第113-116页

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