摘要 | 第4-5页 |
Abstract | 第5页 |
第一章 引言 | 第8-14页 |
1.1 选题背景及研究意义 | 第8-9页 |
1.2 DNA结合蛋白 | 第9-10页 |
1.3 国内外研究现状 | 第10-12页 |
1.3.1 滤膜结合实验 | 第10-11页 |
1.3.2 X射线衍射晶体成像法 | 第11页 |
1.3.3 核磁共振成像法 | 第11页 |
1.3.4 生物信息学方法 | 第11-12页 |
1.4 本文的组织结构 | 第12-14页 |
第二章 DNA结合蛋白预测研究概述 | 第14-21页 |
2.1 DNA结合蛋白数据库 | 第14-16页 |
2.1.1 UniProt数据库 | 第14-15页 |
2.1.2 PDB数据库 | 第15-16页 |
2.2 预测DNA结合蛋白的方法概述 | 第16-18页 |
2.2.1 基于蛋白质结构的方法 | 第16-17页 |
2.2.2 基于蛋白质序列的方法 | 第17-18页 |
2.3 主要研究内容 | 第18-21页 |
第三章 基于特征融合与二元萤火虫算法的DNA结合蛋白预测方法 | 第21-33页 |
3.1 数据集构建 | 第21-22页 |
3.2 多特征融合 | 第22-27页 |
3.2.1 进化保守性 | 第22-24页 |
3.2.2 二级结构基序 | 第24-26页 |
3.2.3 物理化学属性 | 第26-27页 |
3.3 支持向量机 | 第27-28页 |
3.4 基于萤火虫算法的特征选择 | 第28-33页 |
3.4.1 萤火虫算法 | 第28-30页 |
3.4.2 二元萤火虫算法 | 第30-33页 |
第四章 实验结果与讨论 | 第33-43页 |
4.1 评价标准 | 第33-34页 |
4.2 实验所使用的数据集 | 第34页 |
4.3 预测模型的设置与表现 | 第34-36页 |
4.4 多特征融合方法的比较与分析 | 第36-37页 |
4.5 二元萤火虫算法与其他特征选择方法的比较 | 第37-39页 |
4.6 特征在特征子集中的贡献分析 | 第39-40页 |
4.7 预测方法与现有方法的比较 | 第40-42页 |
4.8 本章小结 | 第42-43页 |
第五章 在线预测服务器 | 第43-47页 |
5.1 服务器简介 | 第43页 |
5.2 使用方法介绍 | 第43-47页 |
第六章 结论与展望 | 第47-48页 |
参考文献 | 第48-51页 |
致谢 | 第51-52页 |
在学期间公开发表论文及著作情况 | 第52页 |