摘要 | 第6-7页 |
Abstract | 第7页 |
第一章 绪论 | 第10-31页 |
1.1 转录组学研究 | 第10-14页 |
1.1.1 组学发展与研究概述 | 第10-11页 |
1.1.2 转录组 | 第11-13页 |
1.1.3 转录组学与比较转录组学 | 第13-14页 |
1.2 转录组研究方法 | 第14-22页 |
1.2.1 现阶段对转录组研究的基本方法 | 第14-18页 |
1.2.2 高通量转录组测序技术(RNA-seq) | 第18-22页 |
1.3 大型真菌研究及两种牛肝菌研究进展 | 第22-30页 |
1.3.1 大型真菌研究概述 | 第22-28页 |
1.3.2 牛肝菌的研究进展 | 第28-30页 |
1.4 本课题研究内容与目的 | 第30-31页 |
第二章 实验材料与方法 | 第31-42页 |
2.1 实验材料 | 第31-33页 |
2.1.1 实验样本采集 | 第31页 |
2.1.2 主要实验仪器 | 第31-32页 |
2.1.3 主要试剂 | 第32页 |
2.1.4 试剂配制 | 第32-33页 |
2.2 实验方法 | 第33-42页 |
2.2.1 总RNA提取 | 第33-35页 |
2.2.2 总RNA样品质量检测 | 第35-36页 |
2.2.3 文库构建与测序 | 第36-37页 |
2.2.4 转录组测序数据预处理 | 第37-38页 |
2.2.5 转录组数据组装、注释与分析 | 第38-42页 |
第三章 结果与讨论 | 第42-59页 |
3.1 总的RNA样品的质量检测 | 第42-44页 |
3.1.1 琼脂糖(Agar)凝胶电泳检测结果 | 第42页 |
3.1.2 总RNA样品的紫外分光光度计检测 | 第42-43页 |
3.1.3 总RNA样品的Agilent 2100检测 | 第43-44页 |
3.2 转录组文库构建与测序 | 第44页 |
3.3 转录组原始测序数据的统计 | 第44-46页 |
3.4 真菌转录组的组装 | 第46-49页 |
3.5 真菌转录组的功能注释 | 第49-52页 |
3.6 真菌的遗传标记SSR分析 | 第52-55页 |
3.7 远东疣柄牛肝菌与双色牛肝菌直系同源基因分析 | 第55-56页 |
3.8 真菌转录组中与碳水化合物活性酶相关基因 | 第56-59页 |
参考文献 | 第59-64页 |
附表和附图 | 第64-80页 |
致谢 | 第80-82页 |
附录A | 第82页 |