| 致谢 | 第6-7页 |
| 中文摘要 | 第7-12页 |
| 英文摘要 | 第12-16页 |
| 缩写、符号及术语表 | 第17-22页 |
| 第一部分 肝硬化患者艰难梭菌定植及感染状况分析 | 第22-39页 |
| 前言 | 第22-23页 |
| 1 实验材料和方法 | 第23-30页 |
| 1.1 研究对象和标本 | 第23页 |
| 1.2 主要试剂和仪器 | 第23-25页 |
| 1.3 实验方法及流程 | 第25-30页 |
| 1.4 统计学分析 | 第30页 |
| 2 实验结果 | 第30-36页 |
| 2.1 肝硬化患者粪便艰难梭菌定植率及ST分布 | 第30-32页 |
| 2.2 艰难梭菌定植危险因素分析 | 第32-36页 |
| 3 讨论 | 第36-39页 |
| 第二部分 肝硬化患者艰难梭菌感染的危险因素分析 | 第39-52页 |
| 前言 | 第39-40页 |
| 1 实验材料 | 第40-44页 |
| 1.1 研究对象 | 第40-41页 |
| 1.2 患者临床标本的采集 | 第41页 |
| 1.3 质控菌株 | 第41页 |
| 1.4 主要试剂和仪器 | 第41-42页 |
| 1.5 研究方法及流程 | 第42-44页 |
| 1.6 统计学分析 | 第44页 |
| 2 实验结果 | 第44-48页 |
| 2.1 CDI组和NCDI组临床特征比较 | 第44-45页 |
| 2.2 CDI组和NCDI组肝硬化并发症以及临床干预因素比较 | 第45-46页 |
| 2.3 肝硬化患者CDI危险因素分析的单因素分析结果 | 第46-47页 |
| 2.4 肝硬化患者CDI危险因素的多因素二元LOGESTIC回归分析 | 第47-48页 |
| 3 讨论 | 第48-52页 |
| 第三部分 肠道菌群结构多样性对肝硬化艰难梭菌携带患者发生CDI的机制研究 | 第52-94页 |
| 前言 | 第52-54页 |
| 1 实验材料 | 第54-56页 |
| 1.1 实验耗材和试剂见表 | 第54-55页 |
| 1.2 仪器设备详见表 | 第55-56页 |
| 2 实验方法及流程 | 第56-64页 |
| 2.1 研究对象 | 第57-58页 |
| 2.2 测序流程 | 第58页 |
| 2.3 粪便样本采集及处理 | 第58页 |
| 2.4 粪便样本菌群DNA的抽提 | 第58-59页 |
| 2.5 PCR扩增 | 第59-60页 |
| 2.6 MISEQ文库构建 | 第60页 |
| 2.7 Miseq测序 | 第60页 |
| 2.8 生物信息学分析 | 第60-63页 |
| 2.9 统计方法 | 第63-64页 |
| 3 实验结果 | 第64-91页 |
| 3.1 MESIQ测序结果和多样性分析 | 第64-73页 |
| 3.2 稀释性曲线 | 第73页 |
| 3.3 物种组成分析 | 第73-82页 |
| 3.4 主坐标分析 | 第82-83页 |
| 3.5 NMDS分析(NMDS) | 第83-84页 |
| 3.6 基于UNIFRAC的PCoA分析 | 第84-85页 |
| 3.7 样本层次聚类树 | 第85-86页 |
| 3.8 序列分类比较 | 第86-89页 |
| 3.9 LEFSE分析 | 第89-91页 |
| 4 讨论 | 第91-94页 |
| 参考文献 | 第94-103页 |
| 综述 | 第103-120页 |
| 参考文献 | 第113-120页 |
| 作者简历及在学期间所取得的科研成果 | 第120页 |
