摘要 | 第8-10页 |
ABSTRACT | 第10-11页 |
第一章 文献综述 | 第14-20页 |
1.1 鱼类的免疫系统 | 第14-15页 |
1.1.1 鱼类的先天免疫系统 | 第15页 |
1.1.2 鱼类的免疫组织和器官 | 第15页 |
1.2 NLR的命名与结构 | 第15-16页 |
1.3 研究进展 | 第16-17页 |
1.3.1 哺乳类NLR功能研究进展 | 第16页 |
1.3.2 鱼类NLR功能研究进展 | 第16-17页 |
1.4 NLR的免疫识别和信号传导 | 第17-18页 |
1.4.1 NLR受体对配体的识别 | 第17页 |
1.4.2 NLR参与的信号途径 | 第17-18页 |
1.5 本研究的目的与意义 | 第18-20页 |
第二章 鮸鱼NOD1和NOD2的分子结构和表达分析 | 第20-47页 |
2.1 实验材料和方法 | 第20-31页 |
2.1.1 实验材料 | 第20页 |
2.1.2 实验方法 | 第20-31页 |
2.1.2.1 病原侵染实验 | 第20-21页 |
2.1.2.2 组织RNA的提取 | 第21页 |
2.1.2.3 样品cDNA的合成 | 第21-22页 |
2.1.2.4 序列分析及系统树 | 第22-30页 |
2.1.2.5 分子进化分析 | 第30页 |
2.1.2.6 表达分析 | 第30-31页 |
2.2 结果与分析 | 第31-44页 |
2.2.1 鮸鱼NOD1和NOD2的生物信息学结果 | 第31-34页 |
2.2.2 鮸鱼NOD1和NOD2的序列分析和系统树 | 第34-36页 |
2.2.3 鮸鱼NOD1和NOD2的线性分析 | 第36-38页 |
2.2.4 NOD1和NOD2的进化分析 | 第38-43页 |
2.2.4.1 NOD1和NOD2祖先枝上的正选择位点 | 第39-41页 |
2.2.4.2 NOD1和NOD2现生枝上的正选择位点 | 第41-43页 |
2.2.5 鮸鱼NOD1和NOD2表达模式分析 | 第43-44页 |
2.3 讨论 | 第44-47页 |
第三章 鮸鱼NLRC3,NLRC5和NLRX1的分子结构和表达分析 | 第47-63页 |
3.1 材料与方法 | 第47-50页 |
3.1.1 实验材料 | 第47页 |
3.1.2 实验方法 | 第47-50页 |
3.2 结果与分析 | 第50-61页 |
3.2.1 生物信息学结果 | 第50-52页 |
3.2.2 多序列比对和系统树 | 第52-53页 |
3.2.3 比较分析和进化模式 | 第53-55页 |
3.2.4 NLRX1基因的进化分析 | 第55-59页 |
3.2.4.1 NLRX1祖先枝上的正选择位点 | 第55-57页 |
3.2.4.2 NLRX1现生枝上的正选择位点 | 第57-59页 |
3.2.5 表达模式 | 第59-61页 |
3.2.5.1 NLRC3, NLRC5和NLRX1在健康组织中的表达分析 | 第59-60页 |
3.2.5.2 NLRC3, NLRC5和NLRX1在病原刺激下的表达分析 | 第60-61页 |
3.3 讨论 | 第61-63页 |
第四章 鮸鱼NLR-C家族基因扩张和表达分析 | 第63-73页 |
4.1 材料与方法 | 第63-64页 |
4.1.1 实验材料 | 第63页 |
4.1.2 实验方法 | 第63-64页 |
4.2 结果与分析 | 第64-72页 |
4.2.1 NLR-B和NLR-C家族基因的确定 | 第64-66页 |
4.2.2 NLR-B30.2 家族基因的比较和进化分析 | 第66-68页 |
4.2.3 NLR-B30.2 基因的进化选择 | 第68-69页 |
4.2.4 转录组水平下NLR-B30.2 基因的表达变化 | 第69-70页 |
4.2.5 病原菌刺激下NLR-B30.2 基因的表达分析 | 第70-72页 |
4.3 讨论 | 第72-73页 |
结论 | 第73-75页 |
参考文献 | 第75-82页 |
致谢 | 第82-83页 |
在读期间发表的学术论文以及研究成果 | 第83页 |