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鮸鱼NLR家族的基因组水平研究和表达模式分析

摘要第8-10页
ABSTRACT第10-11页
第一章 文献综述第14-20页
    1.1 鱼类的免疫系统第14-15页
        1.1.1 鱼类的先天免疫系统第15页
        1.1.2 鱼类的免疫组织和器官第15页
    1.2 NLR的命名与结构第15-16页
    1.3 研究进展第16-17页
        1.3.1 哺乳类NLR功能研究进展第16页
        1.3.2 鱼类NLR功能研究进展第16-17页
    1.4 NLR的免疫识别和信号传导第17-18页
        1.4.1 NLR受体对配体的识别第17页
        1.4.2 NLR参与的信号途径第17-18页
    1.5 本研究的目的与意义第18-20页
第二章 鮸鱼NOD1和NOD2的分子结构和表达分析第20-47页
    2.1 实验材料和方法第20-31页
        2.1.1 实验材料第20页
        2.1.2 实验方法第20-31页
            2.1.2.1 病原侵染实验第20-21页
            2.1.2.2 组织RNA的提取第21页
            2.1.2.3 样品cDNA的合成第21-22页
            2.1.2.4 序列分析及系统树第22-30页
            2.1.2.5 分子进化分析第30页
            2.1.2.6 表达分析第30-31页
    2.2 结果与分析第31-44页
        2.2.1 鮸鱼NOD1和NOD2的生物信息学结果第31-34页
        2.2.2 鮸鱼NOD1和NOD2的序列分析和系统树第34-36页
        2.2.3 鮸鱼NOD1和NOD2的线性分析第36-38页
        2.2.4 NOD1和NOD2的进化分析第38-43页
            2.2.4.1 NOD1和NOD2祖先枝上的正选择位点第39-41页
            2.2.4.2 NOD1和NOD2现生枝上的正选择位点第41-43页
        2.2.5 鮸鱼NOD1和NOD2表达模式分析第43-44页
    2.3 讨论第44-47页
第三章 鮸鱼NLRC3,NLRC5和NLRX1的分子结构和表达分析第47-63页
    3.1 材料与方法第47-50页
        3.1.1 实验材料第47页
        3.1.2 实验方法第47-50页
    3.2 结果与分析第50-61页
        3.2.1 生物信息学结果第50-52页
        3.2.2 多序列比对和系统树第52-53页
        3.2.3 比较分析和进化模式第53-55页
        3.2.4 NLRX1基因的进化分析第55-59页
            3.2.4.1 NLRX1祖先枝上的正选择位点第55-57页
            3.2.4.2 NLRX1现生枝上的正选择位点第57-59页
        3.2.5 表达模式第59-61页
            3.2.5.1 NLRC3, NLRC5和NLRX1在健康组织中的表达分析第59-60页
            3.2.5.2 NLRC3, NLRC5和NLRX1在病原刺激下的表达分析第60-61页
    3.3 讨论第61-63页
第四章 鮸鱼NLR-C家族基因扩张和表达分析第63-73页
    4.1 材料与方法第63-64页
        4.1.1 实验材料第63页
        4.1.2 实验方法第63-64页
    4.2 结果与分析第64-72页
        4.2.1 NLR-B和NLR-C家族基因的确定第64-66页
        4.2.2 NLR-B30.2 家族基因的比较和进化分析第66-68页
        4.2.3 NLR-B30.2 基因的进化选择第68-69页
        4.2.4 转录组水平下NLR-B30.2 基因的表达变化第69-70页
        4.2.5 病原菌刺激下NLR-B30.2 基因的表达分析第70-72页
    4.3 讨论第72-73页
结论第73-75页
参考文献第75-82页
致谢第82-83页
在读期间发表的学术论文以及研究成果第83页

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