| 摘要 | 第3-4页 |
| abstract | 第4页 |
| 主要英文缩略词对照表 | 第8-9页 |
| 第1章 前言 | 第9-41页 |
| 1.1 核糖体的组成与功能 | 第9-13页 |
| 1.2 线粒体核糖体结构与功能 | 第13-15页 |
| 1.3 原核生物的翻译过程 | 第15-17页 |
| 1.3.1 翻译起始 | 第15页 |
| 1.3.2 翻译延伸 | 第15-16页 |
| 1.3.3 翻译终止 | 第16页 |
| 1.3.4 核糖体再循环 | 第16-17页 |
| 1.4 真核生物核糖体的翻译 | 第17-19页 |
| 1.4.1 翻译起始 | 第17-19页 |
| 1.4.2 翻译延伸 | 第19页 |
| 1.4.3 翻译终止和再循环 | 第19页 |
| 1.5 核糖体的组装与成熟 | 第19-30页 |
| 1.5.1 最初的 90S核糖体前体 | 第20-23页 |
| 1.5.2 亚基前体在核质中的加工 | 第23-24页 |
| 1.5.3 核糖体亚基前体的核输出 | 第24-27页 |
| 1.5.4 核糖体亚基在胞质中的成熟 | 第27-30页 |
| 1.6 核糖体疾病与信号通路 | 第30-32页 |
| 1.7 冷冻电镜的成像介绍 | 第32-39页 |
| 1.7.1 单颗粒重构的原理 | 第33-35页 |
| 1.7.2 冷冻电镜单颗粒重构的技术性突破 | 第35-36页 |
| 1.7.3 冷冻电镜的研究进展 | 第36-37页 |
| 1.7.4 典型的高分辨率结构的计算流程 | 第37-39页 |
| 1.8 本课题的研究意义 | 第39-41页 |
| 第2章 实验材料与方法 | 第41-56页 |
| 2.1 实验仪器 | 第41-42页 |
| 2.2 实验材料 | 第42-43页 |
| 2.2.1 菌株 | 第42页 |
| 2.2.2 载体 | 第42页 |
| 2.2.3 培养基 | 第42页 |
| 2.2.4 缓冲液 | 第42-43页 |
| 2.3 实验方法 | 第43-56页 |
| 2.3.1 目的基因的克隆 | 第43-45页 |
| 2.3.2 蛋白的表达与纯化 | 第45-46页 |
| 2.3.3 核糖体的纯化与分离 | 第46-47页 |
| 2.3.4 Sdo1蛋白与核糖体的结合与验证 | 第47页 |
| 2.3.5 蔗糖密度梯度离心分析 | 第47-48页 |
| 2.3.6 共沉淀分析（Co-sedimentation assay） | 第48页 |
| 2.3.7 生物膜层表面干涉技术（Bio-layer Interferometry） | 第48页 |
| 2.3.8 交联质谱分析 | 第48-49页 |
| 2.3.9 TAP方法纯化pre-60S·Nmd3复合物 | 第49页 |
| 2.3.10 电镜样品的制备 | 第49-51页 |
| 2.3.11 冷冻样品数据收集和处理 | 第51-53页 |
| 2.3.12 Pre-60S·Nmd3复合物的原子模型搭建 | 第53-54页 |
| 2.3.13 Pre-60S·Nmd3复合物原子模型的精修 | 第54页 |
| 2.3.14 Pre-60S·Nmd3复合物原子模型的效验 | 第54页 |
| 2.3.15 Pre-60S·Nmd3复合物的数据统计结果 | 第54-56页 |
| 第3章 Sdo1在酵母核糖体大亚基成熟过程中的研究 | 第56-72页 |
| 3.1 引言 | 第56-57页 |
| 3.2 实验结果 | 第57-69页 |
| 3.2.1 Sdo1与 60S的体外结合 | 第57-58页 |
| 3.2.2 Sdo1诱导 60S的二聚化 | 第58-62页 |
| 3.2.3 60S-Sdo1复合物的冷冻样品收集和分类分析 | 第62-64页 |
| 3.2.4 Sdo1的结构域I和II与 60S大亚基相互作用 | 第64-65页 |
| 3.2.5 Sdo1的domainI-II诱导引发 60S大亚基的二聚化 | 第65-67页 |
| 3.2.6 利用交联质谱的方法确定Sdo1在 60S上的作用位置 | 第67-68页 |
| 3.2.7 Sdo1与 60S结合模型的分析 | 第68-69页 |
| 3.3 总结 | 第69-72页 |
| 第4章 Nmd3在酵母核糖体大亚基成熟过程中的研究 | 第72-91页 |
| 4.1 引言 | 第72页 |
| 4.2 实验结果 | 第72-90页 |
| 4.2.1 TAP纯化pre-60S·Nmd3复合物 | 第72-74页 |
| 4.2.2 冷冻样品数据收集 | 第74页 |
| 4.2.3 冷冻样品数据的处理 | 第74-77页 |
| 4.2.4 Pre-60S·Nmd3复合物原子模型的搭建 | 第77-78页 |
| 4.2.5 Pre-60S·Nmd3复合物结构的整体分析 | 第78-80页 |
| 4.2.6 Nmd3的结构分析 | 第80-81页 |
| 4.2.7 Nmd3与 25S rRNA相互作用关系 | 第81-85页 |
| 4.2.8 Nmd3的OB结构域和uL1和eL42的相互作用 | 第85-86页 |
| 4.2.9 Lsg1存在于pre-60S·Nmd3复合物中 | 第86-87页 |
| 4.2.10 Reh1结合在pre-60S·Nmd3的肽链通道中（peptide exit tunnel） | 第87-90页 |
| 4.3 总结 | 第90-91页 |
| 第5章 总结与展望 | 第91-97页 |
| 5.1 总结 | 第91-95页 |
| 5.2 展望 | 第95-97页 |
| 参考文献 | 第97-110页 |
| 致谢 | 第110-112页 |
| 个人简历、在学期间发表的学术论文与研究成果 | 第112页 |
