| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 第一章 绪论 | 第10-16页 |
| 1.1 生物信息学简介 | 第10-11页 |
| 1.2 相关生物学背景知识介绍 | 第11-12页 |
| 1.2.1 脂滴 | 第11页 |
| 1.2.2 RHA1 | 第11页 |
| 1.2.3 Dynamin动力蛋白 | 第11-12页 |
| 1.3 论文的主要研究内容及其结构安排 | 第12-16页 |
| 1.3.1 论文的主要工作 | 第12-14页 |
| 1.3.2 论文的章节安排 | 第14-16页 |
| 第二章 原核生物中Dynamin动力蛋白家族的功能与进化 | 第16-29页 |
| 2.1 主要数据源 | 第16页 |
| 2.1.1 NCBI数据库 | 第16页 |
| 2.1.2 PFAM数据库 | 第16页 |
| 2.2 实验环境 | 第16-17页 |
| 2.3 实验数据 | 第17-19页 |
| 2.4 算法思想 | 第19-20页 |
| 2.4.1 BLAST | 第19-20页 |
| 2.4.2 最大似然法 | 第20页 |
| 2.4.3 ClustalW | 第20页 |
| 2.5 实验结果与分析 | 第20-29页 |
| 2.5.1 RHA1中类Dynamin动力蛋白的起源与进化 | 第20-24页 |
| 2.5.2 RHA1中类Dynamin动力蛋白的蛋白质域结构与进化 | 第24-26页 |
| 2.5.3 Dynamin动力蛋白的定位及相互作用蛋白 | 第26-27页 |
| 2.5.4 Dynamin动力蛋白在细胞膜系统动态变化过程中的功能假说 | 第27-29页 |
| 第三章 原核生物中操纵子和蛋白质域在进化过程中动态变化的系统研究 | 第29-41页 |
| 3.1 主要数据源 | 第29页 |
| 3.1.1 DAVID数据库 | 第29页 |
| 3.1.2 KEGG数据库 | 第29页 |
| 3.2 实验环境 | 第29-30页 |
| 3.3 实验数据 | 第30-31页 |
| 3.3.1 5,556×340操纵子动态变化矩阵 | 第30-31页 |
| 3.3.2 2,411×340蛋白质域动态变化矩阵 | 第31页 |
| 3.4 算法思想 | 第31-32页 |
| 3.4.1 操纵子预测 | 第31-32页 |
| 3.4.2 蛋白质结构域预测 | 第32页 |
| 3.4.3 双向聚类分析 | 第32页 |
| 3.5 实验结果与分析 | 第32-41页 |
| 3.5.1 RHA1中的操纵子在340个原核生物基因组中的动态变化分析 | 第32-35页 |
| 3.5.2 RHA1中的蛋白质域在340个原核生物基因组中的动态变化分析 | 第35-38页 |
| 3.5.3 RHA1中操纵子的保守性及其功能分析 | 第38-39页 |
| 3.5.4 RHA1中操纵子的保守性及其参与的通路分析 | 第39-41页 |
| 第四章 总结与展望 | 第41-44页 |
| 4.1 论文总结 | 第41-43页 |
| 4.2 进一步展望 | 第43-44页 |
| 参考文献 | 第44-47页 |
| 致谢 | 第47-48页 |
| 攻读硕士学位期间发表的论文及参与项目 | 第48页 |
