作者简介 | 第5-7页 |
摘要 | 第7-10页 |
ABSTRACT | 第10-13页 |
第一章 蝎毒素研究进展 | 第17-34页 |
§1.1 引言 | 第17页 |
§1.2 蝎的地域分布与系统分类 | 第17-18页 |
§1.3 蝎毒素多肽 | 第18-26页 |
1.3.1 蝎钠通道毒素 | 第18-21页 |
1.3.2 蝎钾通道毒素 | 第21-22页 |
1.3.3 蝎氯通道毒素 | 第22-23页 |
1.3.4 蝎钙通道毒素 | 第23页 |
1.3.5 Kunitz类型蝎毒素 | 第23页 |
1.3.6 蝎脂类分解激活肽 | 第23-24页 |
1.3.7 蝎抗菌肽 | 第24-25页 |
1.3.8 蝎缓激肽增效肽 | 第25页 |
1.3.9 蝎阴离子多肽 | 第25页 |
1.3.10 其它蝎毒液成分 | 第25-26页 |
§1.4 蝎毒素多肽研究方法 | 第26-30页 |
1.4.1 多肽分离纯化和序列鉴定 | 第26页 |
1.4.2 基因克隆与表达 | 第26-27页 |
1.4.3 转录组与蛋白质组研究 | 第27-29页 |
1.4.4 基因组研究 | 第29-30页 |
§1.5 蝎毒素研究意义 | 第30-32页 |
1.5.1 为离子通道和细胞受体研究提供丰富探针 | 第30页 |
1.5.2 为多肽药物开发提供丰富模板 | 第30-32页 |
§1.6 Androctrous属蝎研究概况 | 第32页 |
§1.7 本课题目的和意义 | 第32-34页 |
第二章 黑肥尾蝎(Androctonus bicolor)转录组学研究 | 第34-60页 |
§2.1 引言 | 第34-35页 |
§2.2 材料和方法 | 第35-37页 |
2.2.1 材料及主要试剂 | 第35页 |
2.2.2 黑肥尾蝎(A.bicolor)毒腺组织总RNA提取 | 第35页 |
2.2.3 mRNA分离纯化 | 第35-36页 |
2.2.4 cDNA第一链合成 | 第36页 |
2.2.5 cDNA第二链合成 | 第36页 |
2.2.6 连接与转化 | 第36-37页 |
2.2.7 PCR策略筛选cDNA文库 | 第37页 |
2.2.8 生物信息学分析 | 第37页 |
§2.3 结果分析 | 第37-58页 |
2.3.1 黑肥尾蝎(A.bicolor)毒腺cDNA测序及毒素多肽分类 | 第37-38页 |
2.3.2 钠通道毒素 | 第38-42页 |
2.3.3 短链钾通道毒素 | 第42-44页 |
2.3.4 长链钾通道毒素 | 第44-46页 |
2.3.5 钙通道毒素 | 第46-47页 |
2.3.6 抗菌肽 | 第47-48页 |
2.3.7 防御肽 | 第48-49页 |
2.3.8 缓激肽增效肽 | 第49页 |
2.3.9 阴离子肽 | 第49-51页 |
2.3.10 Kunitz类型毒素 | 第51-52页 |
2.3.11 不含二硫键新型多肽 | 第52-53页 |
2.3.12 含一对二硫键新型多肽 | 第53-54页 |
2.3.13 含两对二硫键新型多肽 | 第54-55页 |
2.3.14 含三对二硫键新型多肽 | 第55-56页 |
2.3.15 含五对二硫键新型多肽 | 第56-57页 |
2.3.16 含六对二硫键新多肽 | 第57-58页 |
§2.4 讨论 | 第58-59页 |
§2.5 本章小结 | 第59-60页 |
第三章 黑肥尾蝎(Androctonus bicolor)蛋白质组研究 | 第60-78页 |
§3.1 引言 | 第60-61页 |
§3.2 材料和方法 | 第61-63页 |
3.2.1 试剂 | 第61页 |
3.2.2 毒液的采集 | 第61页 |
3.2.3 粗毒SDS聚丙烯酰胺电泳 | 第61-62页 |
3.2.4 胶内酶解 | 第62页 |
3.2.5 nano LC-ESI-MS/MS(nano Liquid Chromatography-ElectroSpray Ionisationtandem Mass Spectrometry)分析 | 第62页 |
3.2.6 数据库搜索和多肽鉴定 | 第62-63页 |
§3.3 结果分析 | 第63-75页 |
3.3.1 黑肥尾蝎(A.bicolor)蛋白质组与其转录组数据匹配分析 | 第63-64页 |
3.3.2 黑肥尾蝎(A.bicolor)蛋白质组与其它蝎种多肽序列匹配分析 | 第64-65页 |
3.3.3 黑肥尾蝎(A.bicolor)蛋白质组与马氏正钳蝎(M. martensii)多肽序列匹配分析 | 第65-67页 |
3.3.4 黑肥尾蝎(A.bicolor)蛋白质组与墨西哥雕像木蝎(C.exilicauda)多肽序列匹配分析 | 第67页 |
3.3.5 不同数据库匹配序列比较分析 | 第67-68页 |
3.3.6 黑肥尾蝎(A.bicolor)毒液鉴定到的毒素多肽序列覆盖率分析 | 第68-75页 |
§3.4 讨论 | 第75-76页 |
§3.5 本章小结 | 第76-78页 |
第四章 东亚钳蝎(Mesobuthus martensii Karsch)三个钾通道毒素的鉴定与分析 | 第78-93页 |
§4.1 引言 | 第78页 |
§4.2 材料和方法 | 第78-80页 |
4.2.1 材料及主要试剂 | 第78-79页 |
4.2.2 蝎毒腺cDNA文库构建 | 第79页 |
4.2.3 cDNA文库筛选 | 第79页 |
4.2.4 蝎基因组DNA提取 | 第79页 |
4.2.5 PCR扩增和基因克隆 | 第79-80页 |
4.2.6 生物信息学分析 | 第80页 |
§4.3 结果 | 第80-91页 |
4.3.1 三个新钾通道毒素 | 第80-82页 |
4.3.2 BmKcug1序列分析 | 第82-84页 |
4.3.3 BmKcug2序列分析 | 第84-85页 |
4.3.4 BmKcugx序列分析 | 第85页 |
4.3.5 BmKcug2和BmKcug1基因组织结构分析 | 第85-87页 |
4.3.6 BmKcugx基因组织结构分析 | 第87-88页 |
4.3.7 蝎钾通道毒素基因内含子数目多样性 | 第88-89页 |
4.3.8 BmKcug2转录本5'UTR区域可变剪切 | 第89-90页 |
4.3.9 BmKcug1a和BmKcug2基因5'UTR能否显著增加基因的表达水平? | 第90-91页 |
§4.4 讨论 | 第91-92页 |
§4.5 本章小结 | 第92-93页 |
第五章 自然选择促进东亚钳蝎(Mesobuthus martensii Karsch)钾通道毒素基因内含子获得 | 第93-106页 |
§5.1 引言 | 第93-94页 |
§5.2 材料与方法 | 第94-97页 |
5.2.1 材料及主要试剂 | 第94页 |
5.2.2 蝎基因组DNA提取 | 第94-95页 |
5.2.3 引物设计与基因扩增 | 第95页 |
5.2.4 PCR产物纯化 | 第95-96页 |
5.2.5 连接与转化 | 第96页 |
5.2.6 生物信息学分析 | 第96页 |
5.2.7 蝎钾通道毒素基因内含子获得/丢失事件判断 | 第96-97页 |
§5.3 结果 | 第97-104页 |
5.3.1 abTx1序列分析 | 第97-98页 |
5.3.2 东亚钳蝎钾通道毒素基因克隆与基因组织结构分析 | 第98页 |
5.3.3 蝎钾通道毒素二级结构分析 | 第98-101页 |
5.3.4 蝎钾通道毒素基因内含子分析 | 第101-102页 |
5.3.5 蝎钾通道毒素进化分析 | 第102-104页 |
5.3.6 蝎钾通道毒素5'内含子获得事件显著增加基因表达水平 | 第104页 |
§5.4 讨论 | 第104-105页 |
§5.5 本章小结 | 第105-106页 |
研究总结与展望 | 第106-108页 |
§ 研究总结 | 第106-107页 |
§ 展望 | 第107-108页 |
致谢 | 第108-109页 |
参考文献 | 第109-121页 |
附录 | 第121-129页 |