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黑肥尾蝎(Androctonus bicolor)毒腺转录组与蛋白组学研究及蝎钾通道毒素分子进化分析

作者简介第5-7页
摘要第7-10页
ABSTRACT第10-13页
第一章 蝎毒素研究进展第17-34页
    §1.1 引言第17页
    §1.2 蝎的地域分布与系统分类第17-18页
    §1.3 蝎毒素多肽第18-26页
        1.3.1 蝎钠通道毒素第18-21页
        1.3.2 蝎钾通道毒素第21-22页
        1.3.3 蝎氯通道毒素第22-23页
        1.3.4 蝎钙通道毒素第23页
        1.3.5 Kunitz类型蝎毒素第23页
        1.3.6 蝎脂类分解激活肽第23-24页
        1.3.7 蝎抗菌肽第24-25页
        1.3.8 蝎缓激肽增效肽第25页
        1.3.9 蝎阴离子多肽第25页
        1.3.10 其它蝎毒液成分第25-26页
    §1.4 蝎毒素多肽研究方法第26-30页
        1.4.1 多肽分离纯化和序列鉴定第26页
        1.4.2 基因克隆与表达第26-27页
        1.4.3 转录组与蛋白质组研究第27-29页
        1.4.4 基因组研究第29-30页
    §1.5 蝎毒素研究意义第30-32页
        1.5.1 为离子通道和细胞受体研究提供丰富探针第30页
        1.5.2 为多肽药物开发提供丰富模板第30-32页
    §1.6 Androctrous属蝎研究概况第32页
    §1.7 本课题目的和意义第32-34页
第二章 黑肥尾蝎(Androctonus bicolor)转录组学研究第34-60页
    §2.1 引言第34-35页
    §2.2 材料和方法第35-37页
        2.2.1 材料及主要试剂第35页
        2.2.2 黑肥尾蝎(A.bicolor)毒腺组织总RNA提取第35页
        2.2.3 mRNA分离纯化第35-36页
        2.2.4 cDNA第一链合成第36页
        2.2.5 cDNA第二链合成第36页
        2.2.6 连接与转化第36-37页
        2.2.7 PCR策略筛选cDNA文库第37页
        2.2.8 生物信息学分析第37页
    §2.3 结果分析第37-58页
        2.3.1 黑肥尾蝎(A.bicolor)毒腺cDNA测序及毒素多肽分类第37-38页
        2.3.2 钠通道毒素第38-42页
        2.3.3 短链钾通道毒素第42-44页
        2.3.4 长链钾通道毒素第44-46页
        2.3.5 钙通道毒素第46-47页
        2.3.6 抗菌肽第47-48页
        2.3.7 防御肽第48-49页
        2.3.8 缓激肽增效肽第49页
        2.3.9 阴离子肽第49-51页
        2.3.10 Kunitz类型毒素第51-52页
        2.3.11 不含二硫键新型多肽第52-53页
        2.3.12 含一对二硫键新型多肽第53-54页
        2.3.13 含两对二硫键新型多肽第54-55页
        2.3.14 含三对二硫键新型多肽第55-56页
        2.3.15 含五对二硫键新型多肽第56-57页
        2.3.16 含六对二硫键新多肽第57-58页
    §2.4 讨论第58-59页
    §2.5 本章小结第59-60页
第三章 黑肥尾蝎(Androctonus bicolor)蛋白质组研究第60-78页
    §3.1 引言第60-61页
    §3.2 材料和方法第61-63页
        3.2.1 试剂第61页
        3.2.2 毒液的采集第61页
        3.2.3 粗毒SDS聚丙烯酰胺电泳第61-62页
        3.2.4 胶内酶解第62页
        3.2.5 nano LC-ESI-MS/MS(nano Liquid Chromatography-ElectroSpray Ionisationtandem Mass Spectrometry)分析第62页
        3.2.6 数据库搜索和多肽鉴定第62-63页
    §3.3 结果分析第63-75页
        3.3.1 黑肥尾蝎(A.bicolor)蛋白质组与其转录组数据匹配分析第63-64页
        3.3.2 黑肥尾蝎(A.bicolor)蛋白质组与其它蝎种多肽序列匹配分析第64-65页
        3.3.3 黑肥尾蝎(A.bicolor)蛋白质组与马氏正钳蝎(M. martensii)多肽序列匹配分析第65-67页
        3.3.4 黑肥尾蝎(A.bicolor)蛋白质组与墨西哥雕像木蝎(C.exilicauda)多肽序列匹配分析第67页
        3.3.5 不同数据库匹配序列比较分析第67-68页
        3.3.6 黑肥尾蝎(A.bicolor)毒液鉴定到的毒素多肽序列覆盖率分析第68-75页
    §3.4 讨论第75-76页
    §3.5 本章小结第76-78页
第四章 东亚钳蝎(Mesobuthus martensii Karsch)三个钾通道毒素的鉴定与分析第78-93页
    §4.1 引言第78页
    §4.2 材料和方法第78-80页
        4.2.1 材料及主要试剂第78-79页
        4.2.2 蝎毒腺cDNA文库构建第79页
        4.2.3 cDNA文库筛选第79页
        4.2.4 蝎基因组DNA提取第79页
        4.2.5 PCR扩增和基因克隆第79-80页
        4.2.6 生物信息学分析第80页
    §4.3 结果第80-91页
        4.3.1 三个新钾通道毒素第80-82页
        4.3.2 BmKcug1序列分析第82-84页
        4.3.3 BmKcug2序列分析第84-85页
        4.3.4 BmKcugx序列分析第85页
        4.3.5 BmKcug2和BmKcug1基因组织结构分析第85-87页
        4.3.6 BmKcugx基因组织结构分析第87-88页
        4.3.7 蝎钾通道毒素基因内含子数目多样性第88-89页
        4.3.8 BmKcug2转录本5'UTR区域可变剪切第89-90页
        4.3.9 BmKcug1a和BmKcug2基因5'UTR能否显著增加基因的表达水平?第90-91页
    §4.4 讨论第91-92页
    §4.5 本章小结第92-93页
第五章 自然选择促进东亚钳蝎(Mesobuthus martensii Karsch)钾通道毒素基因内含子获得第93-106页
    §5.1 引言第93-94页
    §5.2 材料与方法第94-97页
        5.2.1 材料及主要试剂第94页
        5.2.2 蝎基因组DNA提取第94-95页
        5.2.3 引物设计与基因扩增第95页
        5.2.4 PCR产物纯化第95-96页
        5.2.5 连接与转化第96页
        5.2.6 生物信息学分析第96页
        5.2.7 蝎钾通道毒素基因内含子获得/丢失事件判断第96-97页
    §5.3 结果第97-104页
        5.3.1 abTx1序列分析第97-98页
        5.3.2 东亚钳蝎钾通道毒素基因克隆与基因组织结构分析第98页
        5.3.3 蝎钾通道毒素二级结构分析第98-101页
        5.3.4 蝎钾通道毒素基因内含子分析第101-102页
        5.3.5 蝎钾通道毒素进化分析第102-104页
        5.3.6 蝎钾通道毒素5'内含子获得事件显著增加基因表达水平第104页
    §5.4 讨论第104-105页
    §5.5 本章小结第105-106页
研究总结与展望第106-108页
    § 研究总结第106-107页
    § 展望第107-108页
致谢第108-109页
参考文献第109-121页
附录第121-129页

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