| 摘要 | 第5-11页 |
| ABSTRACT | 第11-20页 |
| 文中缩略词中英文对照 | 第21-27页 |
| 第一章 综述 | 第27-57页 |
| 1 骨骼肌生长发育的研究进展 | 第27-36页 |
| 1.1 骨骼肌的发生和发育 | 第27-30页 |
| 1.2 骨骼肌发育的相关基因 | 第30-32页 |
| 1.3 骨骼肌生长发育主要信号通路 | 第32-36页 |
| 2 MIRNA的研究进展 | 第36-50页 |
| 2.1 miRNA概述 | 第36-37页 |
| 2.2 miRNA的生物学过程 | 第37-40页 |
| 2.3 miRNA调控基因表达的机制 | 第40-42页 |
| 2.4 miRNA在肌肉中的生物学功能 | 第42-46页 |
| 2.5 miRNA的研究方法 | 第46-50页 |
| 3 猪骨骼肌MIRNA研究进展 | 第50-55页 |
| 3.1 猪miRNA的发现和鉴定 | 第50-51页 |
| 3.2 猪骨骼肌miRNA表达规律 | 第51-52页 |
| 3.3 比较基因组学在猪miRNA表达中的应用 | 第52页 |
| 3.4 miRNA的SNP与猪骨骼肌发育 | 第52-53页 |
| 3.5 猪骨骼肌miRNA的功能研究进展 | 第53-54页 |
| 3.6 miR-486在骨骼肌中的研究进展 | 第54-55页 |
| 4 本研究的目的和意义 | 第55-57页 |
| 第二章 猪骨骼肌小RNA文库构建和SOLEXA测序 | 第57-76页 |
| 前言 | 第58页 |
| 1 试验材料与方法 | 第58-64页 |
| 1.1 试验材料 | 第58-60页 |
| 1.2 试验方法 | 第60-64页 |
| 2 试验结果 | 第64-73页 |
| 2.1 总RNA的提取与质量检测 | 第64-65页 |
| 2.2 小RNA测序质量分析 | 第65-67页 |
| 2.3 小RNA测序结果生物信息学分析 | 第67-73页 |
| 3 分析与讨论 | 第73-74页 |
| 3.1 样品的选择 | 第73页 |
| 3.2 miRNA的文库构建和质量鉴定 | 第73-74页 |
| 3.3 不同品种猪不同日龄间的小RNA组成差异 | 第74页 |
| 4 小结 | 第74-76页 |
| 第三章 猪骨骼肌组织发育相关MIRNA的鉴定、表达和功能分析 | 第76-100页 |
| 前言 | 第77页 |
| 1 试验材料与方法 | 第77-84页 |
| 1.1 试验材料 | 第77-80页 |
| 1.2 试验方法 | 第80-84页 |
| 2 试验结果 | 第84-96页 |
| 2.1 猪已知miRNA及候选miRNA的鉴定 | 第84-87页 |
| 2.2 巴马小型猪和长白猪miRNA的差异表达分析 | 第87-91页 |
| 2.3 miRNA聚类分析 | 第91页 |
| 2.4 差异miRNA靶基因预测、GO注释和KEGG通路分析 | 第91-96页 |
| 3 分析与讨论 | 第96-99页 |
| 3.1 猪miRNA的鉴定 | 第96-97页 |
| 3.2 不同发育阶段差异miRNA的分析 | 第97页 |
| 3.3 巴马小型猪与长白猪差异miRNA的分析 | 第97-98页 |
| 3.4 差异miRNA的靶基因预测及功能分析 | 第98-99页 |
| 4 小结 | 第99-100页 |
| 第四章 猪骨骼肌发育相关MIRNA的组织分布和骨骼肌中的发育性变化规律 | 第100-116页 |
| 前言 | 第101-102页 |
| 1 试验材料与方法 | 第102-103页 |
| 1.1 试验材料 | 第102页 |
| 1.2 试验方法 | 第102-103页 |
| 2 试验结果 | 第103-110页 |
| 2.1 miRNA在两个品种猪的组织表达谱分析 | 第103-105页 |
| 2.2 miRNA在两个品种猪背最长肌的发育性变化 | 第105-107页 |
| 2.3 10个高丰度表达且差异显著的miRNA靶基因预测和功能分析 | 第107-110页 |
| 3 分析与讨论 | 第110-115页 |
| 3.1 miRNA的选择 | 第110页 |
| 3.2 miRNA表达检测方法的选择 | 第110-111页 |
| 3.3 miRNA的组织表达谱反映它们在猪组织发育中的作用 | 第111-113页 |
| 3.4 miRNA在猪骨骼肌的发育性变化反映它们在肌肉发育中的功能 | 第113-114页 |
| 3.5 10个高丰度差异表达的miRNA靶基因预测和功能分析 | 第114-115页 |
| 4 小结 | 第115-116页 |
| 第五章 猪MIR-486宿主SANK1基因的克隆及生物信息学分析 | 第116-136页 |
| 前言 | 第117页 |
| 1 试验材料与方法 | 第117-123页 |
| 1.1 试验材料 | 第117-119页 |
| 1.2 试验方法 | 第119-123页 |
| 2 试验结果 | 第123-133页 |
| 2.1 RT-PCR扩增猪sANK1基因部分ORF区 | 第123页 |
| 2.2 5'和3'的cDNA末端快速扩增ANK1基因及序列分析 | 第123-127页 |
| 2.3 猪sANK1基因全长cDNA克隆及序列分析 | 第127-128页 |
| 2.4 miR-486与ANK1的基因定位 | 第128-129页 |
| 2.5 猪sANK1蛋白ORF的预测及可变剪接体模式的构建 | 第129-130页 |
| 2.6 sANK1基因同源性比对和进化树分析 | 第130-132页 |
| 2.7 生物信息学分析 | 第132-133页 |
| 3 分析与讨论 | 第133-135页 |
| 3.1 猪sANK1基因序列及可变剪接体分析 | 第133-134页 |
| 3.2 猪sANK1基因的生物信息学分析 | 第134-135页 |
| 4 小结 | 第135-136页 |
| 第六章 MIR-486与宿主基因SANK1的表达相关性及其启动子功能的研究 | 第136-161页 |
| 前言 | 第137-138页 |
| 1 试验材料与方法 | 第138-145页 |
| 1.1 试验材料 | 第138-140页 |
| 1.2 试验方法 | 第140-145页 |
| 2 试验结果 | 第145-156页 |
| 2.1 猪miR-486与sANK-1表达相关性研究 | 第145-148页 |
| 2.2 猪miR-486/sANK1基因启动子SNP和生物信息学分析 | 第148-153页 |
| 2.3 巴马小型猪和长白猪sANK1基因启动子活性分析 | 第153-156页 |
| 3 分析与讨论 | 第156-159页 |
| 3.1 猪miR-486与宿主基因sANK1基因的表达相关性分析 | 第156-157页 |
| 3.2 巴马小型猪和长白猪miR-486/sANK1基因表达差异分析 | 第157-158页 |
| 3.3 猪miR-486/sANK1基因启动子的SNP与生物信息学分析 | 第158-159页 |
| 3.4 猪miR-486/sANK1基因启动子活性分析 | 第159页 |
| 4 小结 | 第159-161页 |
| 第七章 MIR-486在猪骨骼肌发育中调控IGF-1-PI3K/AKT-MTOR通路的作用 | 第161-187页 |
| 前言 | 第162-163页 |
| 1 试验材料与方法 | 第163-167页 |
| 1.1 试验材料 | 第163-166页 |
| 1.2 试验方法 | 第166-167页 |
| 2 试验结果 | 第167-181页 |
| 2.1 miR-486同源性分析及靶基因预测 | 第167-170页 |
| 2.2 猪p85α基因CDS序列的克隆及生物信息学分析 | 第170-172页 |
| 2.3 IGF-1-PI3K/AKT-mTOR通路相关基因片段的克隆 | 第172-173页 |
| 2.4 IGF-1-PI3K/AKT-mTOR通路相关基因在猪背最长肌中的表达差异 | 第173-174页 |
| 2.5 IGF-1-PI3K/AKT-mTOR通路相关基因在猪背最长肌中的表达规律 | 第174-177页 |
| 2.6 miR-486在IGF-1-PI3K/AKT-mTOR通路中的作用 | 第177-181页 |
| 3 分析与讨论 | 第181-186页 |
| 3.1 miR-486调控IGF-1-PI3K/AKT-mTOR通路的选择 | 第181-182页 |
| 3.2 猪p85α基因的生物信息分析 | 第182页 |
| 3.3 IGF-1-PI3K/AKT-mTOR通路基因在猪背最长肌中的表达分析 | 第182-183页 |
| 3.4 猪背最长肌IGF-1-PI3K/AKT-mTOR通路关键基因的发育性变化及品种差异分析 | 第183-185页 |
| 3.5 miR-486对IGF-I-PI3K/AKT-mTOR信号通路的作用 | 第185-186页 |
| 4 小结 | 第186-187页 |
| 全文总结 | 第187-188页 |
| 参考文献 | 第188-205页 |
| 附录 | 第205-233页 |
| 致谢 | 第233-234页 |
| 攻读博士学位期间发表的论文 | 第234页 |
