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巨大芽孢杆菌N6谷氨酰胺合成酶酶学性质的研究和改良

摘要第8-10页
Abstract第10-11页
缩略语表(Abbreviations)第12-13页
1 前言第13-21页
    1.1 谷氨酰胺合成酶(glutamine synthetase,GS)第13页
    1.2 微生物谷氨酰胺合成酶的结构和作用机制第13-15页
        1.2.1 微生物谷氨酰胺合成酶的结构第13-14页
        1.2.2 微生物谷氨酰胺合成酶的作用机制第14-15页
    1.3 谷氨酰胺合成酶的研究热点第15-16页
    1.4 谷氨酰胺合成酶的应用第16-19页
        1.4.1 利用谷氨酰胺合成酶合成谷氨酰胺第16-17页
        1.4.2 谷氨酰胺合成酶在转基因植物方面的应用第17-18页
        1.4.3 谷氨酰胺合成酶催化合成茶氨酸第18-19页
    1.5 常用的蛋白质的改造策略第19-20页
        1.5.1 蛋白质的定向进化第19页
        1.5.2 蛋白质的理性设计第19-20页
    1.6 研究的目的和意义第20-21页
2 材料和方法第21-44页
    2.1 材料第21-27页
        2.1.1 质粒与菌株第21-22页
        2.1.2 试剂第22页
        2.1.3 培养基第22页
        2.1.4 实验相关溶液第22-25页
        2.1.5 仪器设备第25-26页
        2.1.6 PCR引物第26-27页
    2.2 BGS基因的获得方法第27-32页
        2.2.1 含GS的菌株的筛选第27页
        2.2.2 GS转移酶活性测定第27页
        2.2.3 BGS基因的克隆第27-29页
            2.2.3.1 细菌基因组DNA的提取第27-28页
            2.2.3.2 扩增 16SrDNA序列第28页
            2.2.3.3 PCR扩增BGS基因第28-29页
        2.2.4 PCR产物纯化、回收与酶切第29-30页
        2.2.5 快速抽提细菌的质粒DNA第30页
        2.2.6 碱裂解抽提细菌的质粒DNA第30-31页
        2.2.7 构建pGEX-6p-BGS重组表达载体第31页
        2.2.8 大肠杆菌感受态的制备第31页
        2.2.9 电转化第31-32页
        2.2.10 检测阳性克隆子第32页
    2.3 BGS的表达与纯化第32-35页
        2.3.1 感受态的制备第32页
        2.3.2 BGS的诱导表达第32-33页
        2.3.3 SDS-PAGE凝胶的配制第33-34页
        2.3.4 BGS蛋白的纯化第34页
        2.3.5 蛋白浓度测定第34-35页
    2.4 BGS的酶学性质第35-37页
        2.4.1 标准曲线的绘制第35页
        2.4.2 BGS的最适反应温度第35-36页
        2.4.3 谷氨酰胺合成酶的最适pH第36页
        2.4.4 BGS的温度耐受第36页
        2.4.5 BGS的pH耐受第36页
        2.4.6 金属离子和不同化学试剂对BGS的影响第36页
        2.4.7 酶动力学性质的测定第36-37页
    2.5 BGS的突变体的构建第37-42页
        2.5.1 随机突变文库的构建第37-38页
            2.5.1.1 易错PCR扩增BGS基因第37页
            2.5.1.2 易错PCR产物的纯化、酶切与回收第37-38页
            2.5.1.3 pGEX-6p-1 重组载体的构建第38页
            2.5.1.4 突变库插入率的检测第38页
            2.5.1.5 随机突变文库的筛选第38页
        2.5.2 定点突变突变位点的设计第38-39页
            2.5.2.1 BGS的蛋白质多序列比对第38-39页
            2.5.2.2 BGS的同源建模与分子对接第39页
        2.5.3 定点突变引物的设计第39-40页
        2.5.4 突变体的构建第40-41页
        2.5.5 突变体菌株的表达与活性检测第41页
        2.5.6 突变体的蛋白的纯化与浓度测定第41页
        2.5.7 突变体的酶学性质测定第41-42页
    2.6 野生型与突变体BGS产茶氨酸的定性与定量第42-43页
        2.6.1 BGS产茶氨酸的定性第42页
        2.6.2 BGS产茶氨酸的定量第42-43页
            2.6.2.1 茶氨酸标曲第42页
            2.6.2.2 茶氨酸的定量第42-43页
    2.7 突变体蛋白的结构模拟与分析第43-44页
3 结果与分析第44-71页
    3.1 筛选目标菌株第44页
    3.2 目的基因的克隆第44-47页
        3.2.1 总DNA的提取第44页
        3.2.2 目标菌株的菌种鉴定第44-45页
        3.2.3 扩增BGS第45-46页
        3.2.4 构建重组质粒第46-47页
    3.3 BGS的表达和纯化第47-48页
    3.4 BGS的酶学性质分析第48-53页
        3.4.1 产物标准曲线的绘制第48-49页
        3.4.2 最适温度和温度耐受的测定第49-50页
        3.4.3 最适pH和pH耐受的测定第50-51页
        3.4.4 金属离子对BGS活性的影响第51-52页
        3.4.5 化学试剂对BGS活性的影响第52页
        3.4.6 BGS酶动力学常数的测定第52-53页
        3.4.7 BGS产茶氨酸的验证第53页
    3.5 突变体的获得第53-67页
        3.5.1 随机突变第53-56页
            3.5.1.1 易错PCR的结果第54页
            3.5.1.2 插入率检测第54-55页
            3.5.1.3 突变情况检测第55-56页
            3.5.1.4 筛选结果第56页
        3.5.2 定点突变第56-57页
            3.5.2.1 选择突变位点第56-57页
            3.5.2.2 突变体的构建第57页
            3.5.2.3 表达与检测突变体的活性第57页
        3.5.3 复合突变与回复突变第57-58页
        3.5.4 突变体蛋白的纯化第58-59页
        3.5.5 突变体酶学性质的研究第59-67页
            3.5.5.1 最适温度与温度耐受第60页
            3.5.5.2 最适pH和pH稳定性第60-61页
            3.5.5.3 金属离子对突变体活性的影响第61-63页
            3.5.5.4 化学试剂对突变体活性的影响第63-65页
            3.5.5.5 所有突变体酶动力学常数的测定第65-67页
    3.6 野生型和突变体茶氨酸产量的测定第67-69页
        3.6.1 茶氨酸标曲第67-68页
        3.6.2 酵母联合发酵茶氨酸的产量第68-69页
    3.7 突变体蛋白的结构模拟结果第69-71页
4 总结与讨论第71-73页
    4.1 野生型与突变体酶学性质的变化第71页
    4.2 突变体酶学性质变化的结构模拟分析第71-73页
参考文献第73-78页
附录第78-79页
致谢第79页

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