摘要 | 第4-7页 |
ABSTRACT | 第7-10页 |
英文缩写词表 | 第15-17页 |
第一章 绪论 | 第17-74页 |
1.1 生物材料及其生物相容性研究概况 | 第17-23页 |
1.1.1 生物材料概述 | 第17页 |
1.1.2 生物材料的生物相容性 | 第17-23页 |
1.2 纳米生物材料生物相容性研究 | 第23-26页 |
1.3 金属及金属氧化物纳米粒子毒性研究 | 第26-27页 |
1.4 纳米银的生物相容性研究 | 第27-33页 |
1.4.1 纳米银的制备 | 第27-28页 |
1.4.2 纳米银的应用 | 第28-29页 |
1.4.3 纳米银的生物相容性研究 | 第29-33页 |
1.5 蛋白质组学技术在生物相容性研究中的应用 | 第33-46页 |
1.5.1 蛋白质组学简介 | 第33-34页 |
1.5.2 蛋白质组学技术简介 | 第34-42页 |
1.5.3 蛋白质组学实验结果的生物信息学分析 | 第42-44页 |
1.5.4 蛋白质组学技术在生物材料生物相容性研究中的应用 | 第44-46页 |
1.6 microRNA高通量分析技术在生物材料生物相容性研究中的应用 | 第46-53页 |
1.6.1 microRNA简介 | 第46-48页 |
1.6.2 microRNA的检测方法 | 第48-50页 |
1.6.3 microRNA靶基因的研究方法 | 第50-52页 |
1.6.4 microRNA高通量分析技术在生物相容性研究中的应用 | 第52-53页 |
1.7 生物相容性研究中多种生物组学数据的联合分析 | 第53-55页 |
1.8 生物组学实验结果的验证方法 | 第55-58页 |
1.9 本论文的工作基础和研究内容 | 第58-60页 |
1.10 参考文献 | 第60-74页 |
第二章 纳米银的制备和表征 | 第74-81页 |
2.1 纳米银制备方法的选取 | 第74页 |
2.2 纳米银尺寸的确定 | 第74-75页 |
2.3 纳米银的制备与表征 | 第75-77页 |
2.3.1 实验材料和仪器 | 第75页 |
2.3.2 纳米银的制备 | 第75-76页 |
2.3.3 纳米银的表征 | 第76-77页 |
2.4 实验结果与讨论 | 第77-80页 |
2.4.1 去离子水和二蒸水溶剂中纳米银的制备结果 | 第77-79页 |
2.4.2 平均粒径20 nm的纳米银制备结果 | 第79-80页 |
2.5 本章小结 | 第80页 |
2.6 参考文献 | 第80-81页 |
第三章 纳米银与人皮肤成纤维细胞作用的细胞水平研究 | 第81-102页 |
3.1 纳米银细胞毒性评价 | 第81-94页 |
3.1.1 实验目的 | 第82页 |
3.1.2 实验材料和仪器 | 第82-83页 |
3.1.3 主要溶液的配制 | 第83-84页 |
3.1.4 不同浓度20nm纳米银对细胞增殖的影响 | 第84-87页 |
3.1.5 200μM纳米银作用细胞1、4、8h的细胞毒性评价 | 第87-88页 |
3.1.6 实验结果和讨论 | 第88-94页 |
3.2 纳米银对细胞周期和细胞凋亡的影响 | 第94-98页 |
3.3 纳米银在细胞中的摄取 | 第98-100页 |
3.4 本章小结 | 第100页 |
3.5 参考文献 | 第100-102页 |
第四章 纳米银与人皮肤成纤维细胞作用的蛋白质组学研究 | 第102-164页 |
4.1 二维差异凝胶电泳(2D-DIGE)实验 | 第102-109页 |
4.1.1 2D-DIGE实验材料和仪器 | 第102页 |
4.1.2 2D-DIGE实验方法 | 第102-104页 |
4.1.3 实验结果与讨论 | 第104-109页 |
4.2 质谱鉴定实验 | 第109-114页 |
4.2.1 质谱鉴定实验原理 | 第109-111页 |
4.2.2 质谱鉴定实验方法 | 第111页 |
4.2.3 质谱鉴定结果 | 第111-114页 |
4.3 差异表达蛋白质的生物信息学分析 | 第114-158页 |
4.3.1 聚类分析 | 第114-115页 |
4.3.2 Gene Ontology(GO)功能分类分析 | 第115-130页 |
4.3.3 生物学通路分析 | 第130-153页 |
4.3.4 蛋白质-蛋白质相互作用网络分析 | 第153-158页 |
4.4 本章小结 | 第158页 |
4.5 参考文献 | 第158-164页 |
第五章 纳米银与人皮肤成纤维细胞作用的microRNA测序研究 | 第164-194页 |
5.1 microRNA测序实验样品的制备 | 第164-165页 |
5.1.1 实验材料 | 第164页 |
5.1.2 实验仪器 | 第164页 |
5.1.3 细胞培养和处理 | 第164-165页 |
5.1.4 microRNA的提取 | 第165页 |
5.2 SOLiD测序实验 | 第165-170页 |
5.2.1 实验方法 | 第165页 |
5.2.2 实验结果与讨论 | 第165-170页 |
5.3 microRNA靶基因预测 | 第170-171页 |
5.3.1 分析方法 | 第170-171页 |
5.3.2 结果与讨论 | 第171页 |
5.4 microRNA靶基因的生物信息学分析 | 第171-180页 |
5.4.1 分析方法 | 第171页 |
5.4.2 结果与讨论 | 第171-180页 |
5.5 与氧化应激相关microRNA的筛选和分析 | 第180-190页 |
5.5.1 分析和实验方法 | 第180-182页 |
5.5.2 结果与讨论 | 第182-190页 |
5.6 本章小结 | 第190-191页 |
5.7 参考文献 | 第191-194页 |
第六章 纳米银与人皮肤成纤维细胞作用的生物组学实验结果的联合分析 | 第194-216页 |
6.1 纳米银作用细胞的蛋白质组学和转录组学实验结果的比较 | 第195-197页 |
6.1.1 基因和蛋白质表达数据的获取 | 第195页 |
6.1.2 基因和蛋白质表达数据的对比 | 第195-197页 |
6.2 基因、microRNA和蛋白质表达数据的联合分析 | 第197-212页 |
6.2.1 差异表达基因、microRNA和蛋白质涉及的GO功能类别的比较 | 第197页 |
6.2.2 差异表达基因、microRNA和蛋白质参与的生物学通路的比较 | 第197-199页 |
6.2.3 匹配microRNA靶基因/靶蛋白质的筛选和分析 | 第199-212页 |
6.3 本章小结 | 第212-213页 |
6.4 参考文献 | 第213-216页 |
第七章 纳米银生物组学实验结果的验证 | 第216-240页 |
7.1 蛋白质组学实验结果的Western blot验证 | 第216-220页 |
7.1.1 Western blot实验蛋白质的挑选原则 | 第216-218页 |
7.1.2 实验材料 | 第218页 |
7.1.3 实验方法 | 第218页 |
7.1.4 实验结果与讨论 | 第218-220页 |
7.2 microRNA测序实验结果的qRT-PCR验证 | 第220-227页 |
7.2.1 qRT-PCR实验microRNA的挑选原则 | 第220-221页 |
7.2.2 实验材料 | 第221页 |
7.2.3 实验仪器 | 第221-222页 |
7.2.4 qRT-PCR实验方法 | 第222-224页 |
7.2.5 结果与讨论 | 第224-227页 |
7.3 肌动蛋白细胞骨架观察 | 第227-230页 |
7.3.1 实验目的 | 第227页 |
7.3.2 实验材料 | 第227-228页 |
7.3.3 实验仪器 | 第228页 |
7.3.4 主要溶液配制 | 第228页 |
7.3.5 实验方法 | 第228-229页 |
7.3.6 实验结果与讨论 | 第229-230页 |
7.4 细胞内ATP水平测定 | 第230-234页 |
7.4.1 实验目的 | 第230-231页 |
7.4.2 实验材料 | 第231页 |
7.4.3 实验仪器 | 第231页 |
7.4.4 实验方法 | 第231-233页 |
7.4.5 实验结果与讨论 | 第233-234页 |
7.5 细胞凋亡分析 | 第234-237页 |
7.5.1 实验目的 | 第234页 |
7.5.2 实验材料 | 第234页 |
7.5.3 实验仪器 | 第234-235页 |
7.5.4 实验方法 | 第235页 |
7.5.5 实验结果和讨论 | 第235-237页 |
7.6 本章小结 | 第237-238页 |
7.7 参考文献 | 第238-240页 |
第八章 纳米金与人皮肤成纤维细胞作用的microRNA测序研究和生物组学实验结果的联合分析 | 第240-261页 |
8.1 纳米金与人皮肤成纤维细胞作用的microRNA测序实验 | 第240-248页 |
8.1.1 实验材料 | 第240-241页 |
8.1.2 实验仪器 | 第241页 |
8.1.3 实验方法 | 第241-243页 |
8.1.4 实验结果与讨论 | 第243-248页 |
8.2 纳米金作用人皮肤成纤维细胞后基因、microRNA与蛋白质表达数据的联合分析 | 第248-258页 |
8.2.1 差异表达基因、microRNA和蛋白质涉及的GO功能类别的比较 | 第249页 |
8.2.2 差异表达基因、microRNA和蛋白质参与的生物学通路的比较 | 第249-251页 |
8.2.3 匹配microRNA靶基因/靶蛋白质的筛选和分析 | 第251-258页 |
8.3 本章小结 | 第258-259页 |
8.4 参考文献 | 第259-261页 |
第九章 纳米银、纳米金与人皮肤成纤维细胞作用机制的比较 | 第261-272页 |
9.1 纳米银、金与人皮肤成纤维细胞作用的细胞学实验结果的比较 | 第261-262页 |
9.2 纳米银、金与人皮肤成纤维细胞作用的蛋白质组学实验结果的比较 | 第262-265页 |
9.2.1 差异表达蛋白质的比较 | 第262页 |
9.2.2 差异表达蛋白质生物信息学分析结果的比较 | 第262-265页 |
9.3 纳米银与纳米金microRNA测序实验结果的比较 | 第265-270页 |
9.3.1 差异表达microRNA及匹配到的靶基因/靶蛋白质的比较 | 第265-266页 |
9.3.2 匹配靶基因/靶蛋白质功能分类分析结果的比较 | 第266-267页 |
9.3.3 匹配靶基因/靶蛋白质生物学通路分析结果的比较 | 第267-270页 |
9.4 本章小结 | 第270-271页 |
9.5 参考文献 | 第271-272页 |
第十章 总结和展望 | 第272-277页 |
10.1 全文总结 | 第272-273页 |
10.2 展望 | 第273-274页 |
10.3 本论文的创新点 | 第274-277页 |
在校期间发表论文情况 | 第277-281页 |
致谢 | 第281-282页 |
附录 | 第282-288页 |
附录1 细胞蛋白质的二维凝胶电泳实验(上海中科新生命生物公司提供) | 第282页 |
附录2 2D-DIGE实验方法(由上海中科新生命生物科技有限公司提供) | 第282-283页 |
附录3 质谱实验方法(由上海中科新生命生物科技有限公司提供) | 第283-285页 |
附录4 Western blot实验方法(由上海康成生物工程公司提供) | 第285-288页 |