| 摘要 | 第6-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 缩略词表 | 第9-10页 |
| 1. 前言 | 第10-18页 |
| 1.1 植物中的GRP蛋白 | 第10-11页 |
| 1.2 植物中的RBP蛋白 | 第11-12页 |
| 1.3 RB-GRP基因家族 | 第12-16页 |
| 1.3.1 RB-GRP基因家族的分类 | 第12页 |
| 1.3.2 RB-GRP基因家族的功能 | 第12-16页 |
| 1.4 棉花基因组测序 | 第16-17页 |
| 1.5 本研究的目的和意义 | 第17-18页 |
| 2. 材料与方法 | 第18-21页 |
| 2.1 数据来源 | 第18页 |
| 2.2 实验材料 | 第18页 |
| 2.3 生物信息学分析 | 第18-20页 |
| 2.3.1 隐马尔科夫模型的使用以及家族基因的鉴定 | 第18页 |
| 2.3.2 基因家族的分类和命名 | 第18-19页 |
| 2.3.3 基因在染色体上的物理分布 | 第19页 |
| 2.3.4 系统进化树的构建 | 第19页 |
| 2.3.5 intro/exon比较分析 | 第19页 |
| 2.3.6 共线性分析 | 第19-20页 |
| 2.3.7 Ka/ks值计算 | 第20页 |
| 2.4 表达量分析 | 第20-21页 |
| 2.4.1 不同胁迫条件下材料处理 | 第20页 |
| 2.4.2 RNA提取以及反转录实验 | 第20页 |
| 2.4.3 PCR相关 | 第20-21页 |
| 3. 结果和分析 | 第21-37页 |
| 3.1 亚洲棉和雷蒙德氏棉RB-GRP基因家族的全基因组分析 | 第21-32页 |
| 3.1.1 亚洲棉和雷蒙德氏棉RB-GRP家族基因的鉴定 | 第21-22页 |
| 3.1.2 亚洲棉和雷蒙德氏棉中RB-GRP家族基因的染色体分布 | 第22-23页 |
| 3.1.3 系统进化树分析 | 第23-25页 |
| 3.1.4 鉴别直系同源基因和旁系同源基因 | 第25-28页 |
| 3.1.5 亚洲棉和雷蒙德氏棉基因组中RB-GRP基因结构分析 | 第28-29页 |
| 3.1.6 RB-GRP家族基因在亚洲棉和雷蒙德氏棉基因组的共线性分析 | 第29-31页 |
| 3.1.7 亚洲棉和雷蒙德氏棉中RB-GRP直系同源基因的选择压力分析 | 第31-32页 |
| 3.2 不同胁迫条件下表达量分析 | 第32-37页 |
| 3.2.1 ABA处理下的亚洲棉和雷蒙德氏棉RB-GRP基因的表达差异 | 第32-34页 |
| 3.2.2 NaCl处理下的亚洲棉和雷蒙德氏棉RB-GRP基因的表达差异 | 第34-35页 |
| 3.2.3 PEG处理下的亚洲棉和雷蒙德氏棉RB-GRP基因的表达差异 | 第35-37页 |
| 4 讨论 | 第37-45页 |
| 4.1 亚洲棉和雷蒙德氏棉中的RRM型和CSD型RB-GRP基因 | 第37-38页 |
| 4.2 亚洲棉和雷蒙德氏棉RB-GRP家族基因的扩增模式 | 第38-40页 |
| 4.3 亚洲棉和雷蒙德氏棉RB-GRP家族基因的进化分析 | 第40-41页 |
| 4.4 亚洲棉与雷蒙德氏棉RB-GRP家族基因在不同的应激力下表达量的差异 | 第41-43页 |
| 4.5 亚洲棉和雷蒙德氏棉RB-GRP直系同源基因与旁系同源基因的表达分析 | 第43-45页 |
| 参考文献 | 第45-53页 |
| 致谢 | 第53-54页 |
| 附录 | 第54-59页 |
