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芳香烃受体—配基互作模式的分子动力学模拟

摘要第6-7页
Abstract第7-8页
第1章 绪论第11-25页
    1.1 AhR的结构与功能第11-13页
    1.2 AhR作为人类疾病治疗的靶标第13-14页
    1.3 AhR配体第14-18页
        1.3.1 AhR合成配体第14-15页
        1.3.2 AhR内源性和天然配体第15-18页
    1.4 AhR物种特异性和突变研究第18-22页
    1.5 课题研究目的、意义和内容第22-25页
        1.5.1 本课题的研究目的和意义第22页
        1.5.2 本课题的研究内容第22-24页
        1.5.3 本课题创新点第24-25页
第2章 分子动力学模拟残基突变对芳香烃受体配体结合区的影响第25-44页
    2.1 材料与方法第25-28页
        2.1.1 结构准备第25页
        2.1.2 同源建模和分子对接第25-26页
        2.1.3 分子动力学模拟第26-27页
        2.1.4 数据分析方法第27-28页
    2.2 结果与分析第28-42页
        2.2.1 AhR LBD结合模式和突变稳定性分析第28-32页
        2.2.2 残基突变对蛋白结构变化分析第32-35页
        2.2.3 残基突变结合腔变化分析第35-37页
        2.2.4 残基突变与配体结合自由能分析第37-40页
        2.2.5 318位点Phe突变成Ala分析第40-42页
    2.3 讨论第42页
    2.4 本章小结第42-44页
第3章 分子动力学模拟研究不同配体与芳香烃受体结合模式的变化第44-59页
    3.1 材料与方法第44-45页
        3.1.1 结构准备与分子动力学模拟第44页
        3.1.2 体积计算第44-45页
        3.1.3 数据分析方法第45页
    3.2 结果与分析第45-57页
        3.2.1 AhR PAS B与配体结合模式分析第45-48页
        3.2.2 AhR PAS B与配体结合自由能变化分析第48-50页
        3.2.3 AhR PAS B与配体结合后结构变化分析第50-52页
        3.2.4 AhR PAS B与配体结合后体积变化分析第52-54页
        3.2.5 基于优化模型的柔性筛选第54-57页
    3.3 讨论第57页
    3.4 本章小结第57-59页
结论第59-60页
致谢第60-61页
参考文献第61-71页
攻读硕士学位期间发表的学术论文第71页

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