| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 引言 | 第11-12页 |
| 1 文献综述 | 第12-22页 |
| 1.1 植物芽休眠及其调控机制研究进展 | 第12-16页 |
| 1.1.1 植物芽休眠的类型及休眠状态的确定 | 第12-13页 |
| 1.1.2 芽休眠调控的生理机制研究进展 | 第13-15页 |
| 1.1.2.1 物质与能量代谢 | 第13-14页 |
| 1.1.2.2 激素代谢 | 第14页 |
| 1.1.2.3 抗氧化代谢 | 第14页 |
| 1.1.2.4 水分代谢 | 第14-15页 |
| 1.1.3 芽休眠调控的分子机制研究进展 | 第15-16页 |
| 1.2 DNA甲基化的MSAP分析技术及在芽休眠研究中的应用 | 第16-17页 |
| 1.3 转录组测序技术(RNA-seq)及在芽休眠研究中的应用 | 第17-19页 |
| 1.4 蓝莓生态习性及设施栽培 | 第19-20页 |
| 1.5 研究目的及意义 | 第20-22页 |
| 2 蓝莓花芽休眠与解除过程中生理生化变化 | 第22-35页 |
| 2.1 实验材料与试剂 | 第22-24页 |
| 2.1.1 实验材料 | 第22页 |
| 2.1.2 实验试剂 | 第22页 |
| 2.1.3 实验仪器 | 第22-23页 |
| 2.1.4 试剂配制 | 第23-24页 |
| 2.2 实验方法 | 第24-28页 |
| 2.2.1 萌芽率统计 | 第24页 |
| 2.2.2 可溶性糖含量测定 | 第24-25页 |
| 2.2.3 可溶性蛋白含量测定 | 第25-26页 |
| 2.2.4 脯氨酸含量的测定 | 第26-27页 |
| 2.2.5 抗氧化酶活性测定 | 第27-28页 |
| 2.3 实验结果 | 第28-33页 |
| 2.3.1 蓝莓休眠进程的确定 | 第28-29页 |
| 2.3.2 休眠过程中可溶性糖含量的变化 | 第29-30页 |
| 2.3.3 休眠过程中可溶性蛋白含量的变化 | 第30-31页 |
| 2.3.4 休眠过程中脯氨酸含量的变化 | 第31页 |
| 2.3.5 休眠过程中SOD POD活性的变化 | 第31-33页 |
| 2.4 讨论 | 第33-34页 |
| 2.5 小结 | 第34-35页 |
| 3 蓝莓不同休眠状态花芽基因组DNA的MSAP分析 | 第35-48页 |
| 3.1 实验材料与试剂 | 第35-37页 |
| 3.1.1 实验材料 | 第35-36页 |
| 3.1.2 实验试剂 | 第36-37页 |
| 3.1.3 实验仪器 | 第37页 |
| 3.1.4 试剂配制 | 第37页 |
| 3.2 实验方法 | 第37-40页 |
| 3.2.1 蓝莓花芽基因组DNA提取 | 第37-38页 |
| 3.2.2 蓝莓基因组DNA甲基化MSAP分析 | 第38-40页 |
| 3.3 结果与分析 | 第40-46页 |
| 3.3.1 蓝莓花芽DNA质量检测及酶切结果 | 第40-41页 |
| 3.3.2 MSAP预扩增反应 | 第41-42页 |
| 3.3.3 MSAP选择性扩增反应 | 第42-43页 |
| 3.3.4 内休眠及解除休眠花芽DNA甲基化水平变化分析 | 第43-44页 |
| 3.3.5 内休眠及解除休眠蓝莓花芽DNA甲基化模式变化分析 | 第44-46页 |
| 3.4 讨论 | 第46-47页 |
| 3.5 小结 | 第47-48页 |
| 4 蓝莓花芽休眠期间转录组分析 | 第48-68页 |
| 4.1 实验材料与试剂 | 第48-49页 |
| 4.1.1 实验材料 | 第48页 |
| 4.1.2 实验试剂 | 第48页 |
| 4.1.3 实验仪器 | 第48-49页 |
| 4.2 实验方法 | 第49-55页 |
| 4.2.1 文库构建材料选取 | 第49页 |
| 4.2.2 总RNA提取与检测 | 第49-50页 |
| 4.2.3 cDNA的合成与文库构建 | 第50-51页 |
| 4.2.4 测序数据过滤 | 第51页 |
| 4.2.5 转录本拼接 | 第51页 |
| 4.2.6 基因功能注释 | 第51页 |
| 4.2.7 单核苷酸多态性分析 | 第51页 |
| 4.2.8 SSR分析 | 第51-52页 |
| 4.2.9 基因表达水平分析 | 第52页 |
| 4.2.10 差异表达分析 | 第52页 |
| 4.2.11 差异基因GO富集分析 | 第52页 |
| 4.2.12 差异基因KEGG富集分析 | 第52-53页 |
| 4.2.13 差异基因的筛选与验证 | 第53-55页 |
| 4.3 实验结果 | 第55-66页 |
| 4.3.1 总RNA的提取与检测结果 | 第55-56页 |
| 4.3.2 转录组测序数据及质量 | 第56-57页 |
| 4.3.3 转录本的注释及分类分析 | 第57-60页 |
| 4.3.4 单核苷酸多态性分析 | 第60-61页 |
| 4.3.5 SSR分析 | 第61-62页 |
| 4.3.6 差异表达转录本筛选及富集分析 | 第62-64页 |
| 4.3.7 差异基因的表达分析 | 第64-66页 |
| 4.4 讨论 | 第66-67页 |
| 4.5 小结 | 第67-68页 |
| 5 蓝莓休眠相关MADS-box基因克隆与表达分析 | 第68-84页 |
| 5.1 实验材料与试剂 | 第68-69页 |
| 5.1.1 实验材料 | 第68页 |
| 5.1.2 实验试剂 | 第68-69页 |
| 5.1.3 实验仪器 | 第69页 |
| 5.2 实验方法 | 第69-75页 |
| 5.2.1 RNA的提取 | 第69-70页 |
| 5.2.2 同源片段获取 | 第70-71页 |
| 5.2.3 3'RACE反应 | 第71-73页 |
| 5.2.4 5'RACE反应 | 第73-74页 |
| 5.2.5 RACE序列验证 | 第74-75页 |
| 5.2.6 基因实时荧光定量PCR检测 | 第75页 |
| 5.3 实验结果 | 第75-82页 |
| 5.3.1 蓝莓MADS-box基因克隆 | 第75-78页 |
| 5.3.2 蓝莓MADS-box基因VcDAM1序列分析 | 第78-79页 |
| 5.3.3 VcDAM1基因在蓝莓花芽中的表达特性分析 | 第79-82页 |
| 5.4 讨论 | 第82-83页 |
| 5.5 小结 | 第83-84页 |
| 结论 | 第84-85页 |
| 参考文献 | 第85-92页 |
| 附录A 差异基因的筛选算法 | 第92-94页 |
| 附录B 内参基因及差异表达基因标准曲线、扩增曲线、溶解曲线 | 第94-97页 |
| 附录C 转录组分析软件汇总 | 第97-98页 |
| 攻读硕士学位期间发表学术论文情况 | 第98-99页 |
| 致谢 | 第99-100页 |
