木材基因数据库的建设
| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6页 |
| 第一章 引言 | 第9-22页 |
| 1.1 基因组学概述 | 第9-15页 |
| 1.1.1 DNA,基因,染色体和基因组 | 第9页 |
| 1.1.2 测序技术 | 第9-12页 |
| 1.1.3 植物基因组 | 第12-13页 |
| 1.1.4 木材与基因组 | 第13-15页 |
| 1.2 数据库概述 | 第15-19页 |
| 1.2.1 基因组数据库简介 | 第15-16页 |
| 1.2.2 基因组数据库的分类 | 第16-17页 |
| 1.2.3 基因组数据库的分析软件 | 第17-19页 |
| 1.3 研究的目的和意义 | 第19-22页 |
| 第二章 材料和方法 | 第22-41页 |
| 2.1 木材形成相关基因的预测 | 第22-32页 |
| 2.1.1 基因组数据下载 | 第22-25页 |
| 2.1.2 基因组数据提取和过滤 | 第25页 |
| 2.1.3 木材形成相关基因的下载 | 第25-29页 |
| 2.1.4 蛋白结构域信息的整理和下载 | 第29页 |
| 2.1.5 BLAST的下载和安装 | 第29页 |
| 2.1.6 HMMER的下载和安装 | 第29-30页 |
| 2.1.7 初步的BLAST | 第30页 |
| 2.1.8 进一步的BLAST和筛选 | 第30-31页 |
| 2.1.9 蛋白结构域的验证 | 第31页 |
| 2.1.10 最终结果的整理和序列的提取 | 第31-32页 |
| 2.2 木材形成数据库的建设 | 第32-41页 |
| 2.2.1 网页服务器的硬件以及软件平台的搭建 | 第32页 |
| 2.2.2 数据库创建和数据的导入 | 第32-36页 |
| 2.2.3 数据库网页构建 | 第36-41页 |
| 第三章 结果 | 第41-51页 |
| 3.1 数据库的数据统计 | 第41-43页 |
| 3.2 数据库页面 | 第43-47页 |
| 3.2.1 数据库首页 | 第43页 |
| 3.2.2 检索及其页面 | 第43-47页 |
| 3.2.2.1 信息检索 | 第44-45页 |
| 3.2.2.2 基因检索以及快速检索 | 第45-47页 |
| 3.3 数据库的后续分析功能 | 第47-50页 |
| 3.4 BLAST搜索 | 第50-51页 |
| 第四章 讨论与展望 | 第51-55页 |
| 4.1 木材基因数据库与现有数据库的比较 | 第51-53页 |
| 4.2 数据库的总结与展望 | 第53-55页 |
| 参考文献 | 第55-60页 |
| 在学期间的研究成果 | 第60-61页 |
| 致谢 | 第61页 |
